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Oncomine Comprehensive Assay Plus

在Genexus系统上可用的用于CGP的NGS研究检测

来自单一供应商的一体化 CGP 研究检测，最早可在次日获得结果

Oncomine Comprehensive Assay Plus 可在 Ion Torrent Genexus 测序系统和 Ion GeneStudio S5 测序系统上使用，提供完整的端到端全面基因组谱分析（CGP）解决方案。该检测可从 517 个基因中检测广泛的基因组变异类型，包括单核苷酸变异（SNV）、插入与缺失（indel）、拷贝数变异（CNV）及基因融合等。

 

此外，该检测还可鉴定同源重组缺陷（HRD）、肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI）等基因组特征。依托经验证的 Ion Torrent 技术，Oncomine Comprehensive Assay Plus 提供完整、简便、快速且稳健的解决方案，帮助满足实验室的研究需求，即使在不同水平的 NGS 操作熟练度下亦能适用。

Oncomine Comprehensive Assay Plus 的特点与优势

完整

一家端到端的供应商

提供从样本到报告的解决方案，包括仪器、耗材、分析和支持

 

简化在您实验室中的实施，有助于提升效率

简便

仅需 20–60 分钟的人工操作时间*

配合简便且自动化的工作流程，无论经验水平如何均适用

 

有助于减少操作错误，节省宝贵时间，并降低人力成本

快速

1–3 天获得 CGP 结果*

依托 Ion Torrent 技术实现快速周转

 

及时的结果对于获取重要见解与进行决策至关重要

稳健

~94% 的成功率1

基于 AmpliSeq 技术，样本输入要求低。

 

高成功率意味着可以对更多样本进行检测并获得具有信息价值的结果。

按需观看 CGP 网络研讨会

快速全面基因组分析（CGP）在实体瘤中的应用价值

Nicola Normanno，医学博士，意大利 IRCCS Romagnolo 肿瘤研究所科学总监

使用 Genexus 测序系统评估 Oncomine Comprehensive Assay Plus

Jane Bayani，MHSc, PhD，加拿大安大略癌症研究所诊断开发部助理教授兼联合主任

Oncomine Comprehensive Assay Plus 在 Genexus 系统上的 EMEA 研究结果

Morten Grauslund，PhD，丹麦 Rigshospitalet（哥本哈根大学医院）病理学系分子生物学家

实现隔日 CGP：在 Ion Torrent Genexus 系统上运行 Oncomine Comprehensive Assay Plus

Dr. Elaine Wong-Ho，PhD，赛默飞产品管理高级经理，美国

获取全面基因组分析对精准肿瘤学的影响

Dr. Nicola Normanno，MD，意大利 IRCCS“Dino Amadori” 科学总监

快速交付：Oncomine Comprehensive Assay Plus 与 Ion Torrent Genexus 系统的性能评估

Dr. Andrew Campbell，PhD，Geisinger Health System 分子诊断部临床基因组开发副主任

端到端生物信息学分析：在 Ion Torrent Genexus 系统上的 Oncomine Comprehensive Assay Plus

Mark Tomilo，赛默飞临床生物信息学顾问

用于本地综合基因组谱（CGP）的 Oncomine Comprehensive Assay Plus 多中心研究

Eloisa Jantus Lewintre 博士，细胞生物学副教授，西班牙瓦伦西亚理工大学

包含 HRD 评估的 Oncomine Comprehensive Assay Plus 的 CGP 评估

Annarita Destro 博士，分子病理学部负责人，意大利米兰 Humanitas 研究医院

Oncomine Comprehensive Assay Plus 在跨肿瘤类型多中心研究中的分析学性能

对在 Ion GeneStudio S5 系统上运行的 Oncomine Comprehensive Assay Plus 所做的多中心评估，使用来自超过 13 种不同肿瘤类型的泛癌研究样本队列。

 

对 193 份泛癌研究样本（125 份 DNA 和 68 份 RNA）进行了分析，以评估 Oncomine Comprehensive Assay Plus 与正交方法的一致性（图 1）。尽管部分样本肿瘤细胞含量仅为 10–20%，仍获得了约 94% 的 DNA 与 RNA 总体测序成功率1。

图 1. 用于分析评估的肿瘤类型分布

Oncomine Comprehensive Assay Plus 的肿瘤类型分布。

Oncomine Comprehensive Assay Plus 与正交方法的总体一致性为：SNV 与 indel 为 94.8%，CNV 为 96.5%，融合为 94.2%。Oncomine Comprehensive Assay Plus 在检测 HRD、TMB 和 MSI 等基因组特征方面，也与正交方法表现出高度一致性。

 

基于本研究，Oncomine Comprehensive Assay Plus 作为用于 CGP 的敏感且特异的平台，表现出优异的分析学性能。此外，Oncomine Comprehensive Assay Plus 在不同实验室的重复样本中表现出高度可重复性，这突显了该测定在推进个体化医学研究方面的潜力。

 

基因组改变或特征 样本数 (n) 一致性 (%)
SNV/indels 290 94.8
CNVs 57 96.5
融合 52 94.2
HRD 18 100
TMB 32 81.3
MSI（泛癌/结直肠癌） 26/10 80.8/100

使用 Oncomine Comprehensive Assay Plus 的 HRD 评估

Oncomine Comprehensive Assay Plus 可检测 47 个与同源重组修复（HRR）相关基因中的突变，包括 BRCA1 和 BRCA2 中的大片段基因重排（LGRs），这些重排为已知导致 HRD 的原因。此外，还使用基因组不稳定性指标（GIM）来衡量 HRD 的后果。

 

GIM 是一个介于 0 到 100 之间的数值，用于概括由 HRD 导致的常染色体上不平衡拷贝数变化。GIM 值越高，表明基因组不稳定性越强。

 

Oncomine Comprehensive Assay Plus 在卵巢癌研究样本中的 HRD 性能

在一项回顾性多中心研究中，纳入来自 MITO16/MaNGO-OV2 临床研究的 100 例 III–IV 期卵巢癌研究样本。HRD 状态基于 BRCA1 与 BRCA2 的致病性突变情况结合 GIM 判定，预先将 GIM ≥16 定义为高 GIM。2

 

在卵巢癌研究样本中，使用 Ion GeneStudio S5 Systems 运行的 Oncomine Comprehensive Assay Plus 与多种正交方法进行 HRD 评估时，显示出良好的总体一致性。

    参考方法  
    阳性 阴性 总计
Oncomine Comprehensive Assay Plus 阳性 51 7 58
阴性 1 27 28
  总计 52 34 86
HRD 状态（综合）：
Oncomine Comprehensive Assay Plus 与参考方法比较
灵敏度 98.1%
特异度 79.4%
总体一致性 90.7%

可使用 Oncomine Comprehensive Assay Plus 的 NGS 测序系统

Oncomine Comprehensive Assay Plus 可在 Genexus 测序系统上使用，并且也可在 Ion GeneStudio S5 测序系统上配合手动或自动化文库制备使用。

Ion Torrent Genexus 测序系统

借助 Genexus 系统，您可在实验室引入快速 NGS，无需大量专项经验。该平台为快速、简便、自动化的双仪器 NGS 解决方案。

Ion GeneStudio S5 测序系统

使用 GeneStudio S5 测序系统，可快速高效获得见解。该系统为可扩展、灵活、高通量的 NGS 平台，适用于广泛的应用领域。

准备好与赛默飞专家联系吗？

如果您有兴趣了解更多关于用于实体瘤的 Oncomine CGP 解决方案并观看演示，请请求当地代表与您联系。

 

参考文献

1. Jantus-Lewintre E, Rappa A, Ruano D 等（2025）。基于扩增子的下一代测序面板用于综合分子谱分析的多中心院内评估。Mol Diagn Ther. 29(2):249–261.

2. Normanno N.（2023）。基于 NGS CGP 在卵巢癌样本中进行 HRD 检测的未来临床前景。Genome Web Webinar；2023年5月。

 

 

PMR-005648

仅供研究使用，不得用于诊断程序。