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很多衣服上的增白剂,以及某些真菌和细菌,和SYBR Safe DNA凝胶染料会发出同样波长的荧光。这些位于凝胶表面或凝胶内的污染物可能会产生斑点。
SYBR染料仅在很窄的pH范围内有效,约为pH 7-8。超出此范围,荧光信号将迅速消失。
与溴化乙锭相似,SYBR Safe DNA凝胶染料与DNA的迁移方向相反。由于只有凝胶的最底部染料浓度会在电泳过程中降低,所以使用SYBR Safe DNA凝胶染料制备的凝胶没有实际影响。在电泳结束后用SYBR Safe DNA凝胶染料染胶,可部分抵消这种作用。染料溶液不应该加入到电泳缓冲液中,因为这可能会导致染料在电极上分解,并将有毒的挥发性化合物释放到空气中。
使用乙醇沉淀法可轻松去除核酸上的SYBR Safe DNA凝胶染料。
我们强烈不建议重复使用SYBR Safe DNA凝胶染料,因为这会大大降低灵敏度。