ERCC RNA 内参混合物
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ERCC RNA 内参混合物
Invitrogen™

ERCC RNA 内参混合物

多种因素包括起始原料的质量、细胞结构及RNA产率的水平、使用的平台以及从事实验的人,都对RNA表达数据的易变性有影响。为了控制这些易变性因素,由美国国家标准技术局召集学术、私人和公共组织建立的外源RNA对照物论坛(External RNA Controls Consortium,ERCC)研发了一套通用外部RNA对照物了解更多信息
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44567401 个试剂盒
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多种因素包括起始原料的质量、细胞结构及RNA产率的水平、使用的平台以及从事实验的人,都对RNA表达数据的易变性有影响。为了控制这些易变性因素,由美国国家标准技术局召集学术、私人和公共组织建立的外源RNA对照物论坛(External RNA Controls Consortium,ERCC)研发了一套通用外部RNA对照物。对照物由一套未经标记的聚腺苷酸化的转录物组成,按照设计,在样品分离后加入到RNA分析实验中,目的是与设定的功能标准进行对照比较。在这种广为接受的标准对照物产生之前,对重要的分析指标进行彻底分析很困难。Ambion™ ERCC 内参对照混合物来自信任的高质量 RNA 试剂品牌,是来源于经 NIST 认证的 DNA 质粒且可追溯的92种转录本的市售预配制混合物。该转录本的长度设计为250至 2,000 nt,模拟了天然的真核 mRNA。

主要产品特点:

实现不同基因表达实验间数据比较的标准测定
• 测定实验的灵敏度(检测下限)和动态范围
• 定量差别基因表达

解锁 RNA 分析的潜力
包括基因表达谱分析和全转录组调查的 RNA 分析可以更好地了解疾病状态中的表达模式,并对调节细胞结局、发展和疾病恶化的生物学通路及分子学机制提供更深入的了解。传统的RNA分析方法如qRT-PCR和基因芯片技术已经十分完善,但正逐渐被高通量的数字化替代手段即下一代测序方法所取代。由于每种方法都会牵涉多种平台,并且需要对世界各地跨平台的各种样品进行比较,因此需要一种数据比较的标准手段。随着 RNA 分析功能的扩展,创建标准化数据视图的必要性已变得更加重要。

获得结果并进行比较,具有经确认的准确度
Ambion™ ERCC RNA 内参对照用于在使用多种样品和平台进行的一项实验中和多项验之间创建 RNA 的标准基线测定值。采用两种内参混合物配方(图1),可以对多种指标(如灵敏度或动态范围)进行检查,以评估一项实验中或不同实验间的不同参数(图2)。而且,两种样品中表达水平幅度变化的比率,可通过ExFold RNA Spike-In 1和ExFold RNA Spike-In 2(图3)之间高度一致的关系来计算,具有很高的可信度。由于内参混合物中各种转录本的摩尔浓度已知,使用92种转录本的4种亚群的不同比值的组合对两种混合物进行关联,即可确定测量值。这些对照品是下一代测序实验(如 SOLiD™ 系统)和支持的微阵列平台(如 Illumina™ Sentrix™ BeadChip)的理想选择。

ERCC 试剂盒配置选项灵活
无论测定动态范围或基因表达倍数变化,Ambion™ ERCC 内参对照混合物有两种试剂盒配置可满足您的实验需求。使用ERCC Spike-In混合物确定您在用平台的动态检测范围和检测低限,并使用ERCC ExFold Spike-In混合物评估基因表达差异测定结果的精确性。
ERCC RNA 内参混合物1*ExFold 内参混合物1*ExFold 内参混合物2*Nuclease-free水
ERCC RNA 内参混合物(货4456740)10 µL1.75 mL
ERCC ExFold RNA 内参混合物(货4456739)10 µL10 µL1.75 mL

* 尽管 ERCC RNA 内参混合物1和 ExFold 内参混合物1中包含的 ERCC 转录本配方相同,但 ERCC RNA 内参混合物1不能取代 ExFold 内参混合物1进行倍数变化评估。仅可使用生产批号相同的 ExFold 内参混合物1和混合物2。

仅供研究使用。不适用于诊断用途。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。
规格
适用于(应用)新一代测序 (NGS)
包括对照模板
产品线Ambion™
产品类型ERCC RNA 内参混合物
数量1 个试剂盒
控制类型RNA 对照品
产品规格管装
Unit SizeEach
内容与储存
该试剂盒包含:
•10 µl ERCC RNA 内参混合物1
• 1.75 ml 无核酸酶水

不可将内参混合物储存在自动除霜冰箱中。

在 –20°C 下储存 ERCC RNA 内参混合物1
可在任何温度下储存无核酸酶水

常见问题解答 (FAQ)

How do I analyze data from the ERCC controls?

There is a specific ERCC_Analysis Plugin for Torrent Suite Software. Please see the ERCC_Analysis Plugin User Bulletin (Publ. No. 4479068) for detailed information.

Where can I find the ERCC concentrations?

Please go to the ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) or ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739) product page on www.thermofisher.com. Downloadable files are under the manuals section heading, click on Manual: ERCC Controls Analysis: ERCC RNA Spike-In Control Mixes.

Is there an ERCC-like product for bacteria or small RNA (or other non-polyA RNA species)?

No.

What is the difference between the ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) and the ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739)?

The ERCC RNA Spike-In Mix (Cat. No. 4456740) includes Spike-In Mix 1 alone; it can be used to assess platform dynamic range and lower limit of detection. The ERCC Ex-Fold Spike-In Mix (Cat. No. 4456739). includes both Spike-In Mix 1 and Spike-In Mix 2. In addition to the performance measurements described above for the ERCC RNA Spike-In Mix, this kit can be used to assess the accuracy of measurements of differential gene expression on your platform. Please see the ERCC RNA Spike-In Control Mixes User Guide (Pub. No. 4455352) for detailed information.

What are the ERCC RNA Spike-In Control mixes (Cat. No. 4456740 & 4456739)?

The ERRC RNA Spike-In Control mixes are a set of external RNA controls developed by the External RNA Controls Consortium (ERCC) and NIST (National Institute of Standards and Technology). The set is comprised of 92 synthetic, unlabeled polyadenylated transcripts of various lengths for determining the limit of detection (LOD) and the dynamic range for mRNA expression studies (in eukaryotes). The spike-in mix should be added to the RNA sample after isolation but before making the library. For more information, please refer to ERCC RNA Spike-In Control Mixes User Guide (Publ. No. 4455352) and ERCC_Analysis Plugin User Bulletin (Publ. No. 4479068).