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Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒
使用Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒和Ion GeneStudio S5系列新一代测序系统，可靶向检测超过20,000个RefSeq转录本，RNA起始量低至10 ng，并采用快速且兼容 FFPE 样本的工作流程，助力您的研究取得突破。
- 经济高效地开展转录组测序——无需等待数周以积累足够的样本进行批量处理。
- 高效开展基因水平表达分析——使用Ion Chef系统进行自动化文库制备，实际操作时间低至15分钟；从RNA到获得基因表达水平数据，全流程不到2天。
- 快速、轻松完成测序数据分析——配套软件工具可用于快速便捷地分析测序Reads；还可沿用现有的下游基因芯片或新一代测序（NGS）分析流程，开展基因水平的差异表达数据分析。
- 充分利用珍贵的FFPE样本——RNA 起始量低至10 ng，即可开展分析。
图 1. Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒数据与全转录组RNA-Seq数据之间的差异表达基因（DEG）相关性为0.943。
RNA-Seq文库制备是否只有一种方式？
如何使用Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒寻找三阴性乳腺癌研究样本中的基因表达特征？在本视频中，来自印第安纳大学的Milan Radovich博士将介绍他针对三阴性乳腺癌中表达特征所开展的研究。
Ion AmpliSeq小鼠转录组基因表达试剂盒
Ion AmpliSeq小鼠转录组基因表达试剂盒与Ion GeneStudio S5系列新一代测序系统配合使用，可帮助实现对样本量有限的样本进行快速且经济高效的基因表达分析。该试剂盒仅需低至10 ng的总RNA作为起始材料，即可在单管中同时扩增超过20,000 个RefSeq基因，因此可成为肿瘤学研究和转化医学研究中的重要工具。
Ion AmpliSeq小鼠转录组基因表达试剂盒具有以下特点：
- 低样本起始量——仅需低至 10 ng 的总 RNA
- 简单工作流程，实现快速基因表达谱分析——借助Ion GeneStudio S5系列新一代测序系统和Ion Chef系统的自动化工作流程，可在不到2天内完成从RNA到数据的全过程，总人工操作时间仅约45分钟
- 简化的数据分析——可通过Torrent Suite软件导出数据，并使用现有的分析软件进行后续分析
与其他转录组分析技术的比较
定量基因表达分析和差异基因表达分析是许多生物学研究应用的基础，包括基因调控分析、基因表达与表型信息的相关性分析以及细胞通路分析。传统的基因表达谱分析方法包括基于杂交的技术（基因芯片）和基于扩增的技术（qRT-PCR）。然而，这些方法存在一定的局限性：
- 基因芯片方法不仅需要较大量的RNA，而且在灵敏度和特异性方面仍存在一定局限。
- qRT-PCR虽被公认为基因表达分析的金标准，但其通量通常较低；如果需要检测大量基因，则需要较多的RNA起始量。
因此，在分析数量有限或质量较差的样本（例如来自 FFPE 组织的降解RNA）时，这两种技术在工作流程上都面临一定挑战。采用NGS和Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒进行靶向测序，不仅能够反映基因的绝对表达水平，还能够针对完整样本和降解样本快速、简便地鉴定并定量低丰度转录本。
图 2. 使用Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒和Ion Proton系统提高基因水平的转录本检测能力。维恩图展示了MAQC基因芯片数据与Ion AmpliSeq人类转录组基因表达试剂盒所鉴定基因之间的一致性。
Ion AmpliSeq人类和小鼠转录组基因表达试剂盒工作流程
- 构建文库
- 制备模板
- 进行NGS 测序
- 分析数据
在单次反应中扩增>20,000个靶标
产品：
- Ion AmpliSeq人类或小鼠转录组基因表达试剂盒
使用Ion Chef系统进行等温扩增
产品：
- Ion 540 Kit-Chef（每次运行8个样本）
- Ion 550 Kit-Chef（每次运行16 个样本，兼容Ion GeneStudio S5 Plus和Prime系统）
- Ion 560 Kit-Chef* (每次运行32个样本，兼容Ion GeneStudio S5 Plus和Prime系统）
* 兼容Ion AmpliSeq 人类转录组基因表达试剂盒
使用Ion GeneStudio S5系统进行测序
产品：
- Ion 540 Chip Kit（每次运行8个样本）
- Ion 550 Chip Kit（每次运行16 个样本，兼容Ion GeneStudio S5 Plus和Prime系统）
- Ion 560 Chip Kit*（每次运行32个样本，兼容Ion GeneStudio S5 Plus和Prime系统）
* 兼容Ion AmpliSeq 人类转录组基因表达试剂盒
- 运行AmpliSeqRNA插件，生成简单易用的read count（读段计数）数据文件
- 进行简单的统计分析，或将文件导入现有的基因芯片分析流程
Ion GeneStudio S5 系列新一代测序系统
Ion GeneStudio S5 系列新一代测序（NGS）系统凭借出色的速度、可扩展性和经济性，可帮助您在实验室中轻松建立简便的靶向测序工作流程，让您能够将研究精力更聚焦于具有潜在影响力的应用。这些 NGS 系统采用模块化设计，使您的实验室能够灵活地在单一系统上开展多种靶向测序应用。
Ion AmpliSeq转录组试剂盒订购信息
Ion AmpliSeq转录组相关资源
仅供科研使用。不可用于诊断程序。