质谱可切割交联剂

化学交联结合质谱分析是改善蛋白质表征和鉴别蛋白-蛋白相互作用的有效方法。该方法已应用于重组和天然蛋白复合物，并且最近已应用于全细胞裂解物或完整的单细胞生物，以在全局规模内鉴别蛋白-蛋白相互作用。DSSO 和 DSBU 中可切割性的较近增强提高了 MS 兼容性以及检测交联肽和蛋白质的灵敏度。

• 高度反应性 NHS 酯（两端）与伯胺
• 可通过碰撞诱导解离 (CID) 进行 MS 切割
• 高纯度结晶试剂，用于蛋白质结构和相互作用表征
• 半透膜，可用于细胞内交联
• 不溶于水（首先溶于 DMF 或 DMSO）

DSSO（双琥珀酰亚胺亚砜）和 DSBU（二琥珀酰亚胺二丁基脲）（或 BuUrBU）是 MS 可切割和半透膜交联剂，在 7 碳原子间隔臂 (DSSO) 或 11 原子间隔臂 (DSBU) 的每个末端均含有一个胺反应性 N-羟基琥珀酰亚胺 (NHS) 酯。两种交联剂与 DSS 具有相似的反应性，但在连接区具有可切割功能，在串联 MS(MS/MS) 片段化期间，可使用碰撞诱导解离 (CID) 在气相中进行切割。DSSO 或 DSBU 的 MS 切割在 MS2 期间生成诊断离子双联体，能够鉴定来自死端修饰的交联肽。随后，使用 MeroX 或 XlinkX 软件鉴定交联肽片段。对于 DSSO，MS/MS 期间切割交联肽的能力使得可使用 MS3 采集方法，通过传统数据库搜索引擎促进肽测序。

备注：要对交联肽进行高分辨率分析，推荐用于 Nanospray Flex 源的 LC 色谱柱是 Acclaim PepMap 100 C18 LC 色谱柱（货号 164940 或 164568）。对于 EASY-Spray 离子源，推荐 LC 色谱柱为 EASY-Spray C18 LC 色谱柱（货号 ES900 或 ES904）。