Copy Number Analysis with Microarrays

微阵列是检测诸如染色体插入、重复和缺失等 DNA 结构变异 (SV) 的首选平台。除了这些拷贝数变异 (CNV),同时覆盖多态性 (SNP) 区域和非多态性区域的全基因组阵列还可额外检测到提示杂合性缺失 (AOH)、杂合性丢失 (LOH) 或纯合性过长连续延伸 (LCSH) 的染色体不平衡和等位基因失衡。 

基于微阵列检测的优势:

  • 涵盖目前已确立为重要的基因以及有新出现证据支持的基因的全基因组覆盖范围
  • 检测灵敏度高:用于阐明克隆进化模式的低水平嵌合、异质样本、结构不一致和 gDNA 或细胞污染
  • 灵活的工作流程:用于经济实惠地手动或自动处理数份至上千份样本。
  • 高质量、可重现的数据,便于集成并与公共数据库和合作方资源对比。
  • 从送样到出结果的周转时间迅速,包括数据分析在内仅需 2 到 3 天

推荐产品

应用领域

生殖健康

采用诸如染色体核型分析、荧光原位杂交 (FISH) 和低分辨率阵列之类的传统方法,会使基因组覆盖率、内容或分辨率欠佳,导致遗漏重大畸变,从而不得不进行进一步分析,导致结果延迟并增加成本。涵盖基因组多态性 (SNP) 区域和非多态性区域的全基因组微阵列,可被用于评估 DNA 拷贝数改变,且与陈旧的常规方法相比大大提高分辨率。

神经发育和遗传学研究

人类基因组中发现的多数 CNV 不会对人类健康造成影响,然而,上百种 CNV 与神经系统疾病如精神分裂症、自闭症、注意力缺陷多动障碍 (ADHD)、智力障碍和躁郁症有关。 一些使用高分辨率全基因组微阵列的著名研究报道称,这些神经发育障碍都与相同基因的 CNV 有关。
 

肿瘤学

染色体异常和基因组不稳定性是癌症最重要的畸变之一。利用全基因组覆盖同时检测 CNV、LOH、cnLOH、低水平嵌合、倍性和样本异质性,以充分利用癌症发现。

定制高通量应用

利用相关性最强的标记物,定制属于您的高通量 96 孔或 384 孔检测板,用于您的定制应用以及全基因组关联、复制、精细定位和候选基因研究并结合说明 CNV 的能力。


仪器和软件

低中通量仪器

GeneChip™ 仪器系统是供您使用 GeneChip 品牌的卡盒阵列进行研究的完全集成平台。我们提供三个版本的系统和配件,适用于从低通量到中通量的阵列处理。

高通量仪器

通过将杂交炉、射流处理和最先进的成像装置组合成一台独立的台式仪器,GeneTitan 多通道 (MC) 仪器可自动完成从靶标杂交到数据生成的阵列处理。GeneTitan MC 仪器可在无人值守的情况下通宵处理 16、24、96 和 384 阵列排布的大量平行样本。

软件

染色体分析套件 (ChAS) 提供了免费的直观而灵活的工作流程来进行准确分析。ChAS 由顶尖专家投入精力进行开发,专为拷贝数和细胞遗传学研究的分析和报告而设计。ChAS 能让您查看和总结整个基因组的染色体畸变。染色体畸变包括拷贝数扩增或丢失、嵌合性或杂合性丢失/缺失 (LOH/AOH)。最新的 ChAS 3.1 包括了新增的强大的数据库和独特的用于肿瘤应用的自动二倍体中心算法。


CytoScan HD 套件

完整覆盖无遗漏

CytoScan™ 阵列采用从超过 2000 万探针池筛选探针的经验设计,并采用超过 3000 份样本对其进行进一步筛选,以选择用于全基因组拷贝数应用性能最佳的探针。

设计经优化以实现平衡的全基因组覆盖,实现具有精确断点准确性的高分辨率 DNA 拷贝数分析,以及针对 LOH/AOH 和 LCSH 的高密度 SNP 覆盖,以实现单亲二倍体 (UPD) 的检测。

我们专有的生产技术,可生产出批次间具有高度可重现性的阵列。

  • 卓越的性能:整个基因组的高特异性、灵敏度、动态范围和分辨率
  • 专为您应用的更新换代而设计:涵盖 RefSeq 所有 36000 个基因,包括 OMIM 14000 条记录;ClinGen(原 ICCG 和 ISCA)数据库和 Decipher 数据库中的所有生殖基因区域,以及桑格研究院癌症基因数据库 (Cancer Gene Census of the Sanger Institute) 中的所有癌症基因。
  • 基因分型准确性高达 >99% 的高密度 SNP:实现低水平嵌合可视化显示、AOH 和获得性 UPD (aUPD) 检测、拷贝数改变验证、三倍体检测、等位基因失衡模式可视化显示、基因组污染鉴定和亲本来源分析
  • 完整的解决方案帮您节约时间和金钱:简单而稳健的手动或自动化的实验方案,易用的软件,以及自定进度或以实验室为基础的培训
  • 精简的数据分析:染色体分析套件 (ChAS) 是一种提供增强分析性能的软件,包括查看和总结染色体畸变 (CNV、嵌合性和 LOH)的功能、二倍体-三倍体一致性工具、数据库建设功能和灵活的结果导出选项。
  • 具有稳健性,适用样本类型最广泛:血液、骨髓、口腔粘膜拭子、唾液、新鲜和冷冻组织、非培养或培养细胞等等

仅供科研使用,不可用于诊断目的。