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以下是一些可能的原因和解决方案: - 凝胶上的分子量标准品的量不足: 将适当体积的分子量标准品上样到凝胶上。以下是我们的建议: •小型凝胶:每孔5μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔10μL(厚度1.5 mm) •大凝胶:每孔10μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔20μL(厚度1.5 mm) - 转印不完全或不理想: 优化转印条件
以下是一些可能的原因和解决方案: - 样品被煮沸: 丢弃煮沸的等分样品。 - 使用的分子量标准品体积过大: 加入较少的体积或使用前用蛋白质上样缓冲液稀释分子量标准品。 - 储存缓冲液中的DTT氧化: 加入新制备的DTT溶液使最终浓度达到50mM。在95℃下加热10分钟。在室温下冷却并充分混合。储存于-20℃以备将来使用。
•降低电压、电流或缩短转印时间 •确保转膜缓冲液的甲醇浓度合适;可使用浓度为10–20%的甲醇,从而去除SDS-蛋白质复合物中的SDS,并促进蛋白质与膜的结合。 •确保转膜缓冲液的SDS浓度合适(若加入了SDS),SDS浓度不要超过0.02–0.04%。过多的SDS会阻碍蛋白质与膜的结合。过多的SDS会阻碍蛋白质与膜的结合。 •检查膜的孔径和靶标蛋白质的大小。小于10kDa的蛋白质很容易穿过0.45μm孔径的膜。如果您的目标蛋白质小于10 kDa,那么最好使用0.2μm孔径的膜。
•增加电压、电流或转印时间 •凝胶和SDS-蛋白质复合物中的SDS会促进蛋白质从凝胶中洗脱,但抑制蛋白质与膜的结合。这种抑制作用在硝化纤维素膜上的强度大于PVDF膜。对于难以从凝胶中洗脱的蛋白质,如大分子量蛋白质,可在转膜缓冲液中加入少量SDS以改善转印效果。我们建议在组装三明治前将凝胶置于含0.02–0.04% SDS的2x转膜缓冲液(无甲醇)中预平衡10分钟,然后使用含10%甲醇和0.01% SDS的1X转膜缓冲液进行转印。 •甲醇可去除SDS-蛋白质复合物中的SDS,促进蛋白质与膜的结合,但对凝胶本身有一些不良影响,会降低转印效率。甲醇可能导致孔径减小、某些蛋白质发生沉淀以及一些碱性蛋白质带正电荷或变为中性。应确保转膜缓冲液的甲醇浓度不高于10–20%,并使用高质量的分析级甲醇。
预染标准品具有与每种蛋白质共价结合的染料,这将导致标准品在不同的缓冲系统(即不同的凝胶)中迁移率不同。因此,使用预染标准品进行分子量估算将仅得出蛋白质的表观分子量。预染标准品可用于分子量估算、确认凝胶迁移和估算转膜效率,但对于需要精确估算分子量的应用,应使用非预染标准品。