Alexa Fluor™ 488 叠氮化物(Alexa Fluor™ 488 5-甲酰胺-(6-叠氮基己基),双(三乙铵盐)),5-异构体
Alexa Fluor™ 488 叠氮化物(Alexa Fluor™ 488 5-甲酰胺-(6-叠氮基己基),双(三乙铵盐)),5-异构体
Invitrogen™

Alexa Fluor™ 488 叠氮化物(Alexa Fluor™ 488 5-甲酰胺-(6-叠氮基己基),双(三乙铵盐)),5-异构体

绿色荧光 Alexa Fluor® 488 叠氮化物可通过铜催化的点击反应与末端炔烃发生反应。除了作为与流式细胞分析、显微镜和 HCS 配合使用的极为明亮且光稳定的荧光基团外,Alexa Fluor®了解更多信息
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绿色荧光 Alexa Fluor® 488 叠氮化物可通过铜催化的点击反应与末端炔烃发生反应。除了作为与流式细胞分析、显微镜和 HCS 配合使用的极为明亮且光稳定的荧光基团外,Alexa Fluor® 488 还可作为生物正交或生物学独特的半抗原用于需要信号放大的应用。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。
规格
化学反应性炔烃
检测方法荧光
发射519
激发495
产品规格实心
标签或染料Alexa Fluor™ 488
分子量861.04 g/mol
产品类型叠氮化物
数量0.5 mg
反应一部分胺、叠氮化物
运输条件室温
溶解度DMF(二甲基甲酰胺)、DMSO(二甲亚砜)
系统类型Click-iT™
颜色绿色
标签类型Alexa Fluor 染料
产品线Alexa Fluor, Molecular Probes
Unit SizeEach
内容与储存
储存于 ≤-20°C 下的避光干燥处。

常见问题解答 (FAQ)

我发现自己的点击标记样品无信号或特异性信号非常低,如何提高信号?

•当铜离子在合适的化合价时,点击反应才有效。除了DIBO炔烃-叠氮化物反应外,在缺乏铜离子的条件下,叠氮化物和炔烃不会相互反应。确保在制备之后、二价铜(II)浓度最高时,立即使用点击反应混合物。
•不要使用已经变黄的添加剂缓冲液;其必须无色状态下才有活性。
•为确保TdT酶和点击反应试剂能够到达核内,细胞需要充分地固定和通透。为确保有足量的TdT能进入,组织样品需要用蛋白酶K或其他蛋白水解酶消化。
•部分试剂能结合到铜离子上,并减少其足以催化点击反应的有效浓度。click反应前,不要在任何缓冲液或试剂中引入任何金属螯合剂(例如EDTA、EGTA、柠檬酸盐等)。避免缓冲液和试剂中引入其他可能被氧化或还原的金属离子。进行click反应前,可能需要向细胞或组织样品加入额外的洗涤步骤。
•您可以用新鲜的试剂再次进行点击反应,从而提高信号。将点击反应的时间延长至超过30分钟,并不会提高信号。用新鲜的点击反应试剂再次进行30分钟的孵育,可更有效地提高标记效率。
•自己的细胞可能没有凋亡。准备一份DNase I处理的阳性对照,验证TdT酶反应和点击标记反应是否正确进行。

我对自己的Click-iT EdU TUNEL标记样品成像时,观测到较高的非特异性本底。这是什么原因造成的?如何降低本底干扰?

click反应在叠氮化物和炔烃类间极具选择性。生物体系不可能有其他副反应。任何非特异性背景都是由于染料和多种细胞内组分的非共价连接。Select FX信号增强剂在click反应后减少染料的电荷为基础的非特异性连接方面效果不明显;我们不推荐将其与Click-iT检测试剂一同使用。最佳的减少背景的方法是增加BSA清洗的次数。你应该在同样的过程和检测条件下做无染料或无click反应对照,以证实背景确实是由于染料而不是自发荧光。你同时应该在无TdT酶的对照样品进行完整的click反应来证实click反应信号的特异性。 

我注意到,当我在click反应后用DAPI染色细胞并检测EdU的掺入时,相比于我的无click反应对照样品,DAPI信号非常低。是什么原因导致DAPI信号降低?

click反应中的铜离子使得DNA少量变性(虽然没有BrdU检测所需要的程度),这会影响到包括DAPI和Hoechst染色剂在内的DNA染料的结合亲和力。这种影响只会在传统的EdU试剂盒中出现,而Click-iT Plus EdU试剂盒由于采用的铜离子浓度低,不会出现这种现象。 

我观测到自己的的click标记样品无信号或信号非常低,如何提高信号?

•当铜离子在合适的化合价时,点击反应才有效。除了DIBO炔烃-叠氮化物反应外,在缺乏铜离子的条件下,叠氮化物和炔烃不会相互反应。确保在制备之后、二价铜浓度最高时,立即使用点击反应混合物。
•不要使用已经变黄的添加剂缓冲液;其必须无色状态下才有活性。
•细胞需要充分固定和通透,确保click试剂能充分接触到细胞内已掺入click底物的成分。
•部分试剂能结合到铜离子上,并减少其足以催化点击反应的有效浓度。click反应前,不要在任何缓冲液或试剂中引入任何金属螯合剂(例如EDTA、EGTA、柠檬酸盐等)。避免缓冲液和试剂中引入其他可能被氧化或还原的金属离子。进行click反应前,可能需要向细胞或组织样品加入额外的洗涤步骤。
•你可以用新鲜的实验试剂重复click反应尝试提高信号。增加click反应的时间长于30分钟不会提高低的信号。用新鲜的click反应试剂进行第二次30分钟培养在提高标记上更加有效。
•低信号同时也可能是因为EdU、EU和其他click底物的掺入水平较低。如果无法进行充分交联或使用的固定剂有误,其他掺入到细胞组件的click底物(如AHA、HPG、棕榈酸、叠氮化物等)可能会丢失。对于掺入到细胞膜或脂质的click底物,应避免使用乙醇或丙酮固定剂和透化试剂。
•在click反应时,掺入的click底物必须可被接触;相比于变性蛋白,天然蛋白中掺入的氨基酸模拟物的标记水平可能更低。
•你可能需要优化代谢标记条件,包括模拟物孵育时间和浓度。健康的、传代数不高、不太密集的细胞可能更容易掺入模拟物。如果孵育时间达到关注的细胞数目翻倍的时间,则应在多个整倍时间点设置包含额外剂量的click底物的阳性对照。

当我分析click标记样品时,观测到较高的本底干扰,这是什么原因所致?如何减少本底干扰?

click反应在叠氮化物和炔烃类间是非常有选择性的。生物体系不可能有其他副反应。任何非特异性本底都是由于染料和多种细胞组件的非共价结合造成的。在click反应后,Select FX信号增强剂在减少染料非特异性电荷连接方面的作用失效;我们不推荐将其与Click-iT检测试剂一同使用。减少本底干扰的最佳方法是增加BSA洗涤的次数。您应始终在同等的处理和检测条件下做无染料或无click反应对照,以证实本底确系染料而非自发荧光所致。此外,您还可在无EdU 或无-EU,仅含溶剂的对照样本上进行完整的click反应,验证click反应信号的特异性。 

引用和文献 (15)

引用和文献
Abstract
Monomethylation of histone H4-lysine 20 is involved in chromosome structure and stability and is essential for mouse development.
Authors:Oda H, Okamoto I, Murphy N, Chu J, Price SM, Shen MM, Torres-Padilla ME, Heard E, Reinberg D,
Journal:Mol Cell Biol
PubMed ID:19223465
'PR-Set7/Set8/KMT5A is the sole enzyme known to catalyze monomethylation of histone H4 lysine 20 (H4K20) and is present only in multicellular organisms that compact a large fraction of their DNA. We found that mouse embryos that are homozygous null mutants for the gene PR-Set7 display early embryonic lethality prior to ... More
Cell type specific applicability of 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) for dynamic proliferation assessment in flow cytometry.
Authors:Diermeier-Daucher S, Clarke ST, Hill D, Vollmann-Zwerenz A, Bradford JA, Brockhoff G,
Journal:Cytometry A
PubMed ID:19235202
'Using the nucleoside analogue EdU (5-ethynyl-2''-deoxyuridine) for thymidine substitution instead of BrdU (5-bromo-2''-deoxyuridine) in cell proliferation assays has recently been proposed. However, the effect of EdU on cell viability, DNA synthesis, and cell cycle progression and consequently its usability for dynamic cell proliferation analysis in vitro has not been explored. ... More
Imaging and analysis of 3D tumor spheroids enriched for a cancer stem cell phenotype.
Authors:Robertson FM, Ogasawara MA, Ye Z, Chu K, Pickei R, Debeb BG, Woodward WA, Hittelman WN, Cristofanilli M, Barsky SH,
Journal:J Biomol Screen
PubMed ID:20639504
'Tumors that display a highly metastatic phenotype contain subpopulations of cells that display characteristics similar to embryonic stem cells. These cells exhibit the ability to undergo self-renewal; slowly replicate to retain a nucleoside analog label, leading to their definition as ' ... More
New strategy for synthesis of mercaptoundecahydrododecaborate derivatives via click chemistry: possible boron carriers and visualization in cells for neutron capture therapy.
Authors:El-Zaria ME, Nakamura H,
Journal:Inorg Chem
PubMed ID:19928788
'A new method that utilizes the click cycloaddition reaction to functionalize B(12)H(11)SH(2-) (BSH) with organic molecules was investigated. S,S-Dipropargyl-SB(12)H(11)(-) (1) and S-propargyl-SB(12)H(11)(2-) (4) were prepared from [(CH(3))(4)N](2)B(12)H(11)SH and [(CH(3))(4)N](2)B(12)H(11)S(CH(2))(2)CN (2) with propargyl bromide, respectively. Compound 1 or 4 reacted with various azides with mediation by Cu(II) ascorbate to give the ... More
Cell cycle synchronization of Escherichia coli using the stringent response, with fluorescence labeling assays for DNA content and replication.
Authors:Ferullo DJ, Cooper DL, Moore HR, Lovett ST,
Journal:Methods
PubMed ID:19245839
'We describe a method for synchronization of the cell cycle in the bacterium Escherichia coli. Treatment of asynchronous cultures with the amino acid analog, dl-serine hydroxamate, induces the stringent response, with concomitant arrest of DNA replication at initiation. Following release of the stringent response, cells initiate DNA replication in synchrony, ... More