Mass Frontier 质谱解析软件

充分利用在线数据库结构检索功能或用户提供的结构，即可通过 MSⁿ 与亚结构的谱图匹配来可靠地鉴定更多未知化合物。

对于 mzCloud 中每一种化合物，都会有逻辑地将众多前体离子和 MSⁿ 裂解谱组织成质谱树。质谱树的每一级表示一个 MSⁿ 阶段，其中顶层从 n=1（或前体离子谱图）开始。每一级可能包含大量谱图，因为数据是在不同实验条件下获取的，以确保后续碎片的覆盖范围广泛且具有代表性，从而提高获得高质量搜索结果的可能性。

mzCloud 质谱树示意图。获得给定化合物在多重极性 (ESI +/-) 下和一系列加合态的质谱图。每个母离子以不同的裂解方式（CID、HCD）在多个碰撞能量下彻底碎裂，在每个裂解级别（MS²、MS³、MS⁴等）下产生一系列碎裂谱图，进而为每个库的化合物条目生成综合的质谱图树。

每个库条目的大量数据对于准确鉴定化合物、将实验获得的数据与库数据相匹配以及 Compound Discoverer 和 Mass Frontier 数据分析软件实现高置信度和数据可视化结果至关重要。其他工具包括 mzLogic，它使用丰富的裂解信息对不能仅根据谱库来鉴定的未知化合物进行可靠地鉴定。

借助 mzCloud 或您自建谱库中包含的大量裂解信息，Mass Frontier 软件提供多种不同的检索类型来提高匹配部分或全部质谱数据的可能性，从而帮助您快速深入地了解您的数据集：

• MS² 与 MS² 识别检索
• MSⁿ 与 Msnⁿ 树检索
• 亚结构识别检索（MSⁿ 与 MSⁿ）
• 子树检索（MSⁿ 与 MSⁿ）
• mzLogic

MS² 与 MS² 识别检索用于鉴定化合物，它会将实测的 MS² 谱图与 mzCloud 或标准库中的 MS² 谱图进行比较；这种方式进行匹配，前体离子在两个谱图中也必须匹配。得到的相似度评分是基于两个匹配 MS² 谱图产生的信息重叠。

MSⁿ 与 MSⁿ 树检索类似于 MS² 与 MS² 识别检索，但它将根据 mzCloud 或标准库检索实测树中任何 MSⁿ 谱图。任何匹配的裂解谱都用红色边框突出显示，匹配 MSⁿ 谱图越多，得到的匹配评分就越高。

MSⁿ 与 MSⁿ 树检索的一个关键优点是相比于MS² 与 MS² 识别检索，更能区分位置异构体，这是由于在高阶裂解谱中存在结构特异性碎片离子的可能性较高 。

当查询的库中没有完全匹配时，亚结构识别检索（MSⁿ 与 MSⁿ）仍允许利用任何的亚结构信息进行匹配。通过在查询树和检索库的质谱树之间匹配任何 MSⁿ 谱图，可以鉴定属于同一化合物类别或共享一个公共亚结构的化合物。

与亚结构识别检索类似，子树检索（MSⁿ 与 MSⁿ）再次基于 MSⁿ谱图匹配来力图匹配库中的亚结构；主要区别在于使用多个谱图，从而导致任何匹配结果的匹配评分计算和潜在可信度存在差异。

下载疑难解答

所含 Metabolika 生物学通路的示例，此通路可全面编辑并添加内容。

通过使用 MSⁿ 质谱树的自动化碎片注释，实现可靠的结构确证。碎片通路也可以基于一种结构的提交进行预测，并充分利用 HighChem Fragmentation Library™：包含来自超过52,000个裂解方案、217,000个单独反应、256,000个化学结构以及源于同行评审文献的216,000个解码机制的信息。

碎片离子检索（或 FISh）可根据通过理论碎片预测或实测 MSⁿ 质谱谱图树获得的母体化合物裂解方式来快速筛选结构相似的化合物。由于母体化合物结构及其潜在代谢物被用来过滤大部分与基质有关的背景离子，因此 FISh 能够快速方便地识别相关信息。FISh 提供全面的 l 相和 ll 相生物转化列表，并且能构建自定义列表。

除了过滤结构相似的化合物之外，FISh 还可以自动定位修饰位点和标记，并对母体结果和过滤结果共同具有的碎片进行颜色编码。在上面的例子中，拟定的代谢物碎片的精确匹配以绿色突出显示。转化反应匹配以蓝色突出显示。

使用 HighChem 裂解库生成自动碎片分配，如"了解裂解通路"一节所述。

新的库构建模块可为您的专有化合物自动进行质谱树整理、碎片注释和质量重新校准，以构建优质的本地 MSⁿ 库。