Oncomine™ TCR Beta-LR 检测
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Oncomine™ TCR Beta-LR 检测

Oncomine TCR Beta-LR 检测设计用于测序 T 细胞受体 β 链重排、测量 T了解更多信息
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货号数量
A3538624 份样品
货号 A35386
价格(CNY)
-
数量:
24 份样品
Oncomine TCR Beta-LR 检测设计用于测序 T 细胞受体 β 链重排、测量 T 细胞多样性和克隆扩增。本检测利用了在 Ion GeneStudio S5 下一代测序系统上新开发的长读长测序技术。该检测试剂盒提供了单个多重 PCR 引物、文库试剂和样品条形码库组合。Ion AmpliSeq 文库可通过诸如从全血、新鲜冷冻组织或 FACS 分选细胞中提取的 RNA 等研究样品生成 Ion AmpliSeq 文库。

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该检测旨在高效捕获 TCR β 链 (CDR1, CDR2, CDR3) 的所有三个互补决定区,具有较高的准确度。它可实现关键应用,如预测或预后生物标志物发现、T 细胞表征和可变基因多态性的鉴定。可使用灵活的 RNA 起始量(最低 10 ng,最高 1 μg)来鉴定罕见的高丰度克隆。使用 RNA 模板可实现对生产和相关变量 (V)、多样性 (D) 和连接 (J) 重排进行测序—改进罕见克隆的鉴定。

备注:有关使用 Ion Reporter 软件 v5.6 进行数据分析的信息,请参阅下面的用户指南。

Oncomine TCR Beta-LR 检测的优势包括:
•长读 RNA 测序(最多 400 bp 扩增子长度)全面覆盖 TCR β 链
•广泛的动态范围内的克隆检测
•通过 Ion AmpliSeq 技术生成的无偏移输出
•有效的工作流程,从样品到结果所需时间为 48 h
•灵活的起始量要求,范围为 10 ng 至 1 μg
•与多种研究样品类型兼容,包括新鲜冷冻组织、全血和分选细胞
•简化和用户友好的信息学解决方案,具有多样品分析功能

为什么免疫学者和免疫肿瘤学家对 T 细胞所有组成部分测序研究感兴趣?
•表征血液和浸润肿瘤中 T 淋巴细胞的多样性并监测其特点
•确定与自体免疫疾病或免疫介导的不良反应有关的变体基因多态性
•优化治疗或工程化 T 细胞的生产和功能

与其他技术不同,Oncomine TCR Beta-LR 检测可提供:
•长读测序,能够全面覆盖 TCR β 链
•通过卓越的多重 PCR 设计实现高准确度和灵敏度
•使用极低起始量 RNA (10 ng) 作为起始材料
•每样品具有高倍增和低成本,能够实现大规模研究
•通过快速周转时间加快发现周期

整个工作流程(下图),从 RNA 分离到样品分析,可使用 Ion Chef 模板制备系统和 Ion S5 或 Ion S5 XL 测序系统在两天内完成。

仅供科研使用。不可用于诊断程序。
规格
适用于(应用)测序
样品数量24
产品线Ion AmpliSeq™
产品类型TCR Beta-LR 测定试剂盒
数量24 份样品
运输条件可在室温下或者干冰上运输
Unit SizeEach
内容与储存
• Oncomine TCR Beta-LR 检测板,在冰箱中储存(-5 至 -30°C)
• Ion AmpliSeq 文库试剂盒 Plus,在冰箱中储存(-5 至 -30°C)
• Ion AmpliSeq Select 条形码,在冰箱中储存(-5 至 -30°C)

常见问题解答 (FAQ)

What control do you recommend using with the Oncomine TCR Beta-LR Assay?

We recommend using T Cell Leukemia (Jurkat) Total RNA (Cat. No. AM7858) as a control. T cell Leukemia (Jurkat) Total RNA is derived from a cell line consisting of a single T cell clonotype. Running the Oncomine TCR Beta-LR Assay on Jurkat Total RNA should enable detection of a single clonotype.

Are there any BED files for the Oncomine TCR Beta-LR Assay?

Unlike other AmpliSeq panels, there are no BED files and no reference is needed. All downstream analysis takes place in Ion Reporter Software.

Can I quantitate the Oncomine TCR Beta-LR Assay library with the Ion Library Equalizer Kit?

We have tested the Ion Library Equalizer Kit with this kit for library quantitation and it does function, but manually balancing library input into the Ion Chef instrument is preferred.

What version of Torrent Suite Software and Ion Reporter Software can be used with the Oncomine TCR Beta-LR Assay?

Torrent Suite Software 5.6 and Ion Reporter Software 5.6 are needed to generate reports. In Torrent Suite Software 5.6, two Planned Run templates are provided for use with the Oncomine TCR Beta-LR Assay.

Can I run the Oncomine TCR Beta-LR Assay on the Ion PGM System?

The Oncomine TCR Beta-LR Assay has been developed and verified for use on the Ion GeneStudio S5 Series System. The assay can be used with the Ion PGM System, however, this instrument configuration is not supported.