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全面、可扩展且智能的平台
Thermo Scientific Proteome Discoverer 软件是蛋白质研究的终极工具箱，提供可定制的工作流程以应对现代蛋白质组学的复杂性。 它简化了复杂生物样品中蛋白质的鉴定和定量分析，支持多种工作流程，包括肽段和蛋白质鉴定、翻译后修饰（PTM）分析、同位素标记以及无标记定量（LFQ）。 它可处理来自多种采集方法的数据，例如数据独立采集（DIA）、数据依赖采集（DDA）和宽窗采集（WWA），从而实现全面的数据覆盖。
诸如 INFERYS™ Rescoring 和由 MSAID 提供的 CHIMERYS™ 智能搜索算法等先进工具，可显著提高鉴定率、蛋白质覆盖度，以及发现独特肽段和 PTM的能力。 该软件增强了对同位素标记和无标记定量的蛋白质定量能力，支持多种数据库搜索算法和裂解技术。 无论是分析糖肽、自上而下的蛋白质组学(Top-down Proteomics,TDP)、蛋白异构体（proteoforms），还是基于质谱的结构生物学（例如化学交联 XL‑MS），Proteome Discoverer 软件都能帮助科学家从数据中提取更深层的生物学见解。
主要优势
| 自定义数据分析 | 相对定量分析 | 可扩展的工作流程工具 |
|---|---|---|
| 使用基于节点（node-based）的工作流程编辑器，自定义数据分析流程，以实现最大覆盖率和最高置信度。整合来自多个搜索引擎的数据库搜索结果，例如 SEQUEST™ HT、MSPepSearch，以及第三方节点（包括 Mascot、MSAmanda、Comet、XlinX、 Protein Metrics 的 Byonic™、Thermo Scientific ProSightPD Software 等）。通过 INFERYS Rescoring 提高肽段鉴定和定量的置信度，并借助 CHIMERYS 智能搜索算法对 DIA、DDA 或 WWA 数据进行更深入的挖掘和分析。 | 测量并报告同位素标记肽段的相对表达水平，支持以下应用：
通过集成的统计与可视化工具，用户可自信且高效地解读数据，加速获得有意义的结果。 |
通过脚本和统计洞察节点，实现内置定制，同时保持与 Proteome Discoverer 软件框架的完全集成，以利用可视化、统计分析和生物学解释工具，提升您的分析水平。 |
用于蛋白质组学研究的综合工具
借助多种数据库检索选项以及整合多个算法输出结果的能力，Proteome Discoverer 软件通过交叉验证提升分析结果与决策的置信度。
通过支持多种解离技术（包括碰撞诱导解离 CID、高能碰撞诱导解离 HCD、质子转移反应 PTR、紫外光解离 UVPD 和电子转移解离 ETD）并配合专用搜索引擎，可实现完整的序列覆盖和对翻译后修饰（PTMs）的高置信度鉴定。
可定制的数据分析工作流程
通过支持多种定量方法的可定制工作流程，简化数据分析过程。 通过使用 TMT、TMTpro 或其他同位素标记策略，实现实验设计的灵活性，或选择无标记定量（LFQ）技术。 通过研究管理以及用于峰选择和肽段定量的高级算法，可将定量数据映射到生物学信息，从而最大化蛋白质组学研究中的信息提取。
遵循 HUPO 蛋白质组学标准倡议(PSI) 制定的数据标准，自信且轻松地促进数据比较、交换与验证。
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根据我们的产品文档、手册和标签，LC-MS 不用于体外诊断用途。它们被指定仅用于一般实验室用途。
我们的产品尚未针对此类用途进行测试或验证，将其用于体外诊断可能导致结果不准确，并可能产生更严重的健康与安全风险。 它们被指定仅用于研究用途。