Axiom™ 桉树基因分型阵列 (Axiom Euc72K)，384HT 规格

Axiom 桉树基因分型阵列 (Axiom Euc72K) 是我们 Axiom 基因分型解决方案的组成部分，其所含的靶标基因组 DNA 均在 GeneTitan 多通道仪器上制备和处理。该自动化过程包括将 gDNA 与该高通量微阵列杂交，然后进行染色、洗涤、成像和输出 SNP 基因分型数据以供进一步分析。Axiom 桉树基因分型阵列是与巴西 EMBRAPA 遗传资源和生物技术公司的 Dario Grattapaglia 博士和 Orzenil Bonfim Silva-Junior 博士合作设计的，是桉树 SNP 阵列倡议 (ESAI) 的一部分。ESAI 的目标是为研究界提供改良的低密度基因分型阵列，其具有更广泛的适用性，并显著降低基因组选择的操作成本。该阵列也具有迷你96规格（货号551135）。

Axiom 桉树基因分型阵列 (Axiom Euc72K) 内容物
• 包括72,000个 SNP
• 以 3.5X 覆盖率对12个桉树属和1个伞房属的240棵树的基因组进行测序（对每棵树测序），以制作4700万个原始 SNP 变体的集合
• 两个亚热带桉树属和伞房属的补充全基因组测序数据，用于提高序列覆盖率的体现改良的 SNP 发现和选择
• 全叶绿体 DNA 基因组序列数据用于推导 cpDNA SNP 的子集
• 130万个精选 SNP 的最终列表用于根据大桉树2.0版基因组的物理覆盖率进行筛选，它们采用960个样本（涵盖全球种植的绝大多数桉树种质，包括18种桉树属和4种伞房属）筛选得出
• 筛选产生的数据库包含 >780,000 个经过验证的桉树属 SNP 和30,000个伞房属 SNP
• 72,000个精选 SNP 用于基于基因组覆盖率的高通量生产阵列，其经过良好折衷以包括数量庞大且信息丰富的 Big Nine 桉树属和筛选的外围种属的 SNP，同时考虑通过先前的桉树 SNP 基因分型阵列获得便携性较高的 SNP

应用
• 全基因组关联研究
• 分子育种（关联映射和基因组选择）
• 通过从该阵列中选择 SNP 来创建定制阵列（已证明所选择的每个 SNP 均表现良好）

所需产品
GeneChip Command Console 软件
GeneTitan 多通道仪器
Axiom Analysis Suite 软件
Axiom 长格式导出工具 (AxLE)