内容总结：

仅靠基因组学难以支撑精准医学与“癌症登月计划”，蛋白质组在早诊、治疗与预防中不可替代。讲解Orbitrap质谱平台的高灵敏度与高通量，及DDA、DIA、PRM覆盖从发现到验证的全流程。展示血浆超大动态范围、样本量小与复杂度高等难点及“简约蛋白质组”快速流程。分享DIA与PRM在临床早诊与疗效监测中的案例与LDT转化路径。第二部分介绍肿瘤冷热物理治疗动物模型的标志物发现流程与免疫机制提示。

演讲者：严威 教授——上海交通大学系统生物医学研究院教授、博士生导师

上海“千人计划”：张伟 博士——赛默飞转化医学业务发展经理

类型: 技术讲座

难度: 中级

目标受众: 生命科学研究人员、临床检验科人员、转化医学团队、质谱与生物信息工程师

[00:00-09:59] 精准医学概述流程: 基因与蛋白质对比和早诊方法及注意事项

[10:00-19:59] 质谱通量方法: Orbitrap分析流程和成本及注意事项

[20:00-29:59] DIA与PRM方法: 采集流程和临床应用及注意事项

[30:00-39:59] 动物实验流程: 取样方法和标志物验证及注意事项

学习目标：

  1. 掌握DDA、DIA与PRM的基本原理和适用流程
  2. 理解临床样本高动态范围与低丰度检测的难点
  3. 学习“简约蛋白质组”快速流程的要点和注意事项
  4. 掌握血浆标志物发现到PRM验证的实施步骤
  5. 理解LDT路径及质谱在临床早诊与监测中的应用

基础概念：

  1. 精准医学: 基于个体分子分型进行诊断与治疗的医学策略，强调早诊与个体化干预。
  2. 蛋白质组学: 以蛋白质为研究对象的系统学科，关注表达、修饰与功能及其与疾病关联。
  3. 数据依赖采集(DDA): 按实时选定强信号前体进行MS/MS采集的质谱策略，用于发现性分析。
  4. 数据非依赖采集(DIA): 使用固定窗口系统性采集MS/MS，不依赖MS1选择，实现稳定定量与数字化。
  5. 平行反应监测(PRM): 在高分辨MS2并行监测所有碎片的靶向定量方法，选择性强且开发简便。
  6. Orbitrap质谱: 高分辨高精度的质谱检测平台，兼具灵敏度与通量，适用于临床样本。
  7. 实验室自建检测(LDT): 具备资质的实验室自行开发并应用的检测，支持临床转化。
  8. 生物标志物: 可用于疾病早诊、分型与疗效监测的分子指标，常见为蛋白质。