Oncomine™ 免疫应答研究检测试剂盒是一种靶基因表达检测试剂盒，设计用于 Ion™ 下一代测序 (NGS) 平台。该泛癌种基因表达检测试剂盒旨在研究肿瘤微环境，以便在回顾性或前瞻性临床试验研究队列中进行机制研究和识别免疫疗法的预测性生物标志物。该检测试剂盒经过优化可测定参与肿瘤免疫相互作用的基因的表达，包括参与炎症信号转导的低表达基因。

该检测试剂盒包含手动文库构建所用的试剂以及一组用于进行多重 PCR 的引物库，以便利用福尔马林固定-石蜡包埋 (FFPE) 样品进行扩增子文库的制备。该检测试剂盒可定量评估与不同白细胞亚群、抗原表达、检查点信号通路以及肿瘤进展相关的标志物的表达。该 400 基因检测试剂盒采用用户友好的信息学工作流程，对FFPE 样品的低表达转录本具有高灵敏度（索取基因列表）。Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒利用 Ion AmpliSeq™ 技术提供低至 10 ng 的总 RNA 结果，以确保从具有挑战性的 FFPE 样品中获得稳定的检测性能。

试剂盒工作流程
Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒手动工作流程的特点是在 Ion S5™ 和 Ion PGM™ 测序系统行进行高通量样品多重检测。整个工作流程（从样品提取到获得结果）只需不到 48 小时即可完成。备注：可提供替代的检测试剂盒（Cat.No. A32928）用于在自动模式下，使用 Ion Chef™ 系统进行 Ion AmpliSeq 文库的制备。

检测性能
• 能够对不同类型实体瘤的基因表达进行高重复性、高灵敏度检测
• 少量样本输入（10 ng 的总 RNA 材料）
• 对低表达信号转导分子（如白介素和干扰素γ）进行高灵敏度检测
• 高通量样品多重检测，非常灵活，一次可运行 8 个样品
• 高效的工作流程，不到 48 小时就能获得样品结果
• 自动化、无缝集成式分析解决方案
• 利用基因和信号通路的功能注释，解读免疫监视和肿瘤进展机制

信息学
Oncomine 免疫应答研究检测试剂盒附带经过优化的信息学和可视化软件，能够尽量降低数据分析的复杂性。分析工作流程包括数据探索组件（由免疫应答 Torrent Suite™ 插件自动操作）以及两组差分分析（由 Affymetrix™ 转录组分析控制台 (TAC) 提供）。这些工具简化了常见基因表达分析过程并提供了可输出数据文件，这些文件可采用其他第三方软件进一步探索。具体而言，这些工具可提供：
•质控指标和看家基因的表达，使数据合格
• 采用用户定义的基因集合或检测板上的所有基因，对样品进行分层集群
• 利用 PCA、热图以及基因表达分布图进行可视化
• 使用丰度关联图进行样品关联
• 以易于使用的表式数据格式 (TAC) 估计幅度变化
• 火山图，以显示差异基因 (TAC)