Axiom 山羊基因分型 v2 阵列是我们 Axiom 农业基因组学基因分型解决方案的组成部分,其所含的靶标基因组 DNA 均在 GeneTitan 多通道仪器上制备和处理。该自动化过程包括将 gDNA 与该高通量微阵列杂交,然后进行染色、洗涤、成像和输出基因分型数据以供进一步分析。
Axiom 山羊基因分型 v2 阵列是与
国际山羊基因组联盟 和
VarGoats 联盟合作设计的。该阵列包括来自 Illumina Goat_IGGC_65K_v2 和 IMAGE 10K 山羊芯片的单核苷酸多态性 (SNP) [
更多信息 (PDF)]。该阵列还包括 1-50 个探针靶向的插入、缺失和复制以及59,795个 SNP 和265个结构变体。
该阵列还具有
迷你96规格。
Axiom 山羊基因分型 v2 阵列的特点包括:
•包含原始山羊 SNP 检测组合的更新设计,可兼容先前的研究
• 创新性设计是针对结构变体的首次尝试(该阵列包括265个结构变体)
阵列内容物• 含有59,795个基于基因组覆盖率而为高通量生产阵列选择的SNP,这些 SNP 经过良好折衷,包括大量适用于山羊属的信息丰富的 SNP
• 该阵列的设计包含以下 SNP:具有不同 MAF 图谱的 SNP、在育种中选择但在发现数据集中未体现的 SNP、能够加入当前 GBS 数据并弥补剩余缺陷(包括线粒体标记物)的 SNP、特定区域的 SNP、Y 标记物和结构变体
应用• 全基因组关联研究
• 分子育种:关联映射和基因组选择
• 通过从该阵列中选择 SNP 来创建定制阵列(已证明所选择的每个 SNP 表现良好)
所需产品GeneChip Command Console 软件GeneTitan 多通道仪器Axiom Analysis Suite 软件Axiom 长格式导出工具 (AxLE)