Proteome Discoverer 软件

Identify and quantify peptides and proteins in complex biological samples using Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ software. Proteome Discoverer software simplifies a wide range of proteomics workflows, from protein and peptide identification to PTM analysis to isobaric mass tagging and both SILAC and label-free quantitation. It supports multiple database search algorithms and multiple dissociation techniques. Go beyond searching to discovering with intelligent INFERYS™ Rescoring and the CHIMERYS™ intelligent search algorithm by MSAID to substantially increase the number of unique peptide identifications.

Proteome Discoverer 软件支持多种解离技术、定量技术和数据库搜索算法，可进行广泛的蛋白质鉴定、表征和定量。

 

综合

• 通过灵活、内置或可定制的工作流程简化蛋白质研究数据处理
• 采用智能 INFERYS Rescoring 和 CHIMERYS 算法查找更多信息
• 支持多种解离技术（HCD、CID、ETD 和 UVPD），以实现更完整的覆盖范围和可靠的 PTM 鉴定
• 支持同量异位质量标记（TMT、iTRAQ）、同位素标记 (SILAC) 和非标记定量
• 以假阳性发现率 (FDR) 来验证肽和蛋白质 ID
• 可适应的节点，适用于自上而下 (ProsightPD) 和结构生物学及交联分析 (XL-MS)

生产力高和可扩展

• 自动分析数据，并通过预置和可定制的工作流程简化 MSn 数据分析
• 包括将定量分析对应至样本生物学信息的研究管理
• 使用结果来完善数据采集，例如导出纳入和排除列表，以便直接导入仪器方法
• 通过 GO 分类、PTM 位点和来自公共数据库的参考文献，对已鉴定的蛋白质进行自动注释，说明其生物学背景信息
• 支持由 HUPO 蛋白质组学标准计划 (PSI) 开发的数据标准，加快数据对比、交换和验证
• 支持第三方节点进行数据处理，可实现大型数据集的处理
• 采用快速、稳健的人工智能算法进行峰值选择和肽定量，以提取更多信息
• 获得可靠的统计数据，并可视化视验证定量结果