Axiom™ 珊瑚-藻类基因分型阵列（384HT 形式）

Axiom 珊瑚-藻类基因分型阵列 (Axiom AcropSNP) 是与 Dr.Iliana Baums 和宾夕法尼亚州立大学 Baums 实验室合作设计的。该阵列旨在根据选择用于解析宿主（基因）和共生体（菌株）多位点基因型的单核苷酸多态性 (SNP) 位点，共同分析珊瑚宿主 (Acropora) 和藻类共生体 (Symbiodiniaceae)。还选择了 SNP 以区分宿主种群，并以确定加勒比海顶孢目珊瑚杂种的血统。SNP 位点的一个子集可用于对太平洋顶孢子虫进行基因分型。

该阵列由来自珊瑚宿主的 53589 个 SNP 和来自藻类共生体的 4021 个 SNP 组成。该阵列也可提供 mini-96 形式。

Baums 实验室在称为 Acroporid 基因分型标准工具 (STAG) 的工作流程中结合了基于这些 SNP 标记产生宿主多位点基因型的分析工具。STAG 工作流程和数据库包含在定制的 Galaxy 环境中，其允许一致地鉴别宿主基因和共生菌株，并可作为未来开发其他珊瑚属阵列的模板。

参考文献
1.Kitchen SA、Ratan A、Bedoya-Reina OC 等人。受威胁鹿角珊瑚间的基因变异。G3 (Bethesda)。2019;9(5):1633-1646.

2.Kitchen SA、Von Kuster G、Kuntz KLV 等人。STAGdb:30K SNP 基因分型阵列和鹿角珊瑚及其鞭毛藻共生体科学网关。Sci Rep.2020;10(1):12488.

所需产品
GeneChip 命令控制台软件
GeneTitan 多通道仪器
Axiom 分析套件软件