面向单颗粒分析的冷冻电镜数据采集软件解决方案

Thermo Scientific Smart EPU软件是一款由 AI 驱动的冷冻电子显微镜 (cryo-EM) 软件平台,可自动化数据采集、优化样网筛选,并与您的硬件无缝集成,从而加速单颗粒分析的数据工作流程。

 

兼容所有 Thermo Scientific TEMs,集成组件(例如 Thermo Scientific Smart EPU Plugins、EPU Multigrid软件和 Embedded CryoSPARC Live软件)协同工作,支持自主筛选并实现高通量产出。


SPA 数据采集软件组合

无论您需要端到端的自主筛选与实时质量监控,还是标准的自动化图像采集,赛默飞都提供多样化解决方案,加速您的单颗粒分析数据采集。


Smart EPU软件功能

智能技术优化 SPA 数据采集中的决策

通过 Smart EPU Plugins 接入基于 AI 的算法、更快速的筛选以及工作流程自动化。

 

可借助以下功能简化决策:

  • 智能方格选择,用于基于 AI 的网格方块选择与分类
  • 智能孔位识别:在无需人工输入的情况下识别箔孔,即使在复杂网格上也能可靠工作
  • 智能筛选:用于自动筛选出最佳质量的孔位
  • 智能冰层厚度预测:根据预测的冰层厚度对箔孔进行自动分类。
  • 智能对焦:利用实时 CTF 实现自动对焦稳定
  • 智能方格跳过:使用实时对比传递函数 (CTF) 实现自动跳过网格方块
  • 智能载物台时间:用于优化载物台等待时间

此外,高级用户可通过开放的应用程序编程接口 (API) 开发并共享自己的插件。

增强的数据质量监控

内置的 CryoSPARC Live 软件与 Smart EPU 软件完全兼容,能够实时分析数据,,实时分析数据并即时反馈图像与样品质量。

  • 支持不断扩展的自动化功能
  • 简化的参数设定流程,包括自动配置参数
  • 支持自动化筛选
  • 与 EPU Multigrid 和 Cryoflow软件集成

 

硬件安装以及现场服务更新和培训由赛默飞服务团队提供。

最大化排程效率

EPU Multigrid软件可对多块网格进行样品筛选和数据采集,提升每天可产出的数据集数量,适用于通宵或周末运行。

  • 更快速的数据获取与筛选
  • 减少显微镜闲置时间
  • 直观界面便于新用户培训

实现完整互联的单颗粒分析工作流程

该平台兼容所有赛默飞冷冻电镜,并无缝整合 Smart EPU软件组件,包括 EPU Multigrid、EPU Quality Monitor、Embedded CryoSPARC Live软件,以及由 AI 驱动的 Smart EPU插件。 它实现了协作用户之间的无纸化数据交换,并提供筛选与导出功能,以便进一步处理最高质量的数据。

 

CryoFlow 软件支持专用查看器 Discovery Viewer,具备以下功能:

  • 在相关的全景图、方格与高倍图像之间切换
  • 查看可追踪图像的质量数据
  • 快速轻松地筛选高质量数据采集

使用 Smart EPU软件进行筛选的优势

易于上手

用户友好的界面便于快速培训与设置,无需专业知识即可识别并排除不良薄膜孔。

效率最大化

用于网格筛选的自主流程采用 AI 驱动算法,减少显微镜在评估样品质量上所需的时间。

工作流程优化

每天可以筛选两个完整样带,从而加快获得结果并节省成本。

高数据质量

自动排除次优区域,提供更可靠的结果。


常见问题

问:Smart EPU软件的硬件要求和安装步骤是什么?

答:Smart EPU软件运行在连接到您的冷冻电镜的专用采集服务器上,称为 DMP。 系统必须满足 GPU、RAM 和存储的性能规格,以确保实时优化和自动化功能的平稳运行。 安装与配置由 Thermo Fisher Scientific 的现场服务工程师(FSE)或数字解决方案工程师(DSE)完成,他们将确保 Smart EPU软件与您的显微镜硬件和网络环境完全集成。

 

问:随 Smart EPU软件安装提供哪些培训?

答:操作者可选择由赛默飞的应用专家提供的个性化入门培训(可选)。 更多资源(如教程和知识库文章)可通过赛默飞支持门户获取。

 

问:操作 Smart EPU软件需要怎样的用户经验水平?

答:Smart EPU软件设计注重易用性。 其自动化设置和引导式工作流程减少了大量培训需求,使新用户能够自信地开始采集数据。 同时,它为有经验的用户提供可定制功能,以便微调采集策略。

 

问:Smart EPU软件与传统 EPU软件有何不同?

答:Smart EPU 软件在自动化程度上高于传统 EPU软件,采用 AI 算法来支持 SPA 数据采集。 它在运行过程中具备自适应决策能力,特别适用于全自动筛选流程,并通过实时参数优化确保高质量数据。

 

问:我目前使用的是传统 EPU软件,能否升级?

答:可以。现有 EPU软件用户可通过由 赛默飞 现场服务工程师执行的标准过渡流程升级到 Smart EPU软件。 升级内容包括安装、系统验证和用户培训,以确保平稳过渡。

 

问:Smart EPU软件是否与我当前的冷冻电镜系统兼容?

答:请咨询您的客户经理,确认您的系统是否受支持。 Smart EPU软件 设计可与我们多款 Thermo Scientific™ Cryo‑TEM 系统无缝集成,包括 Krios™、Glacios™ 和 Tundra™ 系列 Cryo‑TEM。

 

问:Smart EPU软件是否支持远程监控或控制?

答:Smart EPU软件支持通过 CryoFlow 软件进行远程会话访问,后者是一个安全的数据管理平台。 尽管主动控制应在现场或通过安全手段进行,但您可以通过 CryoFlow软件的安全界面远程监控会话进度并访问日志数据。

 

问:在显微镜系统上,多少用户可以访问 Smart EPU软件?

答:在数据采集设置方面,Smart EPU软件 支持为整个显微镜系统配置多个用户账户,但每次只有一个活动用户会话可以控制一次数据采集运行。 针对用户的设置和模板有助于在不同会话和用户之间保持一致的质量。 在监控方面,该程序支持最多 15 位并发用户访问。

 

问:Smart EPU 软件用户可获得哪些类型的支持?

答:对于签署服务合同的系统,赛默飞的全球数字化解决方案和服务团队将提供持续支持。 用户可通过服务协议定期获得软件更新、性能优化及支持资源。


资源

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Smart EPU 软件技术规格

深入了解 Smart EPU 软件背后的创新,以及它如何使 cryo-EM 单颗粒分析数据采集实现更高程度的自动化。

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