pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒,含 One Shot™ TOP10 化学感受态大肠杆菌
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Invitrogen™

pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒,含 One Shot™ TOP10 化学感受态大肠杆菌

pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒利用高效的 5 分钟克隆策略(“TOPO™ 克隆”)将平末端 PCR 产物定向克隆成为进入 Gateway™了解更多信息
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pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒利用高效的 5 分钟克隆策略(“TOPO™ 克隆”)将平末端 PCR 产物定向克隆成为进入 Gateway™ 系统或 MultiSite Gateway™ 系统的载体。平末端 PCR 产物以高于 90% 的效率定向克隆,不需连接酶、PCR 后程序或限制性内切酶。

该试剂盒包含克隆和选择关注的 PCR 扩增基因所需的一切:

Gateway™ 系统就绪—在多个载体系统之间快速运送克隆基因
快速简便—仅需 3 个步骤和短短 ∼5 分钟的实操时间即可完成从 PCR 到 Gateway™ 入门克隆的过程
高效—通过在正确方向插入正确片段达到超过 90% 的克隆
成熟—十年可靠性能

pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒概述

VECTOR:

pENTR™/D-TOPO™ 载体用于进入 Gateway 系统的定向克隆载体

克隆方法

定向 TOPO™ 克隆通过基于拓扑异构酶 I 的 ∼5 分钟定向连接,将平末端校正聚合酶扩增 PCR 产物连接到载体

感受态细胞

两个选项从包含高效率或快速生长感受态细胞的试剂盒中进行选择
轻松进入 Gateway™ 系统
为了进入 Gateway™ 系统,只需通过 PCR 扩增关注的基因并将产物直接添加到提供的拓扑异构酶带电荷 pENTR™/D-TOPO™ 载体,孵育 5 分钟并转换提供的感受态大肠杆菌细胞。得到的包含 Gateway™ 入门克隆的 attL 已做好高效重组的准备,有 Gateway™ 目的载体可供选择。

优化的 pENTR™/D-TOPO™ 载体
pENTR™/D-TOPO™ 载体(图 1)的 PCR 产物插入位点两侧包括 M13 和 T7 引物测序位点和 attL 重组位点。这就可以方便地对克隆进行序列验证并将它们重新组合到含有 Gateway™ 目标载体的各种 attR 中。卡那霉素抗性基因和 pUC 复制区序列用于大肠杆菌中的选择和高拷贝增殖。

简化的定向克隆
借助定向 TOPO™ 克隆技术,无需 PCR 纯化、载体制备或者其他耗费大量时间的 DNA 操作步骤。只需将 PCR 反应产物直接添加至提供的拓扑异构酶带电载体中,孵育 5 分钟,转化并获得高达 90% 的定向插入克隆。具有四个碱基序列的载体对上四个碱基突出端设计为用于 PCR 反应的正向引物,以提供针对拓扑异构酶连接反应的方向性(图 2)。

Gateway™ 重组克隆技术的性能
Gateway™ 重组克隆技术避免限制性酶介导克隆的限制因素,使您能够在仅仅一小时内轻松进入几乎所有表达系统,效率达 99% 且可逆的 Gateway™ 重组反应。由于可以在不同载体之间移动相同的 DNA 序列,无需使用限制性内切酶、连接酶、亚克隆步骤、筛选无数菌落或重新测序,这将有助于您节省时间、金钱和精力。

领先的克隆技术
在克隆方面,TOPO™ 克隆技术和 Gateway™ 重组克隆技术十年来一直是成千上万科学研究人员的可靠伙伴。快速、简单易用且高效的 TOPO™ 克隆和 Gateway™ 重组功能可实现快速克隆和后续在不同分类的 Gateway™ 表达载体之间实现基因转移。

不同试剂盒选择
pENTR™/D-TOPO™ 克隆试剂盒可与 TOP10 感受态细胞一起采购用于标准克隆,或与 Mach1™-T1R 感受态细胞一起采购用于快速生长。

仅供研究使用。不适用于动物或人类的治疗或诊断。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。
规格
克隆方法定向 TOPO™
反应次数20 reactions
产品线One Shot
产品类型TOPO 克隆试剂盒
数量20 Reactions
载体pENTR
Unit SizeEach
内容与储存
pENTR™⁄D-TOPO™ 克隆试剂盒含有 pENTR⁄D-TOPO™ 载体、dNTP、盐溶液、无菌水、通用 M13 测序引物、OneShot™ TOP10 化学感受态大肠杆菌、S.O.C.培养基和 pUC19 对照质粒。将感受态大肠杆菌储存在 -80°C 下。将所有其他组分储存在 -20°C 下。

常见问题解答 (FAQ)

Gateway兼容的TOPO载体同时提供一个对照模板和对照引物。可否提供对照模板的序列吗?

对照模板的序列是受专利保护的。

我正在使用一个定向TOPO克隆载体对我的PCR产物进行克隆。我得到了很多克隆但是它们都带有反向插入的目的片段。我如何才能解决这一问题?

这里有一些可能的原因和建议:

•不正确的PCR引物设计:确保正向PCR引物在5′末端包含CACC序列。CACC序列和定向TOPO载体上的突出序列GTGG互补。
•反向PCR引物和5’末端的GTGG突出序列互补:确保反向引物在5′末端不包含CACC序列。
•使用具有热稳定性的有校对活性的聚合酶,如Accuprime Pfx DNA聚合酶(货号12344024)来获得平末端PCR产物。

使用BP克隆可以将多大的PCR片段和pDONR载体重组?对于TOPO-接头的入门载体也是一样吗?

理论上,pDONR载体在BP反应时对插入片段没有大小的限制。我们自己测试过的最大片段是12 kb。TOPO载体对插入片段大小更敏感一些,要获得较高的克隆效率其插入片段长度的上限是3-5 kb。

如何纯化attB-PCR产物?

在得到attB-PCR产物之后,我们建议对产物进行纯化以去除PCR缓冲液,残留的dNTP,attB引物,以及attB引物二聚体。引物和引物二聚体在BP反应中会高效的与供体载体重组,因而会增加转化E. coli时的背景,而残留的PCR缓冲液可能会抑制BP反应。使用酚/氯仿抽提,加醋酸铵和乙醇或异丙醇沉淀的标准PCR产物纯化方案不适合对attB-PCR产物进行纯化,因为这些实验方案通常仅能去除小于100 bp的杂质,而在去除较大的引物二聚体时效果不佳。我们推荐一种PEG纯化方案(请参见使用Clonase II的Gateway技术手册第17页)。如果使用上述实验方案您的attB-PCR产物仍然不够纯,您可以进一步对其进行凝胶纯化。我们推荐使用Purelink Quick 凝胶纯化试剂盒。

我的定向TOPO克隆反应效率很低,如何解决这一问题?

这里是一些提高定向TOPO克隆反应效率的建议:

•确保 5’引物带有–CACC而3’引物不含有类似于GTGG的序列。
•PCR产物:TOPO载体的摩尔比是成功的关键。我们建议使用1:1到2:1的摩尔比,从PCR产物:TOPO载体比值为1:1开始。当PCR产物:TOPO载体的摩尔比<0.1:1或>5:1时TOPO克隆效率将显著下降。这些结果通常是由于在TOPO克隆反应中使用了太少的PCR产物(例如PCR产物稀释过多)或者使用了过多的PCR产物造成的。如果对PCR产物的产量进行了定量,那么可能需要在进行TOPO克隆前对PCR产物浓度进行调整。对于pENTR TOPO载体而言,在TOPO克隆反应中使用1-5 ng的1 kb PCR产物或5-10 ng的2 kb PCR产物通常会得到较多数量的克隆。

引用和文献 (9)

引用和文献
Abstract
A novel type of deubiquitinating enzyme.
Authors:Evans PC, Smith TS, Lai MJ, Williams MG, Burke DF, Heyninck K, Kreike MM, Beyaert R, Blundell TL, Kilshaw PJ,
Journal:J Biol Chem
PubMed ID:12682062
A previous report from this laboratory described two novel proteins that have sequence similarity to A20, a negative regulator of NF-kappaB (Evans, P. C., Taylor, E. R., Coadwell, J., Heyninck, K., Beyaert, R., and Kilshaw, P. J. (2001) Biochem. J. 357, 617-623). One of these molecules, cellular zinc finger anti-NF-kappaB ... More
West Nile virus discriminates between DC-SIGN and DC-SIGNR for cellular attachment and infection.
Authors:Davis CW, Nguyen HY, Hanna SL, Sánchez MD, Doms RW, Pierson TC,
Journal:J Virol
PubMed ID:16415006
'The C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR bind mannose-rich glycans with high affinity. In vitro, cells expressing these attachment factors efficiently capture, and are infected by, a diverse array of appropriately glycosylated pathogens, including dengue virus. In this study, we investigated whether these lectins could enhance cellular infection by West Nile ... More
Identification of an antiangiogenic FGF2-binding site in the N terminus of the soluble pattern recognition receptor PTX3.
Authors:Camozzi M, Rusnati M, Bugatti A, Bottazzi B, Mantovani A, Bastone A, Inforzato A, Vincenti S, Bracci L, Mastroianni D, Presta M,
Journal:J Biol Chem
PubMed ID:16769728
'Long-pentraxin 3 (PTX3) is a soluble pattern recognition receptor with non-redundant functions in inflammation and innate immunity. PTX3 comprises a pentraxin-like C-terminal domain involved in complement activation via C1q interaction and an N-terminal extension with unknown functions. PTX3 binds fibroblast growth factor-2 (FGF2), inhibiting its pro-angiogenic and pro-restenotic activity. Here, ... More
The plant-specific kinase CDKF;1 is involved in activating phosphorylation of cyclin-dependent kinase-activating kinases in Arabidopsis.
Authors:Shimotohno A, Umeda-Hara C, Bisova K, Uchimiya H, Umeda M,
Journal:Plant Cell
PubMed ID:15486101
Cyclin-dependent kinases (CDKs) play essential roles in coordinate control of cell cycle progression. Activation of CDKs requires interaction with specific cyclin partners and phosphorylation of their T-loops by CDK-activating kinases (CAKs). The Arabidopsis thaliana genome encodes four potential CAKs. CAK2At (CDKD;3) and CAK4At (CDKD;2) are closely related to the vertebrate ... More
Zinc transporter of Arabidopsis thaliana AtMTP1 is localized to vacuolar membranes and implicated in zinc homeostasis.
Authors:Kobae Y, Uemura T, Sato MH, Ohnishi M, Mimura T, Nakagawa T, Maeshima M,
Journal:Plant Cell Physiol
PubMed ID:15653794
Cation diffusion facilitator (CDF) proteins belong to a family of heavy metal efflux transporters that might play an essential role in homeostasis and tolerance to metal ions. We investigated the subcellular localization of Arabidopsis thaliana AtMTP1, a member of the CDF family, and its physiological role in the tolerance to ... More