Axiom 小麦育种 35K 基因分型芯片 (Axiom TaBW35K) 是通过
小麦育种项目与法国 Clermont-Ferrand 国家农业研究所项目负责人 Etienne Paux 博士合作设计而成。小麦育种项目(法国公私伙伴关系)旨在加强法国小麦育种部门的竞争力,并解决社会对农业生产可持续性、质量和安全的需求。该芯片也有
384 格式。
该阵芯片上的34746个 SNP 来自 Axiom TaBW280K 基因分型芯片(1)。该芯片应用了以下几种选择标准,包括聚类特征、均匀分布(基于连锁不平衡数据而不是物理位置)和 IWGSC RefSeq v1.0 上的已知位置。
SNP 上的信息,包括物理和遗传位置、上下文序列、以及代表全球多样性的一组96个小麦品系的统计数据。
所需产品GeneChip Command Console 软件GeneTitan 多通道仪Axiom Analysis Suite 软件参考文献1。Rimbert H、Darrier B、Navarro J、Kitt J、Choulet F 等人。(2018) 六倍体小麦中的高通量 SNP 发现与基因分型PLOS ONE 13(1): e0186329.
2.Lange TM, Heinrich F, Enders M, Wolf M, Schmitt AO.(2020) In silico quality assessment of SNPs—A case study on the Axiom Wheat genotyping arrays.Current Plant Biology 21:100140.