Ion GeneStudio S5 System

使用Ion GeneStudio S5这一可扩展平台,将研究范围扩大到每次运行覆盖2M ~ 130M reads测序通量。

Ion GeneStudio S5系统旨在以快速、可扩展的方式实现各种靶向二代测序(NGS)应用。五种Ion S5芯片每次运行可产生的测序通量范围为2M ~ 130M测序片段(reads)。

询价

在短短三个小时内完成测序和分析

手动操作时间仅为15分钟,并在当天提供测序结果
Sequencing and analysis in as little as three hours
 
Ion GeneStudio S5系统
Ion GeneStudio S5 Plus系统
Ion GeneStudio S5 Prime系统
最大通量/天(芯片类型)15 Gb
(一张Ion 540芯片)
30 Gb
(两张Ion 540芯片)
50 Gb
(两张Ion 550芯片)
最大通量下的总测序和分析时间19小时(Ion 540芯片) 10小时(Ion 540芯片)
11.5小时(Ion 550芯片)
8.5小时(Ion 540芯片)
8.5小时(Ion 550芯片)
兼容芯片Ion 510、520、530、540芯片 Ion 510、520、530、540和550芯片

测序通量可支持多种NGS应用

从基因panel检测到外显子组,从基因表达谱到转录组,或从微生物基因组到微生物组,Ion Torrent 半导体测序系统降低了小型和大型NGS项目的成本,大大提高了通量。

癌症研究:
SNP、indel、拷贝数、基因表达和基因融合分析的基因检测Panel

遗传疾病研究:
靶向基因或全外显子组分析

基因表达分析:
全转录组RNA测序、靶向RNA测序和小型RNA测序

生殖健康研究:
非整倍体检测
 微生物学/传染病研究:
微生物全基因组,微生物分型和宏基因组学
 

Ion GeneStudio S5系列测序仪可用于DNA测序,通过检测半导体芯片核苷酸延伸过程中释放的氢离子,实现DNA分析。该设备用于分析人类基因中不同特定区域的DNA序列。


癌症研究

Oncomine检测是端到端工作流程的一部分,可实现NGS分析并发现多个生物标志物类型(融合、插入/缺失(indel)、单核苷酸变异和拷贝数变异),其中端到端工作流程包括通过经优化的生物信息学和报告进行简单、可扩展的测序,以便进行癌症研究。

应答者和非应答者的逻辑回归分数

利用TCR收敛性和均一度预测应答的ROC

zhang-fong-convergence

图1. 通过TCR均一度和收敛性预测免疫疗法结果

外周血TCRB库收敛性和克隆扩增预测抗CTLA 4单一疗法癌症的反应

方法:利用低错误率的Ion Torrent平台替代,在一组22名癌症患者中评估作为预测性生物标志物对抗CTLA-4单一疗法应答的收敛性。使用Oncomine TCRB-lR检测或 Sequenta/Adaptive Biotechnologies TCRB检测对来自3个供体的八个外周血白细胞(PBL)样本进行分析。

结果:TCR的均一度和收敛性组合提高了应答的预测率(AUC = .89)。

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复杂遗传疾病研究

我们完整的NGS解决方案特别适合于对基因和环境的结合影响复杂疾病发展的理解进行研究,如自身免疫紊乱、神经退行性疾病等。
Inherited-disease

通过二代半导体测序技术对遗传性心肌病进行分子分析。

方法:使用单个Ion AmpliSeq基因检测组确定不同遗传性心肌病的致病变异。

结果:在23.6%的研究样本中发现潜在的致病变异,包括 SLC25A4基因的纯合子变异。

阅读发表文章

Targeted-pnaels

视频:靶向检测或外显子组——哪种NGS方法适合遗传疾病研究?


微生物学/感染性病研究

发现微生物的多样性,研究病原体爆发,并确定可能与抗生素耐药性相关的突变。利用更高的通量、更高的准确度和更长的读长实现快速、准确的微生物测序,简化样本制备,建立一个简单、可扩展、优化的数据分析工作流程。

时间追溯故事:宏基因组分析破译了未知的地理移位和可能走私的古董大理石雕像的储存历史

方法:通过16S核糖体DNA(rDNA)宏基因组分析及其他分析,重新构建了三个单独雕像的储存历史,推断它们之间的关系,并阐明它们的地理移位。

结果:真核微生物组具有许多土壤微生物的相似性。两个雕像出现许多耐盐和亲盐细菌,这可能表明它们长期处于干旱和半干旱环境以及海洋环境中。

阅读发表文章 

Metagenomic-analyses


Ion Torrent 靶向二代测序工作流程

prep-sequence-analyze
  • 通过低至1ng的DNA或RNA起始样本量,使用福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、细针抽吸、游离细胞DNA制备文库,以及使用 Ion AmpliSeq 技术制备其他样本类型
  • 通过 Ion Chef系统自动化程序,自动完成文库制备、模板制备和芯片加载工作
  • 使用样本卡盒加载试剂,安装时间不到15分钟,然后在Ion GeneStudio S5仪器上进行2.5小时测序运行
  • 在基于Connect云的平台或内置 Ion Reporter 服务器上,通过分析、质控报告和变异查找,将数据转换为可解读的结果
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  • 通过低至1ng的DNA或RNA起始样本量,使用福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、细针抽吸、游离细胞DNA制备文库,以及使用 Ion AmpliSeq 技术制备其他样本类型
  • 通过 Ion Chef系统自动化程序,自动完成文库制备、模板制备和芯片加载工作
  • 使用样本卡盒加载试剂,安装时间不到15分钟,然后在Ion GeneStudio S5仪器上进行2.5小时测序运行
  • 在基于Connect云的平台或内置 Ion Reporter 服务器上,通过分析、质控报告和变异查找,将数据转换为可解读的结果

技术支持

  • 由超过1300名服务和支持人员组成的全球网络将提供专家支持,致力于帮助您最大程度提高数据完整性和仪器投资回报

Resources

仅供科研使用,不可用于诊断目的。