TaqMan检测方法——5个有趣事实

1. Pac-ManTM 到TaqMan

最初,Applied Biosystems™ TaqMan™检测方法(Assays)是以1980年代的吃豆人™电子游戏命名的。吃豆人这款游戏由日本电子游戏设计师岩谷彻(Toru Iwatani)创作,并在引入美国后变得极为流行。描述 TaqMan 技术的原始论文,作者注意到外切酶活性与Taq聚合酶与吃豆人游戏有相似之处。当Taq聚合酶遇到探针时,在合成新的扩增子过程中会将其“咬碎”;这导致探针中的报告分子和淬灭分子被物理分离。因此,荧光信号会随着产物的倍增而成比例增加。

2. TaqMan 检测试剂涵盖多种应用领域

赛默飞世尔科技是 TaqMan 检测试剂的市场领导者,这些试剂涵盖了包括基因和 miRNA 表达分析、SNP 基因分型、拷贝数变异分析以及稀有突变检测在内的多种应用。它们采用高度复杂的寡核苷酸探针/引物设计流程,包括强大的引物设计算法以及广泛的生物信息学工具和流程,实现检测方案设计的自动化。

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3. TaqMan探针设计

TaqMan探针旨在实现或接近100%的反应效率,并采用专有的探针(MGB-NFQ)以提高特异性。

所有TaqMan探针都包含三个组成部分:

TaqMan Assays diagram and informational breakdown of their components and how they work.
  • 5’端:荧光报告染料
  • 3’端:非荧光猝灭剂(NFQ)
  • 同样在3’端(与NFQ连接):次沟结合剂(MGB)

5′端的荧光报告染料由qPCR仪器检测,用于定量样品中扩增产物的数量。当聚合酶遇到TaqMan探针时,其5′核酸酶活性会切割探针,使染料与猝灭剂分离。每一个PCR循环,更多的染料分子被释放,导致荧光强度随扩增产物合成量增加而增强。

3′端的NFQ会猝灭5′端的荧光报告染料,直到通过外切酶活性将其分离为止Taq聚合酶。使用NFQ代替荧光猝灭剂能够提高检测的灵敏度,因为它提供了更高的信噪比。

TaqMan探针上的NFQ能够最大限度地减少背景信号,而智能化的PCR引物和探针设计则最大化扩增效率,并允许高灵敏度和准确性,从而可靠地检测到10份或更少的目标分子。

MGB是一种小分子,可以紧密嵌入双链DNA的小沟中。MGB能够在不增加探针长度的情况下提高熔解温度(Tm),因此可以为难以设计的序列(如富含AT的序列)设计探针,使得跨外显子边界设计探针变得更加容易。

相关内容:视频 – TaqMan实时PCR检测方法如何工作——TaqMan检测背后的科学原理

4. 2000万条预设计TaqMan检测方法

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相关内容: TaqMan实时PCR检测

5. TaqMan检测已被超过200,000篇出版物引用

MIQE指南合规性

more than two hundred thousand publications cited

TaqMan探针MIQE指南作为可信来源被持续使用——已在超过200,000篇出版物中被引用。TaqMan探针符合MIQE指南(定量实时PCR实验发表的最低信息要求),Thermo Fisher提供所有必要的信息,确保您在发表实时PCR实验结果时能够遵循MIQE规范。

相关内容:: 视频 – 第28集:MIQE指南与TaqMan探针

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观看本文提及的视频

  1. TaqMan实时PCR检测方法的工作原理——Taq Talk 第4集
  2. 实时PCR(qPCR)检测设计技巧——Taq Talk 第6集
  3. 如何测量检测方法的PCR效率——Taq Talk 第8集
  4. 如何使用SYBR Green检测优化qPCR——Taq Talk 第21集
  5. MIQE指南与TaqMan检测方法——Taq Talk 第28集
  6. Applied Biosystems TaqMan 检测视频

仅供科研使用。不得用于诊断程序。© 2018, 2022 Thermo Fisher Scientific Inc. 保留所有权利。除非另有说明,所有商标均为Thermo Fisher Scientific及其子公司的财产。Pac-Man是Bandai Namco Entertainment, Inc.的商标。TaqMan是Roche Molecular Systems, Inc.的商标,经许可和授权使用。

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Written by:

Dana D'Amico

Science Writer, Thermo Fisher Scientific

Dana D'Amico is an award-winning science writer with more than a decade of experience bringing research stories to life. She holds a B.S. in biology from Allegheny College and an MFA in creative nonfiction writing from the University of Minnesota.

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