Qubit™ ssDNA 检测试剂盒
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Qubit™ ssDNA 检测试剂盒
Invitrogen™

Qubit™ ssDNA 检测试剂盒

将 Qubit ssDNA 测定试剂盒与任何荧光计或微孔板读数仪配合使用可实现单链 DNA 定量测定。只需使用提供的缓冲液对试剂进行稀释,加入您的样品,然后便可使用 Qubit 或其他荧光计读取浓度值。该测定试剂盒可检测寡核苷酸或长了解更多信息
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Q102121 kit
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将 Qubit ssDNA 测定试剂盒与任何荧光计或微孔板读数仪配合使用可实现单链 DNA 定量测定。只需使用提供的缓冲液对试剂进行稀释,加入您的样品,然后便可使用 Qubit 或其他荧光计读取浓度值。该测定试剂盒可检测寡核苷酸或长 ssDNA,且对盐、溶剂、去污剂和蛋白等常见污染物耐受性良好。核苷酸和 6 个碱基或更短的短寡核苷酸不会干扰该定量测定。

Qubit ssDNA 测定试剂盒专门设计用于与 Qubit 荧光计配合使用,但也可与任何荧光计或荧光板读数仪配合使用。Qubit ssDNA 试剂盒适用于对单链 DNA 或寡核苷酸进行定量测定。但这种方法对单链 DNA 不具有特异性。该测定试剂盒还可检测双链 DNA 和 RNA,但无法检测污染性蛋白或核苷酸。该测定试剂盒设计用于准确测定 50 pg/µL 至 200 ng/µL 范围内的初始样品浓度,可检测范围为 1–200 ng。

该试剂盒包括浓缩测定试剂、稀释缓冲液和预稀释 DNA 标准品。只需使用提供的缓冲液对试剂进行稀释,加入您的样品(1 µL 至 20 µL 的任意体积均可接受),然后就可使用 Qubit 荧光计读取浓度值。该测定试剂盒对盐、游离核苷酸、溶剂、去污剂或蛋白等常见污染物耐受性良好。

选择哪款产品进行 ssDNA 定量测定?
1–20 份样品:将该 Qubit ssDNA 测定试剂盒与 Qubit 荧光计配合使用
20–2000 份样品:将 Quant-iT OliGreen ssDNA 测定试剂盒与微孔板读数仪配合使用

注释:
1.Qubit ssDNA 测定试剂盒可与 Qubit 1.0、Qubit 2.0、Qubit 3 和 Qubit 4 荧光计配合使用。
2.需使用 500 µL 薄壁 PCR 管(货号 Q32856),但本试剂盒中不含该产品。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。
规格
检测ssDNA 定量测定
激发/发射500/525
适用于(设备)Qubit 荧光定量仪
产品线Qubit
定量范围0.2 至 240 ng
数量1 kit
运输条件Room temperature
检测方法荧光
Unit SizeEach

常见问题解答 (FAQ)

我在Qubit检测中遇到了除“标准品错误”以外的其它试剂盒相关问题。你建议我如何做?

这里有一些建议:

1.在“查看标准品”或"查看校准"下查看标准品的原始荧光值(RFU)。确认样本的荧光值落在标准品的荧光值之间(或稍稍高于最高的标准品)。如果不是,那么样本已经超过了检测的精确范围。请参看产品目录中的各个检测试剂盒的置信区间。如果检测样本超过了置信区间,那么检测读数将是2位有效数字而不是3位。 要使样本进入准确测定范围,可稀释样本或使用更多或更少体积的样本(例如,如果样本读值较低的话,使用10 µL而非2 µL)。

2.检查温度因素。检测是温度敏感性的,荧光信号在较高温度时会减弱。样本之间或样本和标准品之间的温度波动可能引发问题。
确保缓冲液和保存在DMSO内的Qubit试剂处于室温。缓冲液和Qubit试剂应保存于室温,而不是冰箱内。保存于 4°C的缓冲液即使在室温放置2–3小时仍然不能达到室温。
确保你的样本和工作溶液不能过热(包括刚从离心机取出时)。保留在Qubit仪器内过久或多次读取的样本可能会升温。如果你想对一个试管多次读数,你应该将它从仪器内取出,放置30秒以平衡至室温,然后进行下一次读数。另外,在读数之前,不要将试管握在手中过长时间,因为这会加热样本,使读数变低。

3.确保正确制备Qubit工作溶液(使用试剂盒内的缓冲液1:200稀释)。确保正确制备标准品(10 µL标准品加入到190 µL工作溶液中)。确保试管中加入至少200µL液体(对于标准品和样本均是如此)。

4.确保你使用的试剂和标准品是6个月之内的,并且标准品保存方法正确。Qubit试剂存储溶液应尽可能避光保存。

5.确保在Qubit荧光计上选择的程序跟你所用的Qubit检测试剂盒是匹配的。

6.读取标准品和样本数值时,确保仪器的盖子完全关闭。

7.使用推荐的检测管(检测管不能阻挡仪器盖上盖子,并且检测管应当光学透明)。某些类型的检测管可能有较高的自发荧光而影响检测。

8.你在Qubit仪器中输入你所加入到工作溶液中的存储液的微升数了吗?如果输入了,那么Qubit荧光计获得此信息后给出的浓度是你的存储液的浓度。如果没有输入,那么你得到的浓度是检测试管(你放入Qubit荧光计的试管)内的浓度——不是你的存储液浓度。

9.如果你是将Qubit检测的结果和使用UV吸光值获得的浓度进行比较,并且基于UV吸光值的浓度显著较高,那么可能是因为核酸或蛋白污染。Qubit检测试剂对于DNA, RNA和蛋白的检测特异性比吸光值测定法高得多。

使用Qubit荧光计时读数随着时间降低。这是为什么?

请看我们的下列建议:

•确保孵育2分钟后再读取读数(对于蛋白,孵育时间为15分钟)。
•如果你将试管留在Qubit 荧光计内并多次读数,那么读数将随着试管在仪器内的升温而降低。如果你需要读取多个读数,请将试管从仪器中取出,放置于试管架上,让它与室温平衡至少30秒,然后再重新读取读数。
•如果样本是避光保存的,那么你可以在混匀后3小时内读取读数。超过这一时间,读数将不准确。
•在读取间隔,将标准品和样本试管保存于黑暗避光处。

我试图对一些带有荧光基团标记的DNA进行定量。这可行吗?

PicoGreen染料和其它基于荧光定量的试剂不建议用于对染料偶联的核酸进行定量。核酸上携带的染料基团会干扰定量试剂的结合或荧光产生。

DNA长度对dsDNA检测结果有影响吗?

大致在20-mer或更短范围内的链信号水平较低。对于大部分由短链组成的dsDNA样本,仍可使用试剂,但应使用与样本长度相当的dsDNA标准品。

Quant-iT PicoGreen DNA, Quant-iT DNA, 和Qubit DNA检测试剂有什么区别?

Qubit荧光计拥有高度优化的算法,可以使用 Qubit assays 或 Quant-iT DNA assays为您计算样本的浓度。使用MyQubit固件, Quant-iT PicoGreen DNA Assay也适用于Qubit荧光计。所有这些检测试剂的性能表现是相似的。

Quant-iT PicoGreen DNA Assay是最成熟和最通用的检测试剂。它需要标准品DNA和缓冲液的稀释,但是可以使用比色皿,微孔板和NanoDrop 3300进行测定。
Quant-iT DNA Assay提供了一个现成的缓冲液和预稀释的标准品DNA,可以使用96孔的微孔板来分析大量样本(>20个样本),而无需进一步的调整。< br / > Qubit Assay适用于低通量(<20个样本)实验,并且仅能用Qubit荧光计读取数据。

引用和文献 (14)

引用和文献
Abstract
Extensive transcriptional complexity during hypoxia-regulated expression of the myoglobin gene in cancer.
Authors:Bicker A, Dietrich D, Gleixner E, Kristiansen G, Gorr TA, Hankeln T,
Journal:
PubMed ID:24026678
'Recently, the ectopic expression of myoglobin (MB) was reported in human epithelial cancer cell lines and breast tumor tissues, where MB expression increased with hypoxia. The better prognosis of MB-positive breast cancer patients suggested that the globin exerts a tumor-suppressive role, possibly by impairing mitochondrial activity in hypoxic breast carcinoma ... More
AMP-activated protein kinase regulates nicotinamide phosphoribosyl transferase expression in skeletal muscle
Authors:Brandauer J, Vienberg SG, Andersen MA, Ringholm S, Risis S, Larsen PS, Kristensen JM, Frøsig C, Leick L, Fentz J, Jørgensen S, Kiens B, Wojtaszewski JF, Richter EA, Zierath JR, Goodyear LJ, Pilegaard H, Treebak JT,
Journal:
PubMed ID:23918774
Deacetylases such as sirtuins (SIRTs) convert NAD to nicotinamide (NAM). Nicotinamide phosphoribosyl transferase (Nampt) is the rate-limiting enzyme in the NAD salvage pathway responsible for converting NAM to NAD to maintain cellular redox state. Activation of AMP-activated protein kinase (AMPK) increases SIRT activity by elevating NAD levels. As NAM directly ... More
On-chip aptamer-based sandwich assay for thrombin detection employing magnetic beads and quantum dots.
Authors:Tennico YH, Hutanu D, Koesdjojo MT, Bartel CM, Remcho VT,
Journal:Anal Chem
PubMed ID:20545301
In this paper, we report the development of an on-chip aptamer-based fluorescence assay for protein detection and quantification based on sandwich ELISA principles. Thrombin was selected as a model analyte to validate the assay design, which involves two DNA thrombin aptamers recognizing two different epitopes of the protein. Aptamer-functionalized magnetic ... More
Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors.
Authors:Rees HA, Wilson C, Doman JL, Liu DR
Journal:Sci Adv
PubMed ID:31086823
'Adenine base editors (ABEs) enable precise and efficient conversion of target A•T base pairs to G•C base pairs in genomic DNA with a minimum of by-products. While ABEs have been reported to exhibit minimal off-target DNA editing, off-target editing of cellular RNA by ABEs has not been examined in depth. ... More
Evaluation of bisulfite kits for DNA methylation profiling in terms of DNA fragmentation and DNA recovery using digital PCR.
Authors:Kint S, De Spiegelaere W, De Kesel J, Vandekerckhove L, Van Criekinge W
Journal:PLoS One
PubMed ID:29902267
'DNA methylation is one of the most important epigenetic modifications in the regulation of gene transcription. The current gold standard to study this modification is bisulfite sequencing. Although multiple commercial bisulfite treatment kits provide good conversion efficiencies, DNA loss and especially DNA fragmentation remain troublesome. This hampers DNA methylation profiling ... More