Applied Biosystems AgriSeq 猫亲缘关系检测和鉴定以及性状与遗传病 (PITD) Panel是一种组合Panel，通过靶向测序法基因分型 (GBS) 技术进行亲缘关系的检测和鉴定（111 个 SNP 标记），并检测猫的重要临床性状和遗传病（43 个 SNP，1 个 MNP，20 个 InDel 标记）。如果需要，在兼容的情况下，可以向Panel添加 Felis_catus_8.0 参比基因组的额外定制化标记。AgriSeq 猫 PITD Panel采用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程进行多重同时基因分型。使用 Felis_catus_8.0 参考基因组进行分析。

遗传性状检测特别需要对信息性遗传标记进行高度一致性的检测。靶向 GBS 方法（例如 AgriSeq）比非靶向 GBS 方法（例如 RADSeq）更有优势，后者很容易受到等位基因脱扣和丢失数据的影响。使用 AgriSeq 工作流程，能够在各种不同样品中高度可重现地同时靶向数百至数千个标记。我们与多位专家及 ISAG 成员实验室合作，开发并验证了Panel中全部的 175 个 SNP 标记的性能。使用正交试验、稳定性试验以及采用不同的猫口腔拭子 DNA 样本进行的田间试验验证了Panel的性能。另外，还使用 2019 ISAG/ICAR 猫 SNP 分型第二对比样品盘对这 111 个 SNP 亲缘关系检测和鉴定标记进行了确认。全面的 AgriSeq 猫 PITD Panel可提供可靠的基因分型结果，用于亲缘关系检测、鉴定验证和预测具有临床意义的遗传疾病和性状。

AgriSeq 猫 PITD Panel的特点包括：
•实现111个 SNP 标记的可重现基因分型，用于亲缘关系检测和身份鉴定
• 靶向42种遗传疾病和22种性状的64个标记（43个 SNP、1个 MNP、20个 InDel）的可重现基因分型
• 简单、高通量的工作流程
• 可定制，以与兼容的性状和疾病标记配合使用

标记平均样本检出率 >99%
高基因型检出率和重现性是准确测定亲缘关系和身份或准确预测性状和疾病的必要条件。使用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程对高度多样化的猫口腔拭子 DNA 田间样本进行评估，大多数标记获得了 99.3% 的平均样本检出率（见下图）。重复基因型一致性 >99.5%，且检出与正交数据高度一致 (100%) 。

简单、高通量的工作流程
AgriSeq 猫 PITD 检测组合经过优化，适用于 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程。每张测序芯片可混合多达 768 份个体样本，大大降低了每只动物的测序成本和工作量。一天可处理多达 4 块 384 孔板，只需三天即可获得全部测序结果。AgriSeq 工作流程的灵活性允许将数百个样本混合到单次测序运行中，并同时靶向成百上千个标记。

可将其它标记添加至 AgriSeq 猫 PITD Panel，从而最大化检测价值
AgriSeq 靶向 GBS 工作流程高度灵活，允许添加兼容的标记和Panel，从而进行高效、高价值的基因分型。无论您希望将亲缘关系分析与特定的期望性状标记相结合，还是与遗传缺陷标记相结合，以在育种计划中剔除携带者，我们专业的农业基因组学生物信息学专家团队都可以帮助您设计高性能的检测组合。

AgriSeq 猫 PITD 检测组合配合 AgriSeq 工作流程为猫亲缘关系鉴定和身份识别或性状和疾病预测提供了一种简易且经济实用的方法。

注释：可以通过联系技术支持获取 Felis_catus_8.0 参考基因组和分析 AgriSeq 猫 PITD 检测组合所需的其他文件。