大队列研究专题：快速、稳定、高通量，Orbitrap成为DIA定量蛋白组学金标准

赛默飞提供了一系列先进的质谱平台和多组学分析解决方案，以支持深入的蛋白质组学、代谢组学、脂质组学等研究。其核心技术包括：

• Orbitrap Astral 质谱仪：该仪器将蛋白质组学分析带入高通量时代，能够在短时间内（如8分钟内）突破8000个蛋白质的检测屏障，并实现每日180份样品的高通量分析。
• Orbitrap Exploris GC 高分辨气质联用仪：这款仪器特别适用于代谢组学研究，具有高分辨率、超高质量精度、高灵敏度和宽线性范围的特点，能显著提升代谢物的检出量和准确度。

同时检测RNA和蛋白质表达变化能够提供更全面、可靠的细胞状态信息。这是因为：

• RNA水平的变化可能是瞬时的，并不总是与蛋白质水平相关。
• 蛋白质水平通常维持时间较长，更直接地反映细胞功能。
• 两种数据的整合与分析可以相互补充和验证，可能发现单一检测方法无法揭示的变化，从而支持关键的科学发现。

多组学实验会产生海量数据，其分析面临数据量大、复杂度高的挑战。赛默飞提供了一系列软件工具和平台来应对这些挑战：

• Proteome Discoverer 软件：用于鉴定和定量复杂生物样品中的蛋白质，支持多种蛋白质组学工作流程（如DIA, DDA, TMT, PTM等）。
• Compound Discoverer 软件：用于小分子鉴定，如代谢物和非靶向代谢组学分析。
• mzCloud 质谱谱图库和mzLogic 算法：辅助进行未知化合物的鉴定。
• Ardia 平台和iOmics Cloud多组学云平台：这些云原生平台有助于解决数据存储、处理、共享和协作的难题，支持大型文件的操作，并提供了丰富的生物信息学分析工具，旨在弥补从数据结果到生物学知识之间的“最后一公里”短板。

单细胞蛋白质组学允许研究人员在单个细胞水平上研究蛋白质表达，这对于理解细胞异质性、鉴定罕见细胞类型以及分析有限样品至关重要。赛默飞提供了全面的单细胞蛋白质组学解决方案：

• 优化的仪器平台：例如Orbitrap Astral, Orbitrap Ascend Tribrid 和 Orbitrap Exploris 480 质谱仪，这些系统针对灵敏度、通量和定量准确性进行了优化，以满足不同通量和研究深度的需求。
• 专门的工作流程：支持DIA（数据非依赖采集） 和 TMT（ tandem mass tag）标记两种主流的单细胞蛋白质组学工作流程，以适应不同的研究策略。
• 自动化样本制备：有助于解决单细胞样本制备的挑战，提高结果的一致性和可靠性。

选择组学分析系统时，需考虑您的具体研究目标、样本通量和预算。

• 对于高通量蛋白质组学研究，追求极致速度和深度的实验室，Orbitrap Astral 质谱仪是一个理想的选择。
• 对于侧重代谢组学，特别是挥发性或小分子代谢物研究的用户，Orbitrap Exploris GC 高分辨气质联用仪及其相关方法（如GC-MS非靶代谢组、HS-SPME-GC-MS）更为合适。
• 对于入门级研究或预算有限的实验室，Orbitrap Exploris 480 质谱仪提供了可靠的功能，能够执行单细胞蛋白质组学DIA工作流程等。