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两个载体的骨架非常相似。主要的不同在于pCR4-TOPO载体测序引物位点距离PCR产物插入位点仅33 bp。这使得对插入序列进行测序时需要读取的载体序列能最小化,从而使pCR4-TOPO载体非常适合进行测序应用。
两个载体的骨架非常相似。主要的不同在于pCRII-TOPO 载体是一个双启动子载体,包含SP6和T7启动子用于体外转录/测序,而 pCR2.1-TOPO仅包含T7启动子用于体外转录/测序。两个载体均含有M13 正向和反向引物位点用于测序或PCR检测。
对照模板的序列是受专利保护的。
仅使用载体进行转化不是推荐的阴性对照实验。拓扑异构酶改构过程不是一个效率100%的过程,因此,在您的混合物中将会存在“不含插入片段的载体”,因此会产生克隆。
磷酸化的产物可以进行TA克隆但不能进行TOPO克隆。这是因为所需的磷酸基团已经包含在载体DNA和拓扑异构酶形成的中间体复合物中。TOPO载体含有一个与拓扑异构酶共价结合的3' 磷酸基团和一个5'磷酸基团。非TOPO载体的线性载体(TA和Blunt)含有一个3' OH基团和一个5'磷酸基团。磷酸化产物在进行TOPO-克隆之前应该用磷酸酶(CIP)处理。