Search
我们建议起始摩尔比为1:1(插入片段:载体),范围为0.5:1到2:1(插入片段:载体)。对TOPO克隆来说,2kb大小的 PCR产物的ng值应在5- 10ng之间。 计算公式:< br / > 插入片段长度(bp)/ 载体长度(bp)x 载体用量(ng)= 插入片段:载体比为1:1时所需的插入片段的用量(ng)。
您可能需要尝试不同的插入片段:载体比例,范围从1:1至15:1。 公式: length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio (插入片段长度 (bp) X 载体重量(ng) ) / 载体长度 (bp) = 插入片段:载体比例为1:1时所需的插入片段重量(ng)
仅使用载体进行转化不是推荐的阴性对照实验。拓扑异构酶改构过程不是一个效率100%的过程,因此,在您的混合物中将会存在“不含插入片段的载体”,因此会产生克隆。
磷酸化的产物可以进行TA克隆但不能进行TOPO克隆。这是因为所需的磷酸基团已经包含在载体DNA和拓扑异构酶形成的中间体复合物中。TOPO载体含有一个与拓扑异构酶共价结合的3' 磷酸基团和一个5'磷酸基团。非TOPO载体的线性载体(TA和Blunt)含有一个3' OH基团和一个5'磷酸基团。磷酸化产物在进行TOPO-克隆之前应该用磷酸酶(CIP)处理。
你可能克隆了一段假阳性序列。TA和TOPO克隆对于存在于某些PCR反应中的小片段(< 100 bp)非常高效。使用硅基DNA纯化系统对插入片段进行凝胶纯化或者电洗脱。确保所有溶液均不含核酸酶(例如避免共用溴化乙锭染色器皿)。