Oncomine™ 肿瘤突变负荷检测试剂盒，手动文库制备

货号	数量
A37909	24 samples

货号 A37909

价格（CNY)

24 samples

Oncomine 肿瘤突变负荷检测试剂盒是一种下一代测序 (NGS) 靶向检测试剂盒，可通过简单的工作流程中获得肿瘤突变负荷和突变特征评估。该检测试剂盒提供两组多重 PCR 引物的文库构建试剂，以便利用福尔马林固定-石蜡包埋 (FFPE) 肿瘤样本进行扩增子文库的制备，无需为了降低成本而凑齐样品，每引物池只需使用 10 ng DNA。该检测试剂盒旨在帮助成功选择和识别很有可能在癌症免疫疗法研究中获得应答的样本。

特征：
•能够准确定量体细胞突变以评估肿瘤突变负荷
• 单肿瘤样本工作流程，无需为了降低成本而凑齐样品
• 利用 AmpliSeq 技术，对具有挑战性的样品进行高效扩增
• 利用功能齐全的可视化，简化分析
• 高效多重检测，每 Ion 540 Chip 可运行 8 个样品（使用 Ion S5 系统）

Oncomine 肿瘤突变负荷检测试剂盒（手工文库制备）中的引物和试剂足够用于 24 个样品的文库构建。文库与 Ion Chef 系统上的自动模板制备和芯片加载兼容。有关使用 Ion Chef 系统进行自动文库制备，请参见Cat.No. A37910。

从样本到结果
Oncomine 肿瘤突变负荷检测试剂盒配备优化的信息学和可视化软件，可提供样本到结果的解决方案。使用 Torrent Suite 插件评估运行指标。Ion Reporter 分析工作流程采用定制的变体识别和胚系变异过滤算法，可准确估算癌症研究样本中的体细胞突变。可提供详细报告，其中包括体细胞突变的标准化突变负荷（突变/MB）和突变特征，包括与紫外线损伤、烟草损伤、脱氨作用和特异性替代一致的突变百分比。

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适用于（设备）Ion GeneStudio S5 系统、Ion S5™ XL 系统

库靶向测序文库

产品类型肿瘤突变负荷检测试剂盒

数量24 samples

测序类型基因组 & DNA 测序

运输条件干冰

通量24 个样本

工作流程步骤文库生成

产品线Oncomine™

原始材料DNA

Unit SizeEach

内容与储存

• 1 Oncomine 肿瘤突变负荷检测，可供 24 次反应，储存于 -5 至 -30°C。
• 1 Ion AmpliSeq Library Kit Plus，可供 24 次反应，储存于 -5 至 -30°C。

常见问题解答 (FAQ)

With the Oncomine Tumor Mutation Load Assay, do I need to adjust the PCR cycles based on sample type?

No, the Oncomine Tumor Mutation Load Assay is optimized for use with FFPE tissue. The in-house development of the assay specifically focused on three tissue types: melanoma, lung, and colon.

In the Oncomine Tumor Mutation Load Assay, can I get the total variant calls (i.e., not just somatic)?

Yes, total variant calls are quantified and reported by the Oncomine Tumor Mutation Load Assay workflow and a .vcf file of all called variants is available to download in the user interface.

In the Oncomine Tumor Mutation Load Assay, does the germline filter cover across different ancestry types?

Yes, germline filters cover across different ancestry types. They are not ethnicity-based, but are global population-based.

Can the Oncomine Tumor Mutation Load Assay (TML) workflow 2.0 be edited to run on other panels (such as Oncomine Comprehensive Assay v3)?

Yes, by following the instructions in the appendix of the User guide (https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0015885_OncomineComprehensiveAssay_v3_UG.pdf).

Can I run the Oncomine Comprehensive Assay BAM file through the Ion Reporter workflow for the Oncomine Tumor Mutation Load (TML) Assay?

Yes, Oncomine Comprehensive Assay BAM files can be used with the Oncomine TML workflow. Targets that are not in Oncomine TML workflow will just be discarded during the analysis.