样本

包括1,249人,取自国际 HapMap 项目和1000基因组项目样本集。Axiom 外显子组样本列表中提供了完整列表。

文件和格式

可提供90个约鲁巴人的 Axiom 外显子组 319 CEL 文件。这些文件适合与 Axiom 外显子组分析库文件和注释文件一起用于 Axiom 分析套件。

可提供所有1,249人的变异检出格式 (VCF) 基因型文件,也可单独提供每个人群的 VCF 基因型文件。此处 (http://www.1000genomes.org/node/101 ) 介绍了文件格式。

可提供所有1,249人的 PLINK 格式基因型文件(二进制 .bed、.bim 和 .fam),也可单独提供每个人群的此类文件。这些文件适合与 Axiom 注释文件一起使用;内部的 SNP/插入缺失标识符是微阵列 SNP ID,可在注释文件中找到。

访问 Axiom 外显子组319和 Axiom 外显子组 Plus 数据集

群体描述外显子组 319 CELVCFPLINK
CEUCEPH 家系不适用zip,6.28 MBzip,2.99 MB
CHB中国北京的汉族人不适用zip,4.93 MBzip,2.65 MB
CHS中国南方的汉族人不适用zip,6.40 MBzip,3.01 MB
CLM哥伦比亚麦德林的哥伦比亚人不适用zip,6.00 MBzip,2.94 MB
FIN芬兰的芬兰人不适用zip,6.52 MBzip,3.09 MB
GBR英格兰和苏格兰的英国人不适用zip,6.50 MBzip,3.09 MB
IBS西班牙的伊比利亚人群不适用zip,6.57 MBzip,3.08 MB
JPT日本东京的日本人不适用zip,6.91 MBzip,3.10 MB
LWK肯尼亚韦布耶的卢希亚人不适用zip,7.59 MBzip,3.48 MB
MXL美国加利福尼亚州洛杉矶的墨西哥血统人群不适用zip,5.95 MBzip,2.92 MB
PEL秘鲁利马的秘鲁人不适用zip,5.77 MBzip,2.82 MB
PUR波多黎各的波多黎各人不适用zip,6.06 MBzip,2.98 MB
TSI意大利的托斯卡尼人不适用zip,6.84 MBzip,3.16 MB
YRI尼日利亚伊巴丹的约鲁巴人zip,744 MBzip,6.53 MBzip,3.14 MB
全部 不适用zip,31.2 MBzip,12.5 MB

下载样本列表(txt,16 KB)。

可访问变异检出格式 (VCF) 的格式规格,包括1000基因组项目采用的约定和扩展名。

仅供科研使用,不可用于诊断目的。