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快速获得全外显子组测序(WES)结果。2天内即可从DNA获得变异结果。
借助 Ion AmpliSeq 技术的超高重PCR方法以及 Ion GeneStudio S5 系统的出色准确性,Ion AmpliSeq Exome RDY Kit 可对基因组关键外显子区域进行快速、准确的测序,仅需2天即可从DNA获得变异结果。
外显子组测序是一种靶向新一代测序 (NGS) 方法,检测范围限定于基因组中的蛋白编码区域。据估计,外显子组约占基因组的1%,但包含约85%的致病突变[1]。 对于希望鉴定与6,800多种罕见病相关基因的遗传学研究人员[2],外显子组测序可快速、经济地识别常见单核苷酸变异(SNV)、拷贝数变异(CNV)和小片段插入或缺失(indel),以及可能解释孟德尔遗传病和复杂疾病遗传性的罕见de novo突变 [3]。
探索Applied Biosystems杂交捕获解决方案,该方案使用双链DNA探针实现广泛且均一的外显子组覆盖。DNA外显子组解决方案专为高通量测序工作流程设计,有助于优化可用测序数据,并支持大规模、可信的变异检测。
Ion GeneStudio Prime系统、Ion Chef仪器和Ion 550芯片支持每天最多测序12个外显子组,每周最多测序48个外显子组。*
*假设每天工作8小时、每周工作5天。需要两台Ion Chef仪器。
Ion AmpliSeq Exome RDY Kit 的工作流程手动操作时间少于50分钟,可在6小时内完成富集和文库构建。与其他外显子组富集技术相比,该试剂盒所需手动操作时间更少,并且最低可使用50 ng DNA。
外显子组富集效率可通过特异性和覆盖均一性来衡量。特异性定义为靶区域内碱基所占百分比;覆盖均一性定义为在特定测序深度下被覆盖碱基所占百分比。较高的序列覆盖均一性对于外显子组测序非常重要,因为它可减少达到目标覆盖阈值(例如20x)所需的测序量。覆盖深度对于准确的变异检出至关重要。 Ion AmpliSeq Exome RDY Kit可实现高效富集,靶区域内碱基比例>90%,覆盖均一性>90%。
借助Ion GeneStudio S5系列可扩展的芯片格式,您可以经济高效地在每次运行中测序1至4个外显子组,而无需批量积攒样本。只需在Ion 540和Ion 550芯片之间选择适合您项目规模的方案即可。对于通量较高的实验室,可使用Ion Chef系统、Ion GeneStudio Prime系统和Ion 550芯片在一个工作周内最多测序48个外显子组*。
Ion AmpliSeq外显子组研究解决方案集成软件和生物信息学流程,可生成经注释的外显子组变异重点列表,有助于降低对昂贵生物信息学资源的需求。
Torrent Suite Software 已预配置用于支持Ion AmpliSeq外显子组测序,包括优化的变异检出参数,使您能够更有信心地发现相关变异。Torrent Suite Software提供简明的运行质量报告、覆盖指标访问以及完整的变异检出功能,整个过程无需任何命令行操作技能。
Ion Reporter Software 支持通过小型高效文件,将数据直接从Torrent Suite Software轻松上传至Ion Reporter Software工作流程,使研究人员能够访问已检出变异的公共注释,并通过简单直观的筛选器聚焦于最相关的变异。
对于配对或三联体等更复杂的实验,可使用更高级的Ion Reporter工作流程,在配对或三联体分析中查找某一样本特有的变异。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。
PMR-003068