疫苗筛选

利用蛋白质组学技术:高通量的鉴定链球菌表面的膜蛋白,筛选候选疫苗

近年来,比较基因组学、蛋白质组学、抗原组学等的发展,病原体毒力相关蛋白、分泌性蛋白和膜表面结合蛋白基因可以被分离出来,从而可以更加准确地分析候选抗原,极大地提高了疫苗抗原分析的效率。基于Orbitrap原理的超高分辨液质联用仪,凭借其出色的分辨力、灵敏度、动态范围及质量精度,一直以来都是蛋白质组学领域的金标准。利用蛋白质组学技术:高通量的鉴定链球菌表面的膜蛋白,筛选候选疫苗。

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基因组数据
  • 基因组/转录组测序
膜蛋白的提取
  • Trypsin or proteinase K 酶切
鉴定
  • LC-MS/MS 鉴定
膜蛋白的确认
  • PSORT拓扑预测流式分析

重组蛋白类疫苗表征分析

在重组蛋白类疫苗的表征分析中,Orbitrap超高分辨质谱主要应用于:一级结构分子量测定、肽图分析、糖型分析以及氢氘交换技术的高级结构分析。Orbitrap超高分辨质谱在重组蛋白类疫苗领域拥有全面的解决方案包括样品前处理、数据采集及解析的详细教程,加速疫苗的发现、开发和质量控制进程,实现高效产出。

 

多糖疫苗与多糖结合疫苗

多糖结合疫苗的糖类化合物在紫外区一般无吸收或吸收较弱,一般的检测器不能对其进行直接检测。离子色谱根据不同糖类化合物酸碱系数差异引起的离子交换作用差异,以及某些糖类与阴离子交换树脂之间疏水性作用不同,实现糖类化合物的高效阴离子交换、分离。再根据羟基在金电极表面发生氧化反应产生的电流实现糖类、氨基糖类和糖酸的检测。离子色谱可有效的应用于疫苗中游离单糖、游离多糖、蛋白结合多糖、杂质多糖的检测。

mRNA疫苗

mRNA疫苗打破了传统灭活、减毒疫苗的免疫激活模式,创新性地利用人体本身细胞生产抗原,以此激活特异性免疫。mRNA疫苗的保护率极高,能达到90%。在研发上,mRNA疫苗能够快速地更新迭代以应对不断出现的变异毒株,且生产过程短,只需要60-70天。对于新型冠状病毒疫苗的研制,除了抗原设计外,选择合适的载体也是至关重要的。

 

mRNA疫苗质谱表征方法

编码新冠突刺蛋白的mRNA (3900nt)样品分析,首先用反相离子对色谱检测mRNA样品纯度,如下图a所示。采用上述mRNA mapping分析平台,从前处理到液质表征分析,得到如下结果:图b显示mRNA样品经过RNase T1酶解后的总离子流图,由于部分酶解,得到的片段较长,具有高特异性;与理论碱基序列匹配,在严格的数据筛选条件下,可得到98.5%的序列覆盖度。

 

 

基于Orbitrap高分辨质谱核酸分析平台,可以实现mRNA加帽效率、ployA尾分析、mRNA mapping、杂质鉴定及定量等功能,为疫苗开发和质控提供更精确可靠的数据。

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利用蛋白质组学技术:高通量的鉴定链球菌表面的膜蛋白,筛选候选疫苗

近年来,比较基因组学、蛋白质组学、抗原组学等的发展,病原体毒力相关蛋白、分泌性蛋白和膜表面结合蛋白基因可以被分离出来,从而可以更加准确地分析候选抗原,极大地提高了疫苗抗原分析的效率。基于Orbitrap原理的超高分辨液质联用仪,凭借其出色的分辨力、灵敏度、动态范围及质量精度,一直以来都是蛋白质组学领域的金标准。利用蛋白质组学技术:高通量的鉴定链球菌表面的膜蛋白,筛选候选疫苗。

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膜蛋白的提取
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膜蛋白的确认
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重组蛋白类疫苗表征分析

在重组蛋白类疫苗的表征分析中,Orbitrap超高分辨质谱主要应用于:一级结构分子量测定、肽图分析、糖型分析以及氢氘交换技术的高级结构分析。Orbitrap超高分辨质谱在重组蛋白类疫苗领域拥有全面的解决方案包括样品前处理、数据采集及解析的详细教程,加速疫苗的发现、开发和质量控制进程,实现高效产出。

 

多糖疫苗与多糖结合疫苗

多糖结合疫苗的糖类化合物在紫外区一般无吸收或吸收较弱,一般的检测器不能对其进行直接检测。离子色谱根据不同糖类化合物酸碱系数差异引起的离子交换作用差异,以及某些糖类与阴离子交换树脂之间疏水性作用不同,实现糖类化合物的高效阴离子交换、分离。再根据羟基在金电极表面发生氧化反应产生的电流实现糖类、氨基糖类和糖酸的检测。离子色谱可有效的应用于疫苗中游离单糖、游离多糖、蛋白结合多糖、杂质多糖的检测。

mRNA疫苗

mRNA疫苗打破了传统灭活、减毒疫苗的免疫激活模式,创新性地利用人体本身细胞生产抗原,以此激活特异性免疫。mRNA疫苗的保护率极高,能达到90%。在研发上,mRNA疫苗能够快速地更新迭代以应对不断出现的变异毒株,且生产过程短,只需要60-70天。对于新型冠状病毒疫苗的研制,除了抗原设计外,选择合适的载体也是至关重要的。

 

mRNA疫苗质谱表征方法

编码新冠突刺蛋白的mRNA (3900nt)样品分析,首先用反相离子对色谱检测mRNA样品纯度,如下图a所示。采用上述mRNA mapping分析平台,从前处理到液质表征分析,得到如下结果:图b显示mRNA样品经过RNase T1酶解后的总离子流图,由于部分酶解,得到的片段较长,具有高特异性;与理论碱基序列匹配,在严格的数据筛选条件下,可得到98.5%的序列覆盖度。

 

 

基于Orbitrap高分辨质谱核酸分析平台,可以实现mRNA加帽效率、ployA尾分析、mRNA mapping、杂质鉴定及定量等功能,为疫苗开发和质控提供更精确可靠的数据。

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