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无标记单细胞蛋白质组学的挑战：来自 DIA-SCP 数据的经验
本课程时长：30分钟
摘要
本演讲由 Marcel Bühler 主讲，聚焦于在 VIB 医学生物技术中心开展单细胞蛋白质组学（SCP）研究时的实践经验与方法优化。他指出单细胞蛋白质组学研究增长迅速，成功的研究依赖于 专用基础设施、先进仪器设备以及必要时的自制设备（DIY）。
演讲涵盖了样品制备与 LC 方法优化，强调精确处理单细胞样品以减少技术偏差并保持重现性的重要性。讲者还分享了使用 μPAC™ 色谱柱 提升灵敏度的经验，并指出在定量模型中必须考虑细胞大小等生物学因素。
通过展示在不同实验中遇到的问题（如样品制备时的蒸发问题）及对应解决方案，演讲者总结了在适当的样品准备和设备掌握下，即使使用较低级别的仪器也能获得有意义的单细胞蛋白质组数据。
学习要点
- 基础设施与设备的重要性：成功的 SCP 研究需要先进仪器、稳定环境、适当资金投入，有时还离不开自制工具。
- 样品制备与 LC 方法优化：减少技术噪声是 SCP 的关键；使用 μPAC™ 等高性能色谱柱可显著提高灵敏度与数据质量。
- 定量模型与数据处理：SCP 定量需要考虑细胞大小等变量；良好的样品制备与试剂质量能显著提升数据可靠性。
演讲者
Dr. Marcel Bühler
项目经理
VIB-UGent 医学生物技术中心
Dr. Bühler 于 2023 年 1 月在 苏黎世大学（University of Zurich） 获得癌症生物学博士学位，博士论文题为：《利用 PCT-SWATH 质谱对胶质母细胞瘤蛋白质组进行纵向表征》。
在此之前，Marcel 于 2018 年 12 月在 瑞士联邦理工学院苏黎世分校（ETH Zurich） 获得生物学理学硕士学位，主修生物化学。其硕士论文聚焦于：《通过互补表型分析和组蛋白表观蛋白质组学对表观遗传抑制剂的表征》。
Marcel 还于 2016 年 9 月在 ETH Zurich 获得生物学理学学士学位。
适合参加的人群
- 蛋白质组学研究人员与技术人员
- 生命科学研究者（希望开展 SCP 研究）
- 实验室经理与科研资金管理者