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微生物鉴定
MicroSEQ 微生物鉴定系统——用于准确鉴定的强大数据库
全球顶级制药公司采用的 Applied Biosystems MicroSEQ 快速微生物鉴定系统，是小分子和生物制药生产以及服务实验室进行环境监测、污染调查、根本原因分析、原材料测试和微生物鉴定的理想选择。MicroSEQ 系统结合了 PCR 和 DNA 测序技术的优势，可获得高度准确的结果。
实现准确微生物鉴定的关键在于拥有强大的数据库。MicroSEQ ID 系统是目前功能最强大的数据库，因为它以精选的数据集为基础，并经过多种技术验证，可实现准确的鉴定。我们不仅仅收集其他来源的数据，还验证自己的发现并确认所有条目的准确性。这个经过最广泛验证和最精选的计算机模拟数据库值得信赖，其中包含了经过我们的科学家和合作者验证的 10,000 多种菌株类型。
MicroSEQ 微生物鉴定系统
经验证
赛默飞世尔科技对新发现和已存在的细菌和真菌物种的准确分类信息进行了严格验证。从序列信息录入、属种水平验证到对现有 MicroSEQ 数据库条目的再次验证——全部由经过培训的人员完成——为您的制药 QC 测试提供最全面、准确、可靠的数据库。
精选内容
我们仔细评估了我们的数据库并总结了对于我们的药品QC客户来说，真正重要的是什么——质量和准确性。 我们为此增加了念珠菌、枝孢菌、曲霉菌的数量并为真菌数据库的 223 个新菌属增加了菌种。我们与荷兰皇家艺术与科学学院的 Westerdijk 真菌生物多样性研究所合作，为真菌鉴定和分类提供最新的、可靠的序列信息。
持续更新
赛默飞世尔科技为增强该数据库的功能，开发出 MicroSEQ ID 软件文库订阅服务。这项独特的服务通过定期更新经过质量检查和验证的细菌和真菌序列，有助于确保您的 MicroSEQ ID 数据库保持最新状态。
订阅 MicroSEQ ID 软件文库
立即订阅以使您的 MicroSEQ ID 数据库始终保持最新状态。我们的 MicroSEQ ID 文库订阅服务计划在 2019 年至 2020 年期间提供经过精选的真菌 D2 和微生物 16S 500 序列文库定期更新。
为支持制药生产环境中的主动环境监测计划，并为产品和工艺实施准确的纠正和预防措施 (CAPA) 以降低污染风险，需要准确鉴定环境隔离株。核糖体 DNA (rDNA) 的比较基因序列分析已被证明是准确性最高的微生物鉴定系统技术，并且在近十多年中一直被认为是微生物鉴定的金标准。MicroSEQ ID 微生物鉴定系统基于对 16S 区域（细菌）或 LSU D2 区域（真菌）的比较 rDNA 测序，是快速、准确、可靠的微生物鉴定方法。
细菌
细菌鉴定的靶标是 16S 核糖体 RNA (rRNA) 基因序列。16S rRNA 普遍存在，因此可用于研究所有细菌之间的系统发育关系。使用 MicroSEQ ID 方法，用户可以选择对 16S rDNA 基因的前 500 bp 或完整的 1,500 bp 长度测序。两种选择均可使用试剂盒和经过验证的支持文库数据库。前 500 bp 涵盖 16S 基因 9 个高变区中的 3 个，能够满足常规鉴定需求（图 1）。在某些情况下，500 bp 区域不足以区分非常密切相关的细菌，因此需要信息量更大的全基因读取（图 2）。此外，在描述新物种时，需要对整个 1,500 bp 序列进行测序。
真菌和酵母菌
对真核核糖体大亚基中较大 rRNA 分子的扩展区域 D2 (LSU-D2) 和 ITS 区域进行对比序列分析，已被成功用于对真菌进行物种水平的鉴定和分类。ITS 区域表现出更大的可变性，根据序列鉴定真菌时，其产生的“序列类型”比 D2 区域更多。真菌基因组可能包含超过 100 个 rDNA 簇的拷贝；因此，其对于理解和区分反映实际相关性的简单序列变异性和序列变异性至关重要。MicroSEQ ID 真菌数据库来自 LSU-D2 rDNA 序列，有助于在常规鉴定测试中实现高度可靠的真菌鉴定和分类。
图 1.16S rRNA 基因中的高变区。细菌 16S 基因内有 9 个高变区，以绿色表示。保守区域用蓝色表示。
图 2.来自前 500 bp 的序列数据（下图）不足以区分脓肿分枝杆菌 (ATCC 19977) 和龟分枝杆菌 (ATCC 35752)。而完整的 1,500 bp 序列（上图）可以区分这两个物种。同样，当使用完整 1,500 bp 序列进行分析时，产鼻疽分支杆菌 (ATCC 35753) 与塞内加尔分支杆菌 (ATCC 35796) 以及非洲分枝杆菌 (ATCC 25420)与田鼠分枝杆菌 (ATCC 19422)之间的差异变得更加明显。
微生物鉴定软件解决方案
MicroSEQ ID 微生物鉴定软件是 QC 微生物实验室环境中研究人员鉴定和分类细菌和真菌序列集成工作流程的一部分。
- 使用包含 2,300 多个经验证的微生物序列的文库，鉴定目标序列
- 可直接在 Applied Biosystems 3500/3500xl 仪器平台上设置和运行板
- 可分析来自 Applied Biosystems 3730/xl、3130/xl 和 310 分析仪的数据
- 支持 Windows™ 7 操作系统并经过全面测试
- 具有安全、审计和电子签名功能，有助于符合 21 CFR part 11（美国联邦法规第 21 章第 11 款）的要求
视频：了解 MicroSEQ ID 软件 3.0 版引入的功能：
为支持制药生产环境中的主动环境监测计划，并为产品和工艺实施准确的纠正和预防措施 (CAPA) 以降低污染风险，需要准确鉴定环境隔离株。核糖体 DNA (rDNA) 的比较基因序列分析已被证明是准确性最高的微生物鉴定系统技术，并且在近十多年中一直被认为是微生物鉴定的金标准。MicroSEQ ID 微生物鉴定系统基于对 16S 区域（细菌）或 LSU D2 区域（真菌）的比较 rDNA 测序，是快速、准确、可靠的微生物鉴定方法。
细菌
细菌鉴定的靶标是 16S 核糖体 RNA (rRNA) 基因序列。16S rRNA 普遍存在，因此可用于研究所有细菌之间的系统发育关系。使用 MicroSEQ ID 方法，用户可以选择对 16S rDNA 基因的前 500 bp 或完整的 1,500 bp 长度测序。两种选择均可使用试剂盒和经过验证的支持文库数据库。前 500 bp 涵盖 16S 基因 9 个高变区中的 3 个，能够满足常规鉴定需求（图 1）。在某些情况下，500 bp 区域不足以区分非常密切相关的细菌，因此需要信息量更大的全基因读取（图 2）。此外，在描述新物种时，需要对整个 1,500 bp 序列进行测序。
真菌和酵母菌
对真核核糖体大亚基中较大 rRNA 分子的扩展区域 D2 (LSU-D2) 和 ITS 区域进行对比序列分析，已被成功用于对真菌进行物种水平的鉴定和分类。ITS 区域表现出更大的可变性，根据序列鉴定真菌时，其产生的“序列类型”比 D2 区域更多。真菌基因组可能包含超过 100 个 rDNA 簇的拷贝；因此，其对于理解和区分反映实际相关性的简单序列变异性和序列变异性至关重要。MicroSEQ ID 真菌数据库来自 LSU-D2 rDNA 序列，有助于在常规鉴定测试中实现高度可靠的真菌鉴定和分类。
图 1.16S rRNA 基因中的高变区。细菌 16S 基因内有 9 个高变区，以绿色表示。保守区域用蓝色表示。
图 2.来自前 500 bp 的序列数据（下图）不足以区分脓肿分枝杆菌 (ATCC 19977) 和龟分枝杆菌 (ATCC 35752)。而完整的 1,500 bp 序列（上图）可以区分这两个物种。同样，当使用完整 1,500 bp 序列进行分析时，产鼻疽分支杆菌 (ATCC 35753) 与塞内加尔分支杆菌 (ATCC 35796) 以及非洲分枝杆菌 (ATCC 25420)与田鼠分枝杆菌 (ATCC 19422)之间的差异变得更加明显。
微生物鉴定软件解决方案
MicroSEQ ID 微生物鉴定软件是 QC 微生物实验室环境中研究人员鉴定和分类细菌和真菌序列集成工作流程的一部分。
- 使用包含 2,300 多个经验证的微生物序列的文库，鉴定目标序列
- 可直接在 Applied Biosystems 3500/3500xl 仪器平台上设置和运行板
- 可分析来自 Applied Biosystems 3730/xl、3130/xl 和 310 分析仪的数据
- 支持 Windows™ 7 操作系统并经过全面测试
- 具有安全、审计和电子签名功能，有助于符合 21 CFR part 11（美国联邦法规第 21 章第 11 款）的要求
视频：了解 MicroSEQ ID 软件 3.0 版引入的功能：
专题视频
技术资源
手册和产品宣传册
产品宣传册：MicroSEQ 微生物鉴定系统
宣传页：MicroSEQ ID IQ/OQ 服务、执行和培训
产品信息单页MicroSEQ ID Purification Combo 试剂盒 v2.0
生物工艺资源
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仅供科研使用，不可用于诊断目的。