Ion AmpliSeq ERCC 配套检测组合
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Ion AmpliSeq ERCC 配套检测组合

Ion AmpliSeq RNA ERCC 配套检测组合可与 ERCC RNA 内参混合物配合,可对基因表达实验中的 Ion AmpliSeq了解更多信息
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A3655296 reactions
货号 A36552
价格(CNY)
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96 reactions
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Ion AmpliSeq RNA ERCC 配套检测组合可与 ERCC RNA 内参混合物配合,可对基因表达实验中的 Ion AmpliSeq 转录组文库进行性能评估。向每份 RNA 样品中加入 ERCC RNA 内参混合物,然后在文库制备期间使用 Ion AmpliSeq 转录组检测组合 + Ion AmpliSeq RNA ERCC 配套检测组合对靶标进行扩增。分析测序结果时,将来自测序 ERCC 靶标的数据与内参混合物中已知浓度的 ERCC 靶标进行比较。

Ion AmpliSeq RNA ERCC 配套检测组合与 ERCC RNA 内参混合物配合使用,可提供:
•多次实验和各种平台间 Ion AmpliSeq 转录组基因表达实验的标准基线
• 表达实验检测下限和动态范围的测量
• 通过评估 ERCC 靶标的性能来鉴别降解或低得率样品

多种因素,包括起始材料的质量、细胞结构及 RNA 得率的水平、使用的平台以及进行实验的人员,都可能导致 RNA 表达数据的差异。为了控制这些易变性因素,由美国国家标准技术局召集学术、私人和公共组织建立的外源RNA对照物论坛(External RNA Controls Consortium,ERCC)研发了一套通用外部RNA对照物。该对照品由一组未标记的多腺苷酸化转录本组成,设计用于在样品分离后加入到 RNA 分析实验中,目的是与设定的性能标准进行对照比较。

Ion AmpliSeq RNA ERCC 配套检测组合由 10 个引物对组成,这些引物对靶向 ERCC RNA 内参混合物中的 10 个选定的转录本,代表 13log2 动态范围。选定的 ERCC 靶标针对线性扩增 (TaqMan qPCR) 的一般 GC 平衡和易控性而选出,可在正常实验条件下产生 R2>0.9。
规格
适用于(应用)RNA 测序
适用于(设备)Ion GeneStudio™ S5 系统
产品类型ERCC 配套检测组合
数量96 reactions
运输条件可在室温下或置于湿冰上运输
产品线Ion AmpliSeq™
原始材料RNA
Unit SizeEach
内容与储存
在冷冻冰箱(-5 至 -30°C)中储存。

常见问题解答 (FAQ)

How many reactions can I perform with the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel?

The Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel provides enough reagents to perform 96 manual reactions or 48 automated reactions.

What software do I need to view data from the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel?

To view data from the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel, Torrent Suite Software version 5.10 or later is required and Version 5.10.0.3 or later of the ERCC_Analysis plugin for Torrent Suite Software is required.

Can the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel be used with FFPE samples?

We do not recommend using the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel with FFPE samples or with any panels besides human and mouse Ion AmpliSeq transcriptome gene expression panels.

How much of the Ion Ampliseq RNA ERCC Companion Panel should I add to the target amplification reactions?

We recommend adding 1 µL of the Ion Ampliseq RNA ERCC Companion Panel per manual target amplification reaction and 8 µL per primer pool for an automated target amplification reaction on the Ion Chef Instrument.

Why would one use the Ion AmpliSeq ERCC Companion Panel?

The Ion AmpliSeq ERCC Companion Panel is compatible with Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit and Ion AmpliSeq Transcriptome Mouse Gene Expression Kit (not recommended for use with FFPE samples or panels outside of Ion AmpliSeq Human or Mouse Transcriptome kits). With the addition of the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion panel to your Ion AmpliSeq RNA panel, dynamic range and sensitivity can be similarly evaluated in Ion AmpliSeq RNA libraries that are prepared from RNA samples containing the ERCC RNA Spike-In Mix