GeneChip™ HT HG-U133+PM 阵列板
GeneChip™ HT HG-U133+PM 阵列板
Applied Biosystems™

GeneChip™ HT HG-U133+PM 阵列板

说明:符合行业标准的性能证明 GeneChip™ HT HG-U133+ PM 16-阵列板可利用与行业标准的 GeneChip 人类基因组 U133 Plus了解更多信息
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货号 901433
价格(CNY)
-
说明:符合行业标准的性能证明
GeneChip™ HT HG-U133+ PM 16-阵列板可利用与行业标准的 GeneChip 人类基因组 U133 Plus 2.0 阵列相同的内容,同时实现多份样品的高通量表达谱分析。*


GeneChip HT HG-U133+ PM 阵列板使您能够:
•测量超过 47,000 个转录本和变异的基因表达,每个样品包括超过 33,000 个充分表征的基因和 UniGene 簇
•通过对每个转录本进行多次独立测量,获得准确且可重现的数据

散点图代表每个阵列类型的中值 MAQC B - MAQC A 信号。高相关系数表明观察到的生物学特性类似度(图 1 和图 2)。

关键优势:
• 通过并行处理提高生产率和效率
   —在单个阵列板上处理16、24或96份样品
• 与检测盒式人类基因组 U133 Plus 2.0 阵列相同的行业前列性能和内容物
   —与前几次板式和盒式设计相比,信号和倍数发生显著变化
• 对每个转录本进行多次独立测量,增强您结果的可靠性
   —与单探针测量相比,可检测更多序列
• 便利包装
   —提供单独的16、24和96阵列板
   —包含所有的处理托盘

内容概况:
该阵列设计中使用的序列选自 GenBank™、dbEST 和 RefSeq。大多数序列簇创建自 UniGene 数据库(Build 133,2001 年 4 月 20 日),然后通过与其它一些公开可用的数据库(包括华盛顿大学 EST 追踪存储库和加州大学 Santa Cruz Golden Path 人类基因组数据库[2001 年 4 月发布])进行精细的分析和比较来改进。

一组额外的序列簇创建自 UniGene Build 159(2003 年 1 月 25 日),然后通过分析和与其它公开可用的数据库(包括华盛顿大学 EST 追踪存储库和 NCBI 人类基因组组装 [Build 31])进行比较来改进。进一步分析序列的正确定位、错误引物、错误成簇、选择性剪接和选择性聚腺苷酸化。

*GeneChip GeneChip HT HG-U133+ PM 阵列板引入了两项设计更改:
•仅保留检测盒式设计中的完美匹配 (PM) 探针,同时去除了错配 (MM) 探针。
•经验数据用于选择性能较佳的探针,从而减少 PM 探针数量
   —42,461个探针集从11个探针减少到九个探针
   —六个探针集从11个探针减少到10个探针
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
规格
产品线GeneChip™
数量1 kit
类型HT HG-U133+PM 阵列板
数组转录组谱分析
产品规格16 阵列板
阵列数量16 阵列板
种属
Unit SizeEach

常见问题解答 (FAQ)

Is the hybridization mix for cartridges the same as the hybridization mix for PEG arrays (array plates)?

The hybridization mix for PEG arrays is different from the hybridization mix for cartridges. The concentrations of the hybridization mix are different and in addition, DMSO is not added into the hybridization mix for PEG arrays because it can affect the glue that holds the PEG to the plate.

How long does it take to scan the plate?

96 arrays = 4-4.6 hours
24 arrays = 1.5-2 hours

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If I have cartridges, can I move to PM only arrays in the middle of my project?

No, continue to finish products using the same procedures and products. New projects can be moved to PM only arrays.

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What QC metrics will I use to assess the quality of my data?

Mean absolute relative log expression: MA (RLE)
-Detection of 20X spikes, Bio B, Bio C, Bio D & Cre
-House keeping controls
-Poly A controls
-Antigenomic GC - 12 background probes
-PM mean

Please refer to the QC Metrics for Human, Mouse and Rat HT PM Array Plates QRC for more information (http://tools.thermofisher.com/content/sfs/manuals/ hmr_qc_metrics_qrc.pdf).

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Which algorithm do I use to run the analysis for these new HT PM Plate Arrays?

We recommend running the RMA algorithm in the Transcriptome Analysis Console (TAC).

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