一次进样,两种答案:在Orbitrap质谱仪上推出Squad代谢组学

代谢组学研究人员常常不得不在两种强大但不同的方法之间做出选择。非靶向代谢组学非常适合于发现研究:它尽可能全面地检查代谢物,从而揭示此前未知的生物学信息。靶向代谢组学以精准为目标:它以高灵敏度和定量可信度测量一份已定义的代谢物清单。挑战在于,通常同时进行两者会增加时间成本、消耗更多样品,并可能引入不同工作流程之间的变异性。

Colorful 3D molecular structures and lab glassware in a vibrant scientific illustration.

为了解决这一问题,Thermo Fisher Scientific的研究人员开发了定量与发现(SQUAD)分析,如本技术说明中所示:定量与发现分析:在Orbitrap质谱仪上结合靶向与非靶向代谢组学的方法,这是一种混合策略,将靶向定量和非靶向发现结合在一次实验中。在实际操作中,SQUAD允许你利用由真实标准品和同位素标记内标建立的校准曲线,对预定义的代谢物面板进行定量,同时采集丰富的全扫描数据,以支持回溯挖掘和未知物鉴定。

该技术说明的一个核心主题是,结果的可靠性取决于实验设计和质量控制的水平。该流程强调校准策略、针对不同代谢物类别精心选择提取方法,以及巧妙使用空白样品、混合质控样品和系统适用性测试,以监控批次间仪器漂移、污染情况和数据重复性。

SQUAD 还被设计为可在不同的 Thermo Scientific Orbitrap 质谱仪上扩展。技术说明中指出Thermo Scientific Orbitrap Exploris 质谱仪可以使用基于 MS¹ 的 SQUAD 并支持进行极性切换,并可选配 tSIM/tMS² 提升靶向灵敏度,而Thermo Scientific Orbitrap Tribrid 质谱仪则可以将高分辨率 MS¹ 发现分析与快速离子阱 tMS² 定量分析相结合,并通过以下工具增强:Thermo Scientific AcquireX 智能数据采集和实时数据库检索(RTLS)。

最后,数据分析在软件中完成闭环:Thermo Scientific TraceFinder 软件用于靶向定量和Thermo Scientific Compound Discoverer 软件用于非靶向发现、注释和统计分析,让一次进样即可获得可靠的定量结果和新的生物学线索。

Written by:

Bioprocessing Staff

Read more Bioprocessing Staff