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吸光值测定经常遇到的一个问题是样本的浑浊度。(这可能是由于纯化柱内的树脂残留引起的。)如果在比色皿内有不溶物(经常是肉眼不可见的),大部分的UV光将不被吸收而是被散射,导致出现一个假性的高UV吸收值(例如在260或280 nm)。如果你的A260很高,我们建议你检测A320以确定是否在样本内存在树脂。你也可以试试离心或过滤(使用0.2 µm滤膜)你的样本以去除残留的树脂然后重新测定浓度。
是的,我们推荐购买PureLink HiPure BAC缓冲液试剂盒(Cat. No. K210018)。你需要加入的RNase量将少于该试剂盒内R3缓冲液瓶上标明的RNase量。瓶上标明加入5.6mL的RNase A。这对于BAC纯化实验是正确的量,但是,如果你进行的是标准质粒提取,那么应加入1.4 mL RNase A。
HiPure试剂盒可以从DNA中去除包括内源性核酸酶在内的所有蛋白。对于硅膜法的PureLink Quick Plasmid Miniprep试剂盒,我们建议使用洗涤缓冲液W10进行一步额外的洗涤步骤以去除内源性核酸酶。这一溶液与HiPure系统不兼容,不能用于HiPure试剂盒。此外,可以将洗脱后的溶于TE中的DNA在70°C加热10分钟。这样做可以使任何污染的核酸酶发生热失活。
当质粒DNA出现切口和/或永久变性时,就会有额外的条带出现。在电泳时,带有切口(共价键断裂)的质粒DNA比超螺旋DNA的迁移速率慢。少量的此种类型的DNA存在是正常的而且并不影响下游应用。永久变性的DNA比超螺旋质粒迁移更快并且可能不适合下游应用。确保裂解反应不能超过5分钟。
我们有时会观察到这种现象。这些颗粒不会影响DNA的质量。这些颗粒可以通过在12,000 x g离心1分钟去除。