新一代测序数据分析服务

快速启动 Ion Torrent™ 数据分析功能。与我们联系以讨论您的项目，我们将助您确定对您而言具有较高性价比的选项，无论是以每小时咨询计还是作为我们 生物信息学服务包的一部分。

此服务可包括：

• 设置您的 Ion Torrent™ 服务器
• 配置您的 Ion Torrent™ 服务器数据管理策略
• 配置 Ion Torrent™ 支持的插件
• 就 Ion Torrent 新一代测序系统和数据分析概述提供咨询
• 选择适当的主要数据分析工作流程参数
• 优化您的 Ion Torrent™ 浏览器和次要分析参数
• 设置 Integrative Genomics Viewer (IGV) 以查看比对结果
• 演示 Ion Torrent™ 系统维护和更新
• 使用 Ion Ampliseq™ Designer
• 配置 Ion Reporter™ 软件以实现与 Ion Torrent™ 服务器输出的无缝运行
• 将运行转移到 Ion Reporter™ 服务器系统上

在 Ion Torrent™ Variant Caller (TVC) 的变异输出上取得灵敏度与特异性之间的所需平衡。在 NGS 数据中进行变异检测有许多细微差别。此服务的目的是通过优化变异检测管线并定制特定应用的变异检测程序参数来减少手动筛选变异的时间。

对于拥有已知变异的对照样本的客户，我们经验丰富的生物信息学家可助您改善假阳性与假阴性比或提高针对特定变异的灵敏度。优化路径包括特定应用程序的 TVC 运行输出分析、检测程序中的高级参数调整以及 TS 中 TVC 检测的定制。还可采取其他步骤优化 Ion Reporter™ 软件的报告路径和输出报告的适当定制。我们的工作流程优化服务可包括：

• 在您自己的应用中分析当前 ROC 曲线 [给定金标准数据集]
• 选择所需的参数设置
• 简化整个项目中商定的参数的应用
• 定制 Ion Reporter™ 筛选器、注释和报告

无论您是初次接触新一代测序还是经验丰富的专家，我们均可助您从 RNA-Seq 实验中获得所需的数据。我们将与您合作以定义实验参数从而满足您的数据分析参数需求，包括：

• 选择用于检测的 RNA 种类
• 评估总 RNA 的完整性并执行预校正 QC
• 设置对照、归一化、重复运行和参考
• 预测每个芯片的数据量或样本量
• 优化统计、SNP 和 GeneSet 分析
• 使用开源或商业软件
• 设置有效的 IT 基础设施

为您的 Ion Torrent™ RNA-Seq 数据分析制定清晰路径。明确执行 RNA Ion AmpliSeq™ 设计或者 Torrent Suite™ RNA-Seq 和 RNA 检测组合分析。确定适合您应用和站点需求的额外插件或第三方软件。我们的内部生物信息学家将指导您完成与 AmpliSeq™ RNA 或 RNA-Seq 数据分析相关的一系列活动。此咨询服务可包括：

• 设置定制的 Ion AmpliSeq™ RNA 设计
• Ion AmpliSeq™ Designer 输出故障排除
• 配置 Ion AmpliSeq™ 数据分析工作流程
• 为 Ion Torrent™ 服务器配置适当的参考文件
• 通过覆盖率分析插件和覆盖率分析插件精简版检查样本质量
• 解决定制设计问题
• 讨论用于下游分析的第三方分析工具（免费或来自第三方）