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了解Oncomine Comprehensive Assay v3
用于Genexus系统上的Ion Torrent Oncomine Comprehensive Assay v3可帮助您：
快速分析来自161个基因的相关SNV、indel、CNV和基因融合。这使得您能够最快在次日报告关键癌症类型（包括乳腺癌、结直肠癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌等）的相关生物标志物，并将其与免疫组织化学结果进行整合。
通过高度自动化的工作流程节省技术人员时间，实际操作时间最低仅需20分钟。
利用真正的端到端解决方案（从样本到报告），可降低实施和维护的复杂性与成本，且无需额外的生物信息学专业知识。
仅需20 ng DNA和20 ng RNA即可获得结果，从而能够从少量且质量较低的FFPE样本（如非小细胞肺癌或前列腺癌样本）中获取数据。
按需观看网络研讨会：评估Oncomine Comprehensive Assay v3
观看我们的OCA v3网络研讨会，了解Genexus系统如何实现快速NGS检测。主讲人：来自澳大利亚悉尼 SydPath–St. Vincent's Hospital的Bin Wang医生。
端到端NGS解决方案
Oncomine Comprehensive Assay v3在Genexus系统上仅需两次操作且实际操作时间低至20分钟，通过自动化核酸提取与定量、文库制备、测序与分析，可减轻实验室人员负担并降低人为错误风险，同时减少对专门生物信息学专业知识的依赖。
Oncomine Comprehensive Assay v3在 Genexus纯化系统上可直接从FFPE样本起始，也可在Genexus一体化测序仪上从已纯化的核酸起始。运行类型包括仅DNA、仅RNA或同时进行DNA和 RNA的联合检测。
NGS测序系统
Oncomine Comprehensive Assay v3可在Genexus系统上使用，亦可在Ion GeneStudio S5系统上使用，后者支持手动或自动化的文库制备。
多种肿瘤中精准肿瘤学研究的相关生物标志物
Oncomine Comprehensive Assay v3覆盖了精准肿瘤学研究中最相关的生物标志物，包括来自161个基因的 SNV（单核苷酸变异）、indel（插入/缺失）、CNV（拷贝数变异）和基因融合，这些基因涵盖驱动基因与抑癌基因。图中显示了该panel所包含基因的一个子集。
随着DNA损伤修复基因在多种癌症（包括乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌）中的重要性日益凸显，Oncomine Comprehensive Assay v3包含同源重组修复（HRR）通路相关基因，包括ATM、BRCA1、BRCA2、CDK12、CHEK1、CHEK2、PALB2、RAD51B、RAD51C、RAD51D 等，从而实现通过单一流程同时分析HRR基因。
基因覆盖范围
| 热点基因 | 全长基因 | 拷贝数基因 | 基因融合（基因间与基因内） | ||||||
| AKT1 | FGFR4 | MED12 | SRC | ARID1A | PALB2 | AKT1 | MDM2 | AKT2 | NF1 |
| AKT2 | FLT3 | MET | STAT3 | ATM | PIK3R1 | AKT2 | MDM4 | ALK | NOTCH1 |
| AKT3 | FOXL2 | MTOR | TERT | ATR | PMS2 | AKT3 | MET | AR | NOTCH4 |
| ALK | GATA2 | MYC | TOP1 | ATRX | POLE | ALK | MYC | AXL | NRG1 |
| AR | GNA11 | MYCN | U2AF1 | BAP1 | PTCH1 | AR | MYCL | BRAF | NTRK1 |
| ARAF | GNAQ | MYD88 | XPO1 | BRCA1 | PTEN | AXL | MYCN | BRCA1 | NTRK2 |
| AXL | GNAS | NFE2L2 | BRCA2 | RAD50 | BRAF | NTRK1 | BRCA2 | NTRK3 | |
| BRAF | H3F3A | NRAS | CDK12 | RAD51 | CCND1 | NTRK2 | CDKN2A | NUTM1 | |
| BTK | HIST1H3B | NTRK1 | CDKN1B | RAD51B | CCND2 | NTRK3 | EGFR | PDGFRA | |
| CBL | HNF1A | NTRK2 | CDKN2A | RAD51C | CCND3 | PDGFRA | ERBB2 | PDGFRB | |
| CCND1 | HRAS | NTRK3 | CDKN2B | RAD51D | CCNE1 | PDGFRB | ERBB4 | PIK3CA | |
| CDK4 | IDH1 | PDGFRA | CHEK1 | RB1 | CDK2 | PIK3CA | ERG | PPARG | |
| CDK6 | IDH2 | PDGFRB | CREBBP | RNF43 | CDK4 | PIK3CB | ESR1 | PRKACA | |
| CHEK2 | JAK1 | PIK3CA | FANCA | SETD2 | CDK6 | PPARG | ETV1 | PRKACB | |
| CSF1R | JAK2 | PIK3CB | FANCD2 | SLX4 | EGFR | RICTOR | ETV4 | PTEN | |
| CTNNB1 | JAK3 | PPP2R1A | FANCI | SMARCA4 | ERBB2 | TERT | ETV5 | RAD51B | |
| DDR2 | KDR | PTPN11 | FBXW7 | SMARCB1 | ESR1 | FGFR1 | RAF1 | ||
| EGFR | KIT | RAC1 | MLH1 | STK11 | FGF19 | FGFR2 | RB1 | ||
| ERBB2 | KNSTRN | RAF1 | MRE11A | TP53 | FGF3 | FGFR3 | RELA | ||
| ERBB3 | KRAS | RET | MSH2 | TSC1 | FGFR1 | FGR | RET | ||
| ERBB4 | MAGOH | RHEB | MSH6 | TSC2 | FGFR2 | FLT3 | ROS1 | ||
| ERCC2 | MAP2K1 | RHOA | NBN | FGFR3 | JAK2 | RSPO2 | |||
| ESR1 | MAP2K2 | ROS1 | NF1 | FGFR4 | KRAS | RSPO3 | |||
| EZH2 | MAP2K4 | SF3B1 | NF2 | FLT3 | MDM4 | TERT | |||
| FGFR1 | MAPK1 | SMAD4 | NOTCH1 | IGF1R | MET | ||||
| FGFR2 | MAX | SMO | NOTCH2 | KIT | MYB | ||||
| FGFR3 | MDM4 | SPOP | NOTCH3 | KRAS | MYBL1 | ||||
订购信息
适用于Ion GeneStudio S5系统
适用于Genexus系统
仅供研究用途。不得用于诊断程序。