预制的TaqMan OpenArray基因通路芯片

 

  • 行业金标准 —— 芯片预置Taqman Assay,拥有极佳的精确度
  • 高灵敏度 —— 可检测ng级别的样本
  • 检测范围广 —— 能筛选超过几百种与疾病通路相关的基因
  • 简单的流程 —— 只需加入样本和预混液,就可运行检测品

OpenArray芯片技术采用纳升流技术平台,可用于超小体积的液相反应。每张芯片有3072反应孔,预制基因通路芯片将金标准的TaqMan Assay预包埋在每个反应孔中,芯片包含数百种基因的Assay。一次运行,可检测数百个位点,轻松完成复杂的基因通路分析。让您进行高通量的筛选分析的同时,获得高质量的qPCR数据。


TaqMan OpenArray人类癌症芯片

包含624种与癌症高度相关的基因。该芯片覆盖了与DNA修复、血管生成、细胞粘连、细胞外基质、细胞周期、细胞凋亡、编码基因和编码转录因子等相关的基因。另外还有24个参考基因,用于数据标准化。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan OpenArray 人类癌症芯片的Assay种类及数量

基因种类 基因数量
参考基因24
与肿瘤相关的基因121
细胞周期调控因子105
生长、增殖、分化因子180
细胞粘连、运动调控因子79
与肿瘤发展相关的细胞信号因子289
肿瘤发生的其他基因194

TaqMan OpenArray 药物基因组学 (PGx) 芯片

该芯片用于检测药物代谢酶和转运蛋白的编码基因,为药物相互作用研究提供高价值的数据。该芯片包括158个Assay,可检测29个基因。 包括与心血管(CYP2D6, CYP2C19,NAT1, NAT2),镇痛药 (CYP2C9,CYP2D6),风湿病学 (CYP2C9,TPMT),神经病学(CYP2C19, CYP2D6),骨骼肌 (CYP2C19)等相关的基因。一张芯片最多可检测16样本。

TaqMan OpenArray 药物基因组学 (PGx) 芯片的Assay种类及数量

PharmaADME 分类 基因数量 典型的基因
阶段一12CYP1A1, CYP1A2, CYP2A6, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E1,CYP3A4, CYP3A5, DPYD
阶段二6GSTP1, NAT1, NAT2, UGT1A1, UGT2B7, UGT2B15
转运蛋白11ABCB1, ABCC2, ABCG2, SLC15A2, SLC22A1, SLC22A2, SLC22A6, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO2B1, TPMT

TaqMan OpenArray人类干细胞芯片

该芯片可检测与人类干细胞及其衍生物相关的标记基因。包括了609个经过验证的基因表达标记物和22个参考基因位点,可精确分析人类胚胎干细胞及其不同的细胞提取物的表征特异性。一张芯片可根据重复数检测1-4个样本。

TaqMan OpenArray 人类干细胞芯片Assay种类及数量

基因种类 基因数量 典型的基因
未分化的细胞中表达的基因6NANOG, POU5F1, TDGF1, DNMT3B, GABRB3, and GDF3
维持细胞多能性3NANOG, POU5F1, and SOX2
干细胞相关的基因33BRIX, CD9, COMMD3, CRABP2, EBAF, FGF4, FGF5, FOXD3, GAL, GBX2, GRB7, IFITM1, IFITM2, IL6ST,IMP2, KIT, LEFTB, LIFR, LIN28, NODAL, NOG, NR5A2, NR6A1, PODXL, PTEN, REST, SEMA3A, SFRP2,TERT, TFCP2L1, UTF1, Xist, and ZFP42
细胞分化的标记物50ACTC, AFP, CD34, CDH5, CDX2, CGB, COL1A1, COL2A1, DDX4, DES, EOMES, FLT1, FN1, FOX A2, GATA4,GATA6, GCG, GCM1, GFAP, HBB, HBZ, HLXB9, IAPP, INS, IPF1, ISL1, KRT1, LAMA1, LAMB1, LAMC1,MYF5, MYOD1, NES, NEUROD1, NPPA, OLIG-2, PA X4, PA X6, PECAM1, PTF1A, RUNX2, SERPINA1,SOX17, SST, SYCP3, SYP, T, TAT, TH, and WT1
参考基因3ACTB, RAF1, CTNNB1, GAPD, EEF1A1, and 18S

TaqMan OpenArray 基因分型遗传标记物芯片

包括两种格式为32的芯片(32A和32B)和一种64SNP的芯片,32A芯片包括3个Y染色体的SNP位点和29个常染色体的SNP位点。这可以用于生物资源应用中的个体样本鉴定。32A芯片足以准确的鉴定大多数的样本。
如果需要更高密度更全面的标记,可加上32B芯片或选择64格式的芯片。32格式芯片可检测96个样本,64格式芯片可检测48个样本。

TaqMan OpenArray 基因分型遗传标记物芯片的SNP Assay列表

 
 
 
 
 
 
HapMap*
 
SNP ID (rs)
TaqMan Assay ID
Chr
Mb
Allele 1
Allele 2
Average Freq 1
Average Freq 2
N
32A SNP panel
rs3010325C___2728408_10159.34CT0.510.492404
rs2136241C___1563023_101161.56CT0.470.532404
rs2259397C__15935210_101206.14TC0.520.482402
rs7564899C__33211212_10211.12GA0.480.522406
rs4971536C___3227711_10220.95CT0.490.512406
rs10194978C__30044763_10250.38GA0.500.502402
rs4855056C__11821218_103183.12AG0.500.502404
rs6554653C___1670459_10511.92CT0.510.492404
rs9396715C__29619553_10610.02TC0.510.492406
rs441460C___1007630_10625.66GA0.520.482402
rs7773994C__26546714_10637.68TG0.530.472398
rs1415762C___7421900_106125.08CT0.540.462392
rs6927758C__27402849_106163.64CT0.490.512400
rs7796391C___2953330_107125.90AG0.510.492402
rs2336695C__16205730_1081.02AG0.490.512404
rs1157213C___8850710_108104.28TC0.500.502406
rs10869955C___1801627_10979.48CA0.480.522402
rs1533486C___7431888_10101.50TG0.480.522404
rs4751955C___1250735_1010117.91AG0.470.532406
rs10771010C___1902433_101223.66TC0.520.482392
rs12318959C__31386842_101228.67CT0.530.472394
rs3742257C__26524789_101342.07TC0.470.532404
rs1377935C___8924366_101424.91TC0.500.502406
rs946065C_____43852_101455.00CA0.480.522404
rs6598531C__11522992_101596.95TG0.530.472402
rs4783229C__10076371_101681.18TC0.490.512406
rs1567612C___7457509_101834.09GA0.510.492362
rs1567612C___1122315_101840.74AG0.510.492406
rs11083515C__11710129_101944.39AG0.470.532400
rs768983**C___1027548_10Y6.88     
rs3913290**C___8938211_10Y8.66     
rs2032598**C___1083232_10Y13.36     
32B SNP panel
rs6427699C__29222350_101161.16GA0.500.502400
rs891700C___7539584_101237.95AG0.490.512404
rs7588807C___7539584_101237.95AG0.490.512404
rs7588807C___3036007_10315.50TC0.520.482406
rs6791084C___1525594_10330.10GA0.460.542406
rs10938367C____233438_10444.53GA0.510.492402
rs2561183C___2934686_10568.77CA0.520.482406
rs2560588C___2934686_10568.77CA0.520.482406
rs245057C___3221475_105149.32CA0.490.512392
rs9395021C__30289524_10644.55CT0.530.472406
rs1337823C__30289524_10644.55CT0.530.472406
rs974110C___8307036_10666.17AG0.500.502400
rs2268666C__15875060_106146.79CT0.450.552406
rs2189730C__26760518_1078.84GA0.450.552404
rs2189730C__43039996_10718.97TC0.490.512402
rs4716945C__29867302_107155.43AG0.490.512406
rs4521710C____126001_107157.74GA0.470.532404
rs11787149C___1204228_10818.20CT0.500.502406
rs2970636C__15964363_10837.00CT0.520.482404
rs10955074C___1677881_10887.93CT0.510.492404
rs7925270C___8466143_1011120.07CT0.510.492400
rs7925270C__31697299_1011127.22AG0.480.522400
rs2239177C___2608181_101211.93TC0.540.462404
rs7979054C__29016807_101293.24AG0.490.512400
rs4148542C__29558839_101394.48TC0.510.492406
rs4148542C__11476140_101486.01TC0.520.482402
rs2251110C___8793799_101531.39GT0.530.472394
rs4984473C__29415394_101594.33GA0.520.482406
rs312729C___2333563_101765.82GA0.530.472404
rs312729C___9217468_101842.83GT0.530.472404
rs607127C___7910532_101858.74CT0.570.43238
rs1942719C__11200035_101869.39CT0.510.492382

TaqMan OpenArray MicroRNA芯片

分为人和啮齿动物的两种芯片。
啮齿动物microRNA芯片用于鉴定验证啮齿动物(大鼠和小鼠)的microRN A(microRNA位点信息来自于miRBase v.15.),包含754种microRNA Assay。人microRNA芯片用于鉴定人的microRNA(microRNA位点信息来自于miRBase v.14.)包含754种microRNA Assay。可对人或啮齿动物的进行全面的microRNA表达谱分析。
一张OpenArray microRNA芯片可检测3个样本。

TaqMan OpenArray 人类炎症芯片

分为人和小鼠的两种芯片,人炎症芯片包含586种炎症基因特异性的Assay,可研究鉴别主要的炎症反应通路。另外还有21种参考基因的Assay。小鼠炎症芯片包括632种炎症基因特异性的Assay,另外还有16种参考基因的Assay。
每张芯片可检测1-4个样本。

TaqMan OpenArray 人类激酶芯片

人激酶芯片可检测772激酶及激酶相关的基因位点。另外包括56种参考基因的Assay。每张芯片可检测1-3个样本。

TaqMan OpenArray 人类信号转导芯片

人信号转导芯片可用于检测主要信号通路的重要基因。检测广泛的覆盖了信号转导通路,包括配体、受体、激酶、转录因子。信号转导通路相关的基因,如JAK-STAT, NFκB, Akt, GPCR, cAMP, MAP都包括在内。
芯片包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay,每张芯片可检测1-4个样本。

货号

芯片 (用于QuantStudio™ 12K Flex系统) 描述 货号
TaqMan OpenArray 人类癌症芯片识别主要癌症通路相关的差异表达基因
包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay
4475391
TaqMan OpenArray 药物基因组学 (PGx) 芯片药物代谢酶标记物验证
包含158种药物酶特异性的Assay
4475395
TaqMan OpenArray 人类干细胞芯片基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC)
包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay
4475390
TaqMan OpenArray 基因分型遗传标记物芯片高通量追踪和样本识别确认
包含64种基因分型标记物特异性的Assay
4475386 (32A)
4475387 (32B)
4475394 (64)
TaqMan OpenArray MicroRNA芯片 (人或啮齿动物)识别特性明确且研究充分的miRNA
每块芯片包含754种Assay
4470187 (人)
4470188 (啮齿动物)
TaqMan OpenArray 炎症芯片 (人或小鼠)基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路
人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay
鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay
4475389 (人)
4475393 (小鼠)
TaqMan OpenArray 人类激酶芯片识别细胞通路调控相关的基因分型
包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay
4475388
TaqMan OpenArray 人类信号转导芯片识别主要信号通路相关的重要基因
包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay
4475392

货号

芯片 (用于OpenArray 实时荧光定量PCR系统) 描述 货号
TaqMan OpenArray 人类癌症芯片识别主要癌症通路相关的差异表达基因
包含624种癌症特异性的Assay和24种参考Assay
4475371
TaqMan OpenArray 药物基因组学 (PGx) 芯片药物代谢酶标记物验证
包含158种药物酶特异性的Assay
4475375
TaqMan OpenArray 人类干细胞芯片基因表达标记物鉴别人胚胎干细胞 (hESC)
包含609种干细胞相关基因特异性的Assay和22种参考Assay
4475370
TaqMan OpenArray 基因分型遗传标记物芯片高通量追踪和样本识别确认
包含64种基因分型标记物特异性的Assay
4475366 (32A)
4475367 (32B)
4475374 (64)
TaqMan OpenArray MicroRNA芯片 (人或啮齿动物)识别特性明确且研究充分的miRNA
每块芯片包含754种Assay
4461104 (人)
4461105 (啮齿动物)
TaqMan OpenArray 炎症芯片 (人或小鼠)基因表达标记物鉴别主要的炎症反应通路
人炎症芯片包含586种人炎症基因特异性的Assay和21中参考Assay
鼠炎症芯片包含632种人炎症基因特异性的Assay和16参考Assay
4475369 (人)
4475373 (小鼠)
TaqMan OpenArray 人类激酶芯片识别细胞通路调控相关的基因分型
包含772种激酶和激酶相关基因特异性的Assay和56个参考Assay
4475368
TaqMan OpenArray 人类信号转导芯片识别主要信号通路相关的重要基因
包含573种信号转导相关基因特异性的Assay和24种参考Assay
4475372