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Minor Variant Finder软件
通过Sanger测序实现5%的体细胞变异检测
Applied Biosystems Minor Variant Finder软件是专为通过Sanger测序检测和报告微小突变而开发的新型软件。微小变异是指作为次要组分存在的单核苷酸多态性（SNP），其在给定等位基因中的占比低于25%。
在肿瘤学、传染病和遗传病等研究领域，检测低水平体细胞突变的能力至关重要。通过Minor Variant Finder软件所实现的灵敏度提升，使得Sanger测序成为肿瘤学家和/或病理学家在相关靶标数量通常有限的情况下，检出低频体细胞变异（5%或以下）的理想选择。根据癌症类型的不同，借助Minor Variant Finder软件，可通过金标准Sanger测序快速且经济高效地检测癌基因（如KRAS、NRAS等）和/或抑癌基因（如TP53）中数量适中的相关变异。该软件也是二代测序（NGS）结果的重要验证方法。
在低至5%的检测水平下检出微小变异
单击图片以放大顶部：原始Sanger测序数据。
底部：Minor Variant Finder软件的输出数据。
底部：Minor Variant Finder软件的输出数据。
Minor Variant Finder软件的创新算法使用对照样本来消除背景噪声，使得在最低约 5% 的水平下也能判定微小变异。通过软件的噪声最小化处理，导入的 Sanger 测序数据可生成干净的电泳峰图，便于对这些微小变异进行目视确认。软件还设置了审查指示器，以帮助判定分析后可能出现的潜在微小变异。可在正向和反向链上检测微小变异以确认结果。
以最低成本对适量靶标进行测序
在运行数量有限的靶标时，Sanger测序是一种经济高效的选择。通过Minor Variant Finder软件所实现的灵敏度提升，使得Sanger测序成为肿瘤学和病理学研究实验室检出体细胞变异的理想选择，在这些场景中相关靶标的数量往往有限。此外，该软件还为扩充固定基因panel提供了一种简便灵活的方式。
更快获得关键结果
利用Sanger 测序的快速周转时间优势。从样本到结果可在同一天内完成，从而更快获得关键结果。
在比对视图和Venn图中确认NGS结果
对于使用NGS技术的高通量实验室，可使用 Sanger 测序快速且具有成本效益地确认 NGS 发现的低丰度变体。确认数据可在比对视图和Venn图中可视化以便报告。
简单的工作流程
该软件无需更改您当前的工作流程。它与您实验室已实施的Sanger测序工作流程兼容。
查看工作流程演示
使用相同的材料和程序（相同的引物、相同的样品纯化方法、相同的仪器、相同的操作人员等）制备并对照样本与测试样本进行测序。
在 Minor Variant Finder Software 中创建一个新项目。
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将对照样本的正向和反向反应，以及测试样本的正向和反向反应导入软件。
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在噪声最小化处理前后，审查被调用的变体和/或电泳峰图。
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使用相同的材料和程序（相同的引物、相同的样品纯化方法、相同的仪器、相同的操作人员等）制备并对照样本与测试样本进行测序。
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将对照样本的正向和反向反应，以及测试样本的正向和反向反应导入软件。
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在噪声最小化处理前后，审查被调用的变体和/或电泳峰图。
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了解有关 Minor Variant Finder软件的更多信息：
Minor Variant Finder软件可使Sanger测序实现5%的体细胞变异检测。
计算机要求
组件 | 要求 |
| 计算机 | Windows™ 电脑，需 2 GB 硬盘空间，最低 4 GB 内存；建议 8 GB。 测试配置：
|
| 操作系统 | Windows™ 7 SP1（32 位或 64 位）或 Windows™ 10 Pro/IoT（64 位） |
| 浏览器 | Google™ Chrome™、Mozilla™ Firefox™、Microsoft™ Internet Explorer™ v.11，或 Microsoft™ Edge Minor Variant Finder Software 在网页浏览器窗口中运行，但运行时不需要连接互联网。数据保存在您的桌面计算机上，具有安全性。 |
| 屏幕分辨率 | 1024 x 768 或更高，针对 1280 x 1024 进行了优化 |
仪器要求
要求 | 说明 |
| Basecaller | 该软件可以分析已用 KB Basecaller v1.4 或更高版本进行碱基调用的 .ab1 文件，且这些序列未使用重测序软件（例如 Applied Biosystems SeqStudio SeqScape Software）进行编辑。 |
| 兼容的基因分析仪 | 已对来自 Applied Biosystems SeqStudio、3500、3130 和 3730 基因分析仪的数据使用 Minor Variant Finder Software 进行了测试。若 3100 型号的数据采用上述基线调用器版本进行碱基调用，则也受支持。 |
仅供研究使用。不得用于诊断程序。