CellTracker™ CM-DiI 染料

一种可能性是染料之间的光谱渗漏。务必通过在绿光下成像红色细胞，在红光下成像绿色细胞的方式检查单色样品，对其他颜色使用最佳成像设置。如果您在对照中看到这些渗漏，那么就需要减少染料标记浓度以降低染料的亮度，或者选择那些光谱相距较远的染料。如果不是渗漏的问题，另一种可能性是细胞在染色后没有充分清洗，使得一些未结合的染料残留下来，这些染料进入后会标记其他细胞。延长清洗次数和时间应该会有帮助。

首先，确定您是在无血清条件下进行染色的。因为血清具有酯酶活性，会过早的裂解这些染料上的AM基团，进而阻止其进入细胞。染色之后即可将细胞移回含血清培养基中。除此之外，您可以尝试增加浓度和标记时间以获得更高的强度的信号。

钙黄绿素染料扩散到细胞中，“AM”部分由细胞酯酶切割，随后可以在细胞质中观察到而未结合任何胞内成分。这意味着它们标记了“整个细胞”。但是这也意味着它们可以通过正常细胞的外排机制被泵出。有时这一过程时间很短，尤其是显示出抗药性类型的细胞，除非外排被抑制（如使用丙磺舒抑制外排）。这也意味着染料不能被醛类固定剂所交联（不同于蛋白质结合CellTracker染料），因此染料会在固定时丢失。此外，质膜的任何干扰（例如去垢剂或胰蛋白酶处理）都会导致染料从细胞中渗漏。

这是不推荐的。这些染料与DNA和RNA的结合会影响核酸的正常功能，扰乱转录和增殖。诸如CellTracker染料或Qtracker试剂在不严重扰乱细胞正常活动的条件下对其进行追踪。如果您仍需要使用核酸染料进行标记且细胞是哺乳动物和非血液来源的话，CellLight 细胞核试剂可通过瞬时转染进入细胞，在核表达蛋白上表达GFP或RFP长达数天而不影响其功能。

请浏览这里（https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/cell-analysis/cell-tracing-tracking-and-morphology/cell-tracking.html）以帮助您选择适合您的应用的产品。首先确定追踪细胞的时间，然后考虑染料结合机制。钙黄绿素染料标记均匀且对短期细胞迁移示踪效果极佳，但也会被某些类型细胞迅速外排。亲脂性的花青素染料，如DiI，DIO，和类似的染料能标记细胞膜而不破坏其功能，并且能持续更长时间，但如果发生膜融合则可能会染上其他细胞。此外，它们还会在透化过程中丢失。CellTracker染料更有利于长期标记，其带有温和的氯甲基反应基团使之能够与细胞组分共价结合。CFDA SE也能共价地结合于细胞组分。在所有列出的试剂中，细胞内保留与否取决于细胞分裂的速率和细胞的固有特性（主动外排，膜和蛋白质的周转率等）。其中共价结合试剂比非共价结合的试剂展现出更长的保留时间。

Qtracker试剂是最持久并且荧光强度最高的细胞示踪染料，它通过内吞作用被细胞摄入。在许多样品中它们产生的信号可以持续检测长达数周，而且信号足够强，即使在固定和通透甚至加热和石蜡处理过程中，仍然能够维持较好的荧光信号。