先进的图像分析功能,兼容多种生物成像技术

Thermo Scientific Amira 软件提供先进的工具(包括 AI),可对多种尺度和成像方式进行全面的数据分析。 它无缝整合了来自各种技术的数据,从而能够进行详细的多尺度研究。 这种多功能性使其能够精确分析复杂结构和关系,提高科学见解的深度和准确性。


冷冻电子断层扫描

冷冻透射电镜 (Cryo-TEM) 和冷冻电子断层扫描 (cryo-ET) 是尖端的低温成像技术,可提供细胞结构和蛋白质复合物在其天然状态下的高分辨率信息。 Amira 软件是一个功能强大、多模态的平台,专为 cryo-ET 和 cryo-TEM 的 3D 图像数据的可视化、处理和分析而设计。 它提供了一套全面的工具箱,包括基于 AI 的图像降噪、精确分割和快速纤丝分析,使研究人员能够将复杂的图像数据转化为见解。 Amira 软件利用 AI 对病毒颗粒和纳米载体的 cryo-TEM 图像进行半自动分析,显著加快药物开发过程,同时确保分析结果的可靠性和标准化。 Amira 软件具有符合人体工程学的手动标注和基于交叉对比的圆柱形模板匹配等功能,显著减少了数据分析所需的时间,使其成为细胞生物学家和制药研究人员深入了解细胞结构和功能的重要工具。

衣藻高尔基体 – cryo-ET 感谢来自德国 Martinsried 市马克斯普朗克生物化学研究所分子结构生物学系 Benjamin Engel 博士提供数据。

体积电子显微镜

体积电子显微镜(体积 EM)是一种变革性的成像技术,它使研究人员能够以纳米分辨率观察和分析细胞和组织的复杂 3D 超微结构。 Amira 软件提供操作简单且精确的工具,专门用于增强和分析所有常见成像模态的volumeEM 数据质量:阵列断层扫描、SBF-SEM 和 FIB-SEM。 此外,Thermo Scientific Volumescope 2 SEM 和 Amira 软件为这种方法提供了强大的组合。 从图像采集到图像分析的完全集成工作流程,可将图像无缝转换为定量信息。 Amira Live Tracker 可在数据采集过程中可视化和浏览3D图像数据,优化成像效果并自动进行 3D 体积重建。 导入的 3D 图像可在 Amira 软件中,通过基于 AI 的自动化工作流程进行进一步处理和分析。

 

Amira 软件可简化体积 EM 数据工作流程、增强数据分析、优化研究成果,助您获得更快、更准确的洞察。


"Amira 软件是可视化 SBF-SEM 和 FIB-SEM 图像的关键,让我们能够分析细胞器的 3D 形态。 通过标签分析选项,我们可以量化面积、体积、周长和长度等参数。 通过内置测量工具,我们可以量化面积、体积、周长和纵横比等参数。

Antentor Hinton 博士

Jr.

范德堡大学分子生理学与生物物理学系


关联电子显微镜

Amira 软件拥有强大的多模态数据处理和可视化架构,是研究人员整合不同成像模态数据的首选工具。 它可实现结构和功能信息在多个尺度上的无缝集成,并依托多平面工作区中灵活、精确的自动配准工具提供支持。 这使得研究人员能够使用成熟的多模态配准方法进行相关性研究,从而优化生命科学众多领域的工作流程。

小鼠间充质干细胞的 CLEM。 数据由捷克科学院生物技术研究所分子治疗实验室的 Jaromíra Kovářová 提供。 数据由 Marie Olšinová 和 Markéta Dalecká 在查理大学理学院 BIOCEV 的成像方法核心设施中采集。

光学显微镜

Amira 软件的先进可视化功能可从 2D 光学显微镜图像生成精细的 3D 重构图像,从而更深入地揭示生物样本的结构与功能。 该软件包含先进的图像处理技术,如反卷积、分割与定量分析,使研究人员能够从数据中提取有价值的信息。

 

Amira 软件支持光学显微镜中常用的各种文件格式,确保与各种成像系统无缝集成。

斑马鱼胚胎眼内的质膜和内膜。 数据由霍华德·休斯医学研究所珍妮莉亚研究园区的刘宗利(Tsung-Li Liu)提供,2018年,文章《观察细胞的天然状态: 多细胞生物亚细胞动力学成像》,《科学》第 360 卷第 6386 期。

“这是一款功能非常强大的软件,它既适用于电子显微镜,也适用于荧光显微镜,这一点非常难得,因为通常软件只专注于其中一种。 这款软件功能非常强大——我真心推荐 Amira 软件。”

Matthia A. Karreman

理学硕士、博士

德国海德堡欧洲分子生物学实验室 (EMBL)


MRI

Amira 软件利用先进的成像技术、精细的分离技术和全面的检查工具,解决了 MRI 面临的复杂数据解读、高噪声水平以及精确解剖区分等挑战。 它有助于创建复杂的 3D 重构模型,使研究人员能够精确地探索解剖结构。 Amira 软件支持定量分析,包括体积测量和统计评估,从而提升 MRI 数据集的解读效果。 其操作简单的界面和可定制的工作流程简化了 MRI 数据分析,使其成为临床和研究环境中的理想工具。

人脑弥散张量成像研究结果的可视化。 数据由雷根斯堡大学医院的 Alexander Brawanski 教授提供。

CT 和 PET

Amira 软件是生物工程师和临床前研究人员的理想选择,它提供了先进的工具,用于骨骼分割、分离和 3D 模型的详细测量。 其强大的半自动化工作流程,包括专门的皮质骨和松质骨分割,可节省时间和精力。 Amira 软件性能优化的配准工具和卷积架构,可实现图像数据的自动联合配准,从而促进放射性核素标记治疗剂的体内分布研究。 其全面的工具箱可以对功能图像进行精确的解剖分割和放射性示踪剂摄取量化。

使用 Amira 软件对 CT 成像的幼犬进行分割。

"维也纳兽医大学的研究十分多样化,涵盖临床和临床前研究领域。 目前,成像设施内有四名工作人员,为研究人员提供设备与支持,涵盖图像采集(宽场显微镜、CLSM、转盘式共聚焦显微镜,以及即将推出的 STORM 超分辨显微镜、显微 X 射线计算机断层扫描)和数据可视化与分析两个方向。 Amira 软件可帮助您构建联系,实现数据对象之间的复杂交互。 生物学也很复杂,生物相互作用就是复杂网络。 复杂的问题需要复杂的工具来解决。 在这方面,Amira 软件采用的分析功能在处理复杂数据分析时优于大多数其他软件。 此外,我喜欢 Amira 软件的一点就是,在深度学习网络和脚本编辑(Tcl、Matlab、Python……)的集成方面,它非常兼容开放。"

Stephan Handschuh

博士

维也纳兽医大学 VetCore


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