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Clariom 检测试剂盒的作用

近期的高级转录组分析发现了数千个剪接变体和长非编码 (lnc)RNA，为生物标记物的发现提供了新来源。然而，鉴于转录组的复杂性，寻找信息性表达生物标记物具有挑战性、耗时且成本高昂。Clariom 检测试剂盒采用来自多个数据库的最新转录组知识构建，是用于查找高保真表达生物标记物的简单快速工具。它们与临床研究样品兼容，可提供可扩展规格以满足不同的通量需求，并包括灵活、直观的软件，可用于快速简单的分析。

此外，我们的新 Clariom GO Screen 可在基因表达研究中对药物化合物进行高通量、低成本的二次筛选。了解更多 ›

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设计用于提供全面的覆盖范围、重现性和见解

Clariom 产品组合可针对不同客户的需求提供不同的检测试剂盒。Clariom D 检测试剂盒设计的内容较深，有助于进行完整的转录组分析，包括涵盖新的非编码转录本和剪接同源异构体。Clariom S 检测试剂盒是获得转录组的基因水平视图的极佳工具，并提供快速、简单和可扩展途径来生成您研究所需的结果。Clariom GO Screen 设计用于对药物化合物进行高通量二次筛选，并通过经验证的服务提供商提供服务。

Applied Biosystems Clariom 检测试剂盒包括阵列、试剂和直观的分析软件，可快速简单地提供全面的转录组结果——即使是使用极具挑战性的样品。

快速从样品到获得结果

  • 免费、简单和快速的数据分析——转录组分析控制台 (TAC) 软件可轻松分析 Clariom 检测试剂盒的所有转录组数据，无需额外费用
  • 可靠识别复杂的生物标记物标签并检查显著改变的通路
  • 快速从大规模队列研究中获得重要见解

轻松获得您所需的数据

  • 深度且广泛的转录组分析——Clariom D 检测试剂盒能够快速发现编码和长非编码基因、外显子、剪接变体和稀有转录本
  • 简单快速的发现——Clariom S 检测试剂盒可从充分注释的基因中轻松识别基因水平标签和通路
  • 可靠、可扩展的阵列可在短短三天内提供有意义的结果

当您有珍贵或富有挑战性的样品时

  • 可从总 RNA 量低至 100 pg 的样品中——少至 10 个细胞，生成表达谱
  • 分析多种样品类型（包括细胞、全血和新鲜/新鲜冷冻或 FFPE 组织）的 RNA
  • 无需去除球蛋白或核糖体 RNA，可保持样品完整性并降低差异性

证据

随着对转录组的了解不断增加，越来越多的证据表明 lncRNA 是编码 RNA 和选择性剪接的关键调节子。在多种疾病中出现这些调节性 lncRNA 的异常表达情况不断增加，确立了其未来用作生物标记物和治疗剂的潜力。

转录组水平检测可在感染幽门螺杆菌的人胃上皮细胞中识别出失调的 lncRNA

图 1.通过 qRT-PCR 证实了转录组水平检测识别的 13 个候选失调 lncRNA。其中，8 份样品显示感染 (T) 细胞与对照 (C) 细胞之间存在具有统计学意义的差异。相同 8 份样品的 qRT-PCR 验证显示，幽门螺杆菌阳性 (P) 细胞 vs. 幽门螺杆菌阴性 (N) 细胞中 4 个 lncRNA 存在显著差异。Zhu, H., et al.感染幽门螺杆菌的人胃细胞和组织中长非编码 RNA 表达谱的微阵列分析.BMC Medical Genomics 8:84 (2015).*

微阵列分析可显示内分泌耐药乳腺癌模型细胞系中的重要选择性剪接变体

图 2.HTA & Clariom D 人阵列可在 HiSeq™ 2000 系统上对 2 个完整泳道上的样品进行测序，在整个转录组中获得同等准确的基因表达测量值。通过评估线性组织混合模型（其中以已知比例混合来自 2 份样品的 RNA）评估所有已测量外显子的表达准确性。y 轴为计算出的误差或平均绝对偏差 (MAD)，(D-C)/(B-A) 的中位值 (|x - 中位(x)|)，其中 A = 通用人参考 RNA (UHRR)，Agilent Technologies, Inc.；B = 人脑参考 RNA (HBRR)，Life Technologies, Inc.；C = 75% A/25% B；D = 25% A/75% B。根据 n = 3 个阵列/样品的所有组合计算阵列 MAD，其中提供了 n = 4 个阵列/样品。箱形图显示 n = 3 个阵列/样品的所有 256 种可能组合，箱形图须线代表最小和最大 MAD 值。使用 GeneChip WT PLUS 试剂盒可从 100 ng 总 RNA 中制备阵列靶标。

针对每种需求进行检测

无论您需要一个深度且广泛的高分辨率转录组表达谱，还是关注转录组表面的基因水平变化，Clariom 检测试剂盒都能生成可重现的数据，并提供您找到生物标记物所需的覆盖水平。快速分析以获得结果。现在。

 

Clariom D 检测试剂盒

Clariom S 检测试剂盒

Clariom GO Screen

是否兼容 FFPE 组织？是是否
是否可使用细胞的直接裂解物作为起始样品？否否是
典型研究规模（样品数量）12-100012-10001,000-500,000
最低 RNA 起始量50 ng；用 Pico 检测试剂盒时是 0.01 ng（使用 FFPE 时是 0.5 ng）50 ng；用 Pico 检测试剂盒时是 0.01 ng（使用 FFPE 时是 0.5 ng）目标为 0.1 ng（100 个细胞/μL 时为 5 μL 裂解物）
应用深度且广泛的转录组分析和生物标记物发现充分注释基因的基因水平表达谱分析对药物化合物进行二次筛选和命中谱分析
分析水平编码和非编码基因、外显子和选择性剪接，包括充分注释的转录本和推测转录本充分注释的基因充分注释的基因，带基因本体协会设计的探针
规格卡盒（单样品）卡盒（单样品）；阵列板（24/96 份样品）阵列板（384 份样品）
可选物种人、小鼠、大鼠人、小鼠、大鼠人*
仪器（阵列规格）GeneChip 扫描仪 3000 7G 系统（卡盒）GeneChip 扫描仪 3000 7G 系统（卡盒）
GeneTitan 多通道		GeneTitan 多通道

*查询其他物种

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图 3.TAC 软件 WikiPathways 集成视图。通过可视化显示通路来识别更多数量的相关和差异表达基因。

深入了解 Clariom D 检测试剂盒的转录组

  • 对编码和非编码基因、外显子以及剪接变体进行全面详细的分析。
  • 覆盖所有已知转录本，无需考虑其丰度。
  • 快速发现复杂标签并确保生物标记物不会丢失。

使用 Clariom S 检测试剂盒简单迅速发现生物标记物

  • 使用所有充分注释的基因快速生成稳健表达谱。
  • 快速轻松地识别重要基因标签和通路。
  • 发现基因水平标签，并以高通量、自动化规格快速筛选大量样品。

使用 Clariom GO Screen 进行高通量二次筛选

  • 可获取 ~20,000 个基因靶标；与制药行业领导者合作开发内容
  • 即使使用直接细胞裂解物，也能快速获得高性价比的结果
  • 与提供快速结果的经验证服务提供商合作

Clariom 检测试剂盒可用于人、小鼠和大鼠，Pico 试剂用于挑战性样品，并提供多种通量规格以满足您的应用需求。定制设计可用于其他物种。

联请联系我们，了解更多信息 ›

相关资源

仅供科研使用，不可用于诊断目的。