我观测到自己的的click标记样品无信号或信号非常低,如何提高信号?
•当铜离子在合适的化合价时,点击反应才有效。除了DIBO炔烃-叠氮化物反应外,在缺乏铜离子的条件下,叠氮化物和炔烃不会相互反应。确保在制备之后、二价铜浓度最高时,立即使用点击反应混合物。
•不要使用已经变黄的添加剂缓冲液;其必须无色状态下才有活性。
•细胞需要充分固定和通透,确保click试剂能充分接触到细胞内已掺入click底物的成分。
•部分试剂能结合到铜离子上,并减少其足以催化点击反应的有效浓度。click反应前,不要在任何缓冲液或试剂中引入任何金属螯合剂(例如EDTA、EGTA、柠檬酸盐等)。避免缓冲液和试剂中引入其他可能被氧化或还原的金属离子。进行click反应前,可能需要向细胞或组织样品加入额外的洗涤步骤。
•你可以用新鲜的实验试剂重复click反应尝试提高信号。增加click反应的时间长于30分钟不会提高低的信号。用新鲜的click反应试剂进行第二次30分钟培养在提高标记上更加有效。
•低信号同时也可能是因为EdU、EU和其他click底物的掺入水平较低。如果无法进行充分交联或使用的固定剂有误,其他掺入到细胞组件的click底物(如AHA、HPG、棕榈酸、叠氮化物等)可能会丢失。对于掺入到细胞膜或脂质的click底物,应避免使用乙醇或丙酮固定剂和透化试剂。
•在click反应时,掺入的click底物必须可被接触;相比于变性蛋白,天然蛋白中掺入的氨基酸模拟物的标记水平可能更低。
•你可能需要优化代谢标记条件,包括模拟物孵育时间和浓度。健康的、传代数不高、不太密集的细胞可能更容易掺入模拟物。如果孵育时间达到关注的细胞数目翻倍的时间,则应在多个整倍时间点设置包含额外剂量的click底物的阳性对照。
•不要使用已经变黄的添加剂缓冲液;其必须无色状态下才有活性。
•细胞需要充分固定和通透,确保click试剂能充分接触到细胞内已掺入click底物的成分。
•部分试剂能结合到铜离子上,并减少其足以催化点击反应的有效浓度。click反应前,不要在任何缓冲液或试剂中引入任何金属螯合剂(例如EDTA、EGTA、柠檬酸盐等)。避免缓冲液和试剂中引入其他可能被氧化或还原的金属离子。进行click反应前,可能需要向细胞或组织样品加入额外的洗涤步骤。
•你可以用新鲜的实验试剂重复click反应尝试提高信号。增加click反应的时间长于30分钟不会提高低的信号。用新鲜的click反应试剂进行第二次30分钟培养在提高标记上更加有效。
•低信号同时也可能是因为EdU、EU和其他click底物的掺入水平较低。如果无法进行充分交联或使用的固定剂有误,其他掺入到细胞组件的click底物(如AHA、HPG、棕榈酸、叠氮化物等)可能会丢失。对于掺入到细胞膜或脂质的click底物,应避免使用乙醇或丙酮固定剂和透化试剂。
•在click反应时,掺入的click底物必须可被接触;相比于变性蛋白,天然蛋白中掺入的氨基酸模拟物的标记水平可能更低。
•你可能需要优化代谢标记条件,包括模拟物孵育时间和浓度。健康的、传代数不高、不太密集的细胞可能更容易掺入模拟物。如果孵育时间达到关注的细胞数目翻倍的时间,则应在多个整倍时间点设置包含额外剂量的click底物的阳性对照。