Axiom™ OVSNP60 基因分型阵列，384HT 规格

Axiom OVSNP60 基因分型阵列（384HT 规格）包含在自由放养白尾鹿体内鉴别的72,723个 SNP，是我们 Axiom 农业基因组学基因分型解决方案的组成部分，其所含的靶标基因组 DNA 均在 GeneTitan 多通道仪器上制备和处理。该自动化过程包括将 gDNA 与该高通量微阵列杂交，然后进行染色、洗涤、成像和输出基因分型数据以供进一步分析。

Axiom OVSNP60 基因分型阵列根据密歇根州自然资源部、爱荷华州立大学、威斯康星大学密尔沃基分校、得克萨斯农工大学金斯维尔分校凯撒克莱伯格野生动物研究所和 USGS 国家野生动物健康中心的意见设计。该阵列的开发得到了密歇根州自然资源部/密歇根州立大学联合野生动物疾病倡议与美国鱼类和野生动物服务多州保护基金的资助。

使用这种中等密度阵列可以使不同实验室生成的数据比通过其他标记（例如微卫星）生成的数据更容易比较，从而促进实验室之间的合作。

Axiom OVSNP60 基因分型阵列也具有96规格（货号551189），包含702,183个 SNP 的探针集。

阵列内容物
• 在白尾鹿体内鉴别的72,723个 SNP 的探针集，这些 SNP 均在使用来自15个州的这些物种的东方亚种的自由放养鹿在 Axiom OVSNP600 基因分型阵列（96规格）上筛选702,183个 SNP 后选出，还根据其是否属于质量结果较高的最佳和推荐类别进行选择且在鹿参考基因组 (PRJNA317745) 的骨架上均匀分布
• 包括圈养白尾鹿体内被确定为与 CWD 易感性可能相关的54个 SNP

应用
• 分配亲缘关系并解决个体间的关系
• 将个体分配至起源种群并量化杂交
• 区分圈养鹿和自由放养鹿
• 进行景观基因组学研究，以鉴别促进或限制鹿运动/种群联系的景观特征
• 获得曾与 CWD 易感性相关的 SNP 的基因型，并量化这些 CWD 相关变体在种群中的频率和分布

所需产品
GeneChip Command Console 软件
GeneTitan 多通道仪器
Axiom Analysis Suite 软件
Axiom 长格式导出工具 (AxLE)