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在分子生物学研究中,引物是聚合酶链式反应(PCR)定量PCR(qPCR)以及下一代测序(NGS)等技术的核心工具。无论是基因扩增、突变检测还是高通量测序,引物的设计质量直接影响实验的灵敏度、特异性和可重复性。作为全球生命科学领域的领导者,赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific™)致力于为科研人员提供高质量的引物产品及全面的合成服务,助力您在基因研究领域取得突破性成果。


上游引物和下游引物:理解其作用与设计原则

什么是上游引物和下游引物?

在DNA双链结构中,由于核酸聚合酶只能沿5'→3'方向进行合成,因此引物的方向性至关重要。

上游引物(Forward Primer,F):结合于目标DNA模板的正义链(sense strand),引导新链从5'端向3'端延伸。

下游引物(Reverse Primer,R):结合于反义链(antisense strand),通常需要互补反向配对以确保正确的退火与扩增。

引物长度一般为18–30个核苷酸,Tm值(熔解温度)应接近且匹配,以保证高效的扩增效率。此外,引物设计还需避免二级结构、自身互补或与其他序列交叉杂交的问题。

上游引物与下游引物的区别?

特征上游引物(Forward Primer)下游引物(Reverse Primer)
结合链结合模板链(3'→5')结合互补链(5'→3')
扩增方向沿5'→3'方向延伸沿5'→3'方向延伸(但相对于模板链是反向)
序列对应与目标序列相同与目标序列反向互补
常见命名F-primer, FPR-primer, RP

上游引物和下游引物的关键注意事项:

方向性:下游引物必须设计成反向互补序列,否则无法结合。例如:若目标序列是 5'-ATGCC...-3',下游引物应为 5'-GGCAT...-3'(反向互补)。

Tm值匹配:上下游引物的熔解温度(Tm)应接近(差异≤5°C),以确保同步退火。

避免二聚体:引物自身或相互之间不应形成引物二聚体(Primer Dimer),否则会竞争PCR反应体系。

3'端稳定性:引物的3'端最后1-2个碱基应为G或C(强结合),提高延伸效率。


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1. 预设计引物(Pre-designed Primers)

赛默飞提供经过验证的预设计引物,适用于常见基因检测、表达分析和SNP分型。例如:

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2. 定制引物合成(Custom DNA Oligos)

针对特定研究需求,我们提供灵活的定制化引物合成服务,支持多种修饰选项(如荧光标记、磷酸化、硫代磷酸键等),适用于以下应用:

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