Axiom Soybean Genotyping Array(也称为 Axiom SoyaSNP 96-Array Plate)包括180,961个标记,适用于对栽培的和野生的大豆品种进行基因分型。该阵列是在 Affymetrix Expert Design Program 计划下,韩国生物科学和生物技术研究所(Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology,以下简称 KRIBB)、农村发展管理局 (Rural Development Administration) 和国家作物科学研究所 (National Institute of Crop Science) 合作设计。SNP 序列由 Soon-Chun Jeong 博士、Namshin Kim 和 Jung-Kuyng Moon 博士提供。
大豆是世界范围内膳食蛋白质和油脂的重要来源。Axiom Soybean Genotyping Array 含有野生和栽培的大豆标记,是全基因组关联研究和高密度遗传作图的理想选择,可确定野生和栽培大豆种质中的重要适应性基因。
Axiom Soybean Genotyping Array 的特点•
综合内容:该阵列包括180,961个横跨以下基因组的标记:
- 114,735个 SNP 或总标记的63.4%分布在40,631个基因中。
- 22,952个 SNP 分布在基因的5个千碱对上游或下游内 13,259个区域
- 43,274个 SNP 分布在基因间隔区。
- 使用一组不同的大豆种质完成 SNP 发现和验证。
Axiom Soybean Genotyping Array 的应用•
复杂性状研究和分子育种 - 进行 GWAS 和精细作图
- 确定性状是否具有经济意义
- 构建高分辨率遗传图谱,检测基因组结构中的自然变异
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分子育种 - 对大豆育种计划进行关联分析和基因组选择
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种群和进化遗传学 - 区分不同来源的大豆种群
- 区分栽培和野生种群
必备产品Axiom 分析套件GeneChip 命令行控制台软件GeneTitan 多通道仪器