直接 PCR:实现 PCR 直接扩增的通用预混液

直接 PCR 可直接从样本中扩增 DNA 序列,无需提取和纯化 DNA。Invitrogen Platinum Direct PCR 通用预混液是从粗提样本中扩增靶标 DNA 的理想选择,适用于小鼠基因分型、CRISPR 编辑细胞分析以及从有限材料中检测靶标 DNA 等应用场景。

观看这段视频,了解什么是直接 PCR、它的工作原理以及如何充分利用直接 PCR 试剂盒。

Platinum Direct PCR 通用预混液的优势特点

该预混液采用 Invitrogen Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶配制而成,具有高抑制剂耐受性、快速 DNA 合成能力和高灵敏度扩增能力。除 DNA 聚合酶之外,预混液还包含缓冲液、dNTP 和其他反应组分,以及可直接凝胶电泳上样的绿色染料。产品包装中还单独配备了裂解缓冲液、蛋白酶 K 和 Invitrogen Platinum GC 增强剂,以支持完整的实验流程。Platinum Direct PCR 预混液提供两种从粗提样本中扩增靶标 DNA 的方案(图 1):直接方案中,样本可直接加入预混液进行扩增;裂解方案中,样本先经过裂解处理再进行扩增。样本在裂解缓冲液中可保存长达 12 个月。

优势包括:

  • 通用型——一种预混液适用于不同样本类型,一种退火温度适用于不同引物
  • 方便——缓冲液经优化实现在 60 °C 进行引物退火,减少了 PCR 优化步骤
  • 快速——无需 DNA 纯化;DNA 合成速度为 20 s/ kb
  • 高效——高抑制剂耐受性;包含 GC enhancer,用于扩增高 GC 含量序列
  • 灵活——提供可选的裂解方案,可用于样本长期储存和进一步检测
  • 减少移液——预混液含上样染料,扩增后可直接上样电泳
Product photo of package, four tubes of reagents, and one vial of lysis buffer

Platinum Direct PCR 通用预混液减少了有害试剂的使用,与使用离心柱的传统 DNA 提取流程相比,产生的塑料废弃物减少 99%。

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使用 Platinum 直接 PCR 通用预混液检测的样本

人源组织

Platinum直接 PCR 通用预混液可从各种人源组织中成功扩增靶标 DNA 序列,这些组织包括唾液、口腔拭子、血液(保存于柠檬酸盐、肝素或 EDTA 中)、指甲、头发和 HeLa S3 细胞等。

小鼠样本

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从各种类型小鼠组织(耳、尾巴、肾脏、心脏、胰腺、肝脏、脾脏、脑、头发、骨髓、骨骼和牙齿)中扩增出靶标 DNA 序列。

植物样本

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从各种植物组织中扩增出靶标 DNA 序列,植物组织包括小麦叶、烟草叶、桦木叶、枫叶、木兰叶、兰花叶、拟南芥叶片、玫瑰叶、菩提树叶、丁香叶、草莓叶、淤泥草莓叶、崖柏叶、松树穗、云杉穗、玫瑰果花瓣、草莓、玉米种子、花生、小麦种子、烟草种子、向日葵种子和小麦根。

藻类

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从含或不含细胞壁的藻类中成功扩增出靶标DNA 序列。

鸟类组织

Platinum直接 PCR 通用预混液成功地从各种鸟类组织(鸡软骨、鸡肉和鹌鹑羽毛)中成功扩增出靶标 DNA 序列

细菌种类

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中扩增出靶 DNA 序列。

图 7.对细菌直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液直接从革兰氏阴性菌(Escherichia coli )和革兰氏阳性菌(Bacillus subtilis )菌中分别扩增出 0.62 kb 和 0.59 kb 片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

斑马鱼组织

Platinum直接PCR 通用预混液成功从斑马鱼多种组织-鳍、鳞片、肌肉和大脑中成功扩增出靶标 DNA 序列。

图 9.对斑马鱼直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从斑马鱼组织中扩增出 0.35 kb 和 1 kb 片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。可以看到,可从斑马鱼的鳍、鳞片、肌肉和大脑组织中成功扩增出目的片段。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

果蝇组织

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从Drosophila各种组织(全身、半身、头部、半幼虫)中直接扩增出靶标 DNA 序列。

图 10.直接对Drosophila直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从各种Drosophila 各种组织中扩增 0.66 kb 的片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增从果蝇身体、头部和幼虫中均成功进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

血液

Platinum直接 PCR 通用预混液从保存在柠檬酸、肝素或 EDTA 中的人血中成功直接扩增出靶标 DNA 序列。

Gel image with six lanes of sample flanked by two lanes of ladders

图 11.对人血样本直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从保存在柠檬酸、肝素或 EDTA 中的人血中直接扩增出 0.35 kb 和 7.5 kb 的片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

FFPE样本

Platinum直接PCR 通用预混液从小鼠肾脏 FFPE 样本中成功扩增出靶标 DNA 序列。

人源组织

Platinum直接 PCR 通用预混液可从各种人源组织中成功扩增靶标 DNA 序列,这些组织包括唾液、口腔拭子、血液(保存于柠檬酸盐、肝素或 EDTA 中)、指甲、头发和 HeLa S3 细胞等。

小鼠样本

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从各种类型小鼠组织(耳、尾巴、肾脏、心脏、胰腺、肝脏、脾脏、脑、头发、骨髓、骨骼和牙齿)中扩增出靶标 DNA 序列。

植物样本

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从各种植物组织中扩增出靶标 DNA 序列,植物组织包括小麦叶、烟草叶、桦木叶、枫叶、木兰叶、兰花叶、拟南芥叶片、玫瑰叶、菩提树叶、丁香叶、草莓叶、淤泥草莓叶、崖柏叶、松树穗、云杉穗、玫瑰果花瓣、草莓、玉米种子、花生、小麦种子、烟草种子、向日葵种子和小麦根。

藻类

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从含或不含细胞壁的藻类中成功扩增出靶标DNA 序列。

鸟类组织

Platinum直接 PCR 通用预混液成功地从各种鸟类组织(鸡软骨、鸡肉和鹌鹑羽毛)中成功扩增出靶标 DNA 序列

细菌种类

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中扩增出靶 DNA 序列。

图 7.对细菌直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液直接从革兰氏阴性菌(Escherichia coli )和革兰氏阳性菌(Bacillus subtilis )菌中分别扩增出 0.62 kb 和 0.59 kb 片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

斑马鱼组织

Platinum直接PCR 通用预混液成功从斑马鱼多种组织-鳍、鳞片、肌肉和大脑中成功扩增出靶标 DNA 序列。

图 9.对斑马鱼直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从斑马鱼组织中扩增出 0.35 kb 和 1 kb 片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。可以看到,可从斑马鱼的鳍、鳞片、肌肉和大脑组织中成功扩增出目的片段。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

果蝇组织

Platinum直接 PCR 通用预混液成功从Drosophila各种组织(全身、半身、头部、半幼虫)中直接扩增出靶标 DNA 序列。

图 10.直接对Drosophila直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从各种Drosophila 各种组织中扩增 0.66 kb 的片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增从果蝇身体、头部和幼虫中均成功进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

血液

Platinum直接 PCR 通用预混液从保存在柠檬酸、肝素或 EDTA 中的人血中成功直接扩增出靶标 DNA 序列。

Gel image with six lanes of sample flanked by two lanes of ladders

图 11.对人血样本直接进行 DNA 扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液从保存在柠檬酸、肝素或 EDTA 中的人血中直接扩增出 0.35 kb 和 7.5 kb 的片段。使用裂解方案进行直接PCR扩增。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

FFPE样本

Platinum直接PCR 通用预混液从小鼠肾脏 FFPE 样本中成功扩增出靶标 DNA 序列。

Platinum 直接 PCR 通用预混液的优势

Platinum直接 PCR 预混液的缓冲液含独特配方,有助于减少 PCR 扩增中繁琐的优化步骤。创新的缓冲液使得引物能够在 60°C(通用退火温度)下退火,无论引物序列如何(按照常规引物设计规则)(图 13)。当在退火步骤中使用自己计算出的Tm 时,也可进行成功扩增(数据未显示)。

借助创新型缓冲液,Platinum直接 PCR 通用预混液可实现使用通用退火温度、灵活的延伸时间,从而使得不同PCR反应可以同时进行扩增。

图 14.通用 PCR 方案可节省时间并实现不同PCR反应同时扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液,对于不同的PCR反应,均可使用一种方案(通用的引物退火温度和基于最长片段计算的延长时间),从而实现不同 PCR同时进行扩增(图 15)。

图 15.Platinum直接 PCR 通用预混液可实现短片段和长片段的同时扩增。从不同物种和组织类型的样本中同时扩增出 0.2 kb、0.6 kb、1 kb、1.5 kb 和 2 kb 的片段,均使用同一种扩增方案:94℃ 变性 15 秒,60℃ 退火 15 秒,68℃ 延伸 40 秒。延伸时间按最长靶标进行计算。

To learn more about universal protocol, view the Spotlight article: PCR simplified with universal primer annealing

Platinum 直接 PCR 通用预混液为绿色预混液,可用于 PCR 产物的直接凝胶上样,省去了向PCR产物中添加染料的繁琐步骤,同时有助于减少移液误差,缩短动手操作时间。

直接凝胶上样工作流程

图 16.绿色预混液可实现 PCR 产物直接上样至凝胶进行电泳检测。Platinum直接 PCR 通用预混液包含一种密度试剂和两种示踪染料。使用两种染料(蓝色和黄色)可轻松跟踪 DNA 的迁移,这两种染料在电泳过程中易于查看(泳道分别如右图中 5 分钟和 15 分钟所示)。

Platinum直接PCR 预混液提供两种从粗样中扩增靶 DNA 的方案。在直接方案中,将推荐大小的样本直接加入到预混液中。在裂解方案中,首先将推荐大小的样本进行裂解,然后将一部分上清液加入预混液中。直接方案的流程较短,而裂解方案的流程较为灵活,样本可以储存( 图 17 )。直接 PCR 方案可扩增长达 2 kb的片段,而裂解方案可扩增长达 8 kb的片段。样品可在裂解缓冲液中保存长达12个月

样本大小和样本量对于直接PCR 的成功扩增至关重要。样本量太少会由于模板起始量不足而导致 PCR 扩增失败。另一方面,样本量太多会引入太多可抑制 PCR 扩增的细胞组分和碎片( 图 18 )。Platinum直接 PCR 通用预混液使用手册中提供了建议的样本量。

图 17.直接方案与裂解方案。

图 18.直接方案和裂解方案的建议样本大小(未提供实际大小)。通常,使用0.5–1.0 mm 的固体样本用于直接方案。尽管裂解方案可使用多达 10 mm 的样本,但建议裂解方案使用 0.5–2.0 mm 大小的样本。有关不同样本类型的详细建议,请参阅产品手册。

Platinum直接 PCR 预混液的缓冲液含独特配方,有助于减少 PCR 扩增中繁琐的优化步骤。创新的缓冲液使得引物能够在 60°C(通用退火温度)下退火,无论引物序列如何(按照常规引物设计规则)(图 13)。当在退火步骤中使用自己计算出的Tm 时,也可进行成功扩增(数据未显示)。

借助创新型缓冲液,Platinum直接 PCR 通用预混液可实现使用通用退火温度、灵活的延伸时间,从而使得不同PCR反应可以同时进行扩增。

图 14.通用 PCR 方案可节省时间并实现不同PCR反应同时扩增。使用 Platinum直接 PCR 通用预混液,对于不同的PCR反应,均可使用一种方案(通用的引物退火温度和基于最长片段计算的延长时间),从而实现不同 PCR同时进行扩增(图 15)。

图 15.Platinum直接 PCR 通用预混液可实现短片段和长片段的同时扩增。从不同物种和组织类型的样本中同时扩增出 0.2 kb、0.6 kb、1 kb、1.5 kb 和 2 kb 的片段,均使用同一种扩增方案:94℃ 变性 15 秒,60℃ 退火 15 秒,68℃ 延伸 40 秒。延伸时间按最长靶标进行计算。

To learn more about universal protocol, view the Spotlight article: PCR simplified with universal primer annealing

Platinum 直接 PCR 通用预混液为绿色预混液,可用于 PCR 产物的直接凝胶上样,省去了向PCR产物中添加染料的繁琐步骤,同时有助于减少移液误差,缩短动手操作时间。

直接凝胶上样工作流程

图 16.绿色预混液可实现 PCR 产物直接上样至凝胶进行电泳检测。Platinum直接 PCR 通用预混液包含一种密度试剂和两种示踪染料。使用两种染料(蓝色和黄色)可轻松跟踪 DNA 的迁移,这两种染料在电泳过程中易于查看(泳道分别如右图中 5 分钟和 15 分钟所示)。

Platinum直接PCR 预混液提供两种从粗样中扩增靶 DNA 的方案。在直接方案中,将推荐大小的样本直接加入到预混液中。在裂解方案中,首先将推荐大小的样本进行裂解,然后将一部分上清液加入预混液中。直接方案的流程较短,而裂解方案的流程较为灵活,样本可以储存( 图 17 )。直接 PCR 方案可扩增长达 2 kb的片段,而裂解方案可扩增长达 8 kb的片段。样品可在裂解缓冲液中保存长达12个月

样本大小和样本量对于直接PCR 的成功扩增至关重要。样本量太少会由于模板起始量不足而导致 PCR 扩增失败。另一方面,样本量太多会引入太多可抑制 PCR 扩增的细胞组分和碎片( 图 18 )。Platinum直接 PCR 通用预混液使用手册中提供了建议的样本量。

图 17.直接方案与裂解方案。

图 18.直接方案和裂解方案的建议样本大小(未提供实际大小)。通常,使用0.5–1.0 mm 的固体样本用于直接方案。尽管裂解方案可使用多达 10 mm 的样本,但建议裂解方案使用 0.5–2.0 mm 大小的样本。有关不同样本类型的详细建议,请参阅产品手册。

使用 Platinum 直接 PCR 通用预混液提高 PCR 效率

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶设计而成,该酶是一种可快速进行 DNA 合成的基因工程酶。因此,与其它直接 PCR 试剂盒相比,Platinum 直接 PCR 预混液可以更快地获得 PCR 结果(图 19)。

Platinum直接 PCR 通用预混液的直接方案和裂解方案所扩增片段的大小范围。

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶含有 Invitrogen Platinum 热启动技术。这项基于抗体的热启动技术在使用粗样进行直接 DNA 扩增时呈现出卓越的特异性。

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶设计而成,该酶是一种高灵敏度的基因工程酶。因此,可以使用 Platinum直接 PCR 预混液检测低样本起始量的靶序列。

Platinum直接 PCR 通用预混液可从 高AT含量和高GC含量模板中进行高效扩增。产品随附提供一管单独的 Platinum GC Enhancer,用于对高 GC 含量的靶标进行扩增,提高扩增特异性和产量。

Platinum Direct PCR 通用预混液在室温下的扩展稳定性可实现高通量分析。该酶的 Platinum 热启动技术可确保室温稳定性和试剂盒的高特异性。

图 25.使用Platinum直接 PCR 通用预混液配制的反应体系在室温下保持稳定。使用 Platinum直接 PCR 预混液的裂解方案,从鼠尾扩增一个 2.2 kb 的片段。反应体系在室温(25°C)或在冰上(4°C)进行配制,然后立即进行 PCR 或在室温(25°C)下放置 8 小时后再进行PCR。可以看到即使在室温下放置 8 小时后,Platinum直接 PCR 预混液仍可获得具有高特异性和高产率的结果。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶设计而成,该酶是一种可快速进行 DNA 合成的基因工程酶。因此,与其它直接 PCR 试剂盒相比,Platinum 直接 PCR 预混液可以更快地获得 PCR 结果(图 19)。

Platinum直接 PCR 通用预混液的直接方案和裂解方案所扩增片段的大小范围。

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶含有 Invitrogen Platinum 热启动技术。这项基于抗体的热启动技术在使用粗样进行直接 DNA 扩增时呈现出卓越的特异性。

Platinum直接 PCR 通用预混液使用 Platinum II Taq 热启动 DNA 聚合酶设计而成,该酶是一种高灵敏度的基因工程酶。因此,可以使用 Platinum直接 PCR 预混液检测低样本起始量的靶序列。

Platinum直接 PCR 通用预混液可从 高AT含量和高GC含量模板中进行高效扩增。产品随附提供一管单独的 Platinum GC Enhancer,用于对高 GC 含量的靶标进行扩增,提高扩增特异性和产量。

Platinum Direct PCR 通用预混液在室温下的扩展稳定性可实现高通量分析。该酶的 Platinum 热启动技术可确保室温稳定性和试剂盒的高特异性。

图 25.使用Platinum直接 PCR 通用预混液配制的反应体系在室温下保持稳定。使用 Platinum直接 PCR 预混液的裂解方案,从鼠尾扩增一个 2.2 kb 的片段。反应体系在室温(25°C)或在冰上(4°C)进行配制,然后立即进行 PCR 或在室温(25°C)下放置 8 小时后再进行PCR。可以看到即使在室温下放置 8 小时后,Platinum直接 PCR 预混液仍可获得具有高特异性和高产率的结果。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

直接 PCR 试剂盒的性能测试数据

使用商业化直接 PCR 试剂盒,对烟草叶片样本(图 26)和烟草种子样本(图 27)进行检测,比较目标片段的扩增产量和特异性。

图 26.对烟草叶片进行稳定的直接 DNA 扩增。使用直接方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量地从烟叶中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.15 kb、0.6 kb、0.75 kb、1.6 kb 和 2.2 kb)。同时使用市售同类直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

图 27.对烟草种子进行稳定的直接 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量地从烟草种子中直接扩增一系列不同大小地DNA片段(0.15 kb、0.6 kb、1.6 kb 和 2.2 kb)。同时使用市售同类其它直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接 PCR 试剂盒直接扩增鼠耳样本,比较靶标扩增的产量和特异性。

图 28.直接对鼠耳进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum Direct PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量的从鼠耳中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.3 kb、0.5 kb、1.1 kb、2.2 kb、2.9 kb、3.6 kb 和 5.5 kb)。同时使用其它同类直接 PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接PCR试剂盒对人类唾液样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

Comparison of direct PCR products from human saliva samples generated by various commercial master mixes

图 29.直接对人类唾液进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量的从人类唾液中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.2 kb、0.8 kb、2 kb、4.5 kb 和 7.5 kb)。同时使用同类直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接PCR试剂盒对人类血液样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

使用商业直接PCR试剂盒对人类细胞系进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

使用商业直接PCR试剂盒对小鼠肾脏 FFPE 样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

图 32.直接对 FFPE 样本进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(左边泳道)可高特异性、高产量的从小鼠肾脏 FFPE 切片中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.1 kb、0.2 kb、0.3 kb、0.5 kb 和 1 kb)。同时使用2.7市售其他直接PCR试剂盒扩增了相同的靶标。NTC 代表无模板对照,所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder。请注意,FFPE DNA 通常是片段化的,样本质量决定了难以扩增大于 0.3 kb 的片段。

使用商业化直接 PCR 试剂盒,对烟草叶片样本(图 26)和烟草种子样本(图 27)进行检测,比较目标片段的扩增产量和特异性。

图 26.对烟草叶片进行稳定的直接 DNA 扩增。使用直接方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量地从烟叶中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.15 kb、0.6 kb、0.75 kb、1.6 kb 和 2.2 kb)。同时使用市售同类直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

图 27.对烟草种子进行稳定的直接 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量地从烟草种子中直接扩增一系列不同大小地DNA片段(0.15 kb、0.6 kb、1.6 kb 和 2.2 kb)。同时使用市售同类其它直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接 PCR 试剂盒直接扩增鼠耳样本,比较靶标扩增的产量和特异性。

图 28.直接对鼠耳进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum Direct PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量的从鼠耳中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.3 kb、0.5 kb、1.1 kb、2.2 kb、2.9 kb、3.6 kb 和 5.5 kb)。同时使用其它同类直接 PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接PCR试剂盒对人类唾液样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

Comparison of direct PCR products from human saliva samples generated by various commercial master mixes

图 29.直接对人类唾液进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(最左边泳道)可高特异性、高产量的从人类唾液中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.2 kb、0.8 kb、2 kb、4.5 kb 和 7.5 kb)。同时使用同类直接PCR 试剂盒扩增相同的靶标。所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder

使用商业直接PCR试剂盒对人类血液样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

使用商业直接PCR试剂盒对人类细胞系进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

使用商业直接PCR试剂盒对小鼠肾脏 FFPE 样本进行直接PCR扩增,比较靶标扩增的产量和特异性。

图 32.直接对 FFPE 样本进行强劲的 DNA 扩增。使用裂解方案,Platinum直接 PCR 通用预混液(左边泳道)可高特异性、高产量的从小鼠肾脏 FFPE 切片中直接扩增一系列不同大小的DNA片段(0.1 kb、0.2 kb、0.3 kb、0.5 kb 和 1 kb)。同时使用2.7市售其他直接PCR试剂盒扩增了相同的靶标。NTC 代表无模板对照,所用分子量标准(M)为 TrackIt 1 Kb Plus DNA Ladder。请注意,FFPE DNA 通常是片段化的,样本质量决定了难以扩增大于 0.3 kb 的片段。


Platinum 直接 PCR 通用预混液:文献引用

Invitrogen Platinum 直接 PCR 通用预混液已被应用于多个研究领域,并在同行评审出版物中的引用数量持续增长。

研究领域使用方法参考文献
农业扩增植物/真菌样本,通过琼脂糖凝胶电泳和 NGS 进行检测。Basiru S, Ait Si Mhand K, Elfermi R et al. (2024) Enhancing chickpea growth through arbuscular mycorrhizal fungus inoculation: facilitating nutrient uptake and shifting potential pathogenic fungal communities. Mycorrhiza 35(1):1. doi: 10.1007/s00572-024-01174-4 PMID: 39656243
农业从单只果蝇的腿部扩增 DNA,结果经琼脂糖凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Sollazzo G, Nikolouli K, Gouvi G et al. (2024) Deep orange gene editing triggers temperature-sensitive lethal phenotypes in Ceratitis capitata. BMC Biotechnol 24(1):7. doi: 10.1186/s12896-024-00832-x PMID: 38302991
农业扩增病毒样本,通过琼脂糖凝胶电泳进行检测。Dhandapani G, Nguyen VG, Kim MC et al. (2023) Magnetic-bead-based DNA-capture-assisted real-time polymerase chain reaction and recombinase polymerase amplification for the detection of African swine fever virus. Arch Virol 168(1):21. doi: 10.1007/s00705-022-05681-7 PMID: 36593422
生态学对小块鱿鱼组织进行 PCR,PCR 产物经 8% 聚丙烯酰胺凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Azad KN, Alam MNE, Nagata M et al. (2024) Males conditionally inseminate at three female body locations according to female mating history and female maturity status in a squid. Sci Rep 14(1):11702. doi: 10.1038/s41598-024-62062-7 PMID: 38777827
生态学扩增真菌 DNA 用于测序。Sauliutė G, Makaras T, Pažusienė J et al. (2023) A comparative analysis of multi-biomarker responses to environmental stress: Evaluating differences in landfill leachate and pathogenic oomycete effects between wild and captive Salmo trutta. Sci Total Environ 897:165420. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.165420 PMID: 37433333
生态学从难处理样本(地衣、蓝细菌菌株、钙化鞘、生物膜、砂砾结皮 - 生物结皮)中扩增 DNA,样本经琼脂糖凝胶电泳分析,PCR 产物通过 Sanger 测序。Jung P, Briegel-Williams L, Werner L et al. (2024) A direct PCR approach with low-biomass insert opens new horizons for molecular sciences on cryptogam communities. Appl Environ Microbiol 90(3):e0002424. doi: 10.1128/aem.00024-24 PMID: 38349146
生态学从植物中扩增 DNA,PCR 产物用于构建 NGS 文库。Radouane N, Errafii K, Mouhib S et al. (2024) Potential plant-to-plant transmission: shared endophytic bacterial community between Ziziphus lotus and its parasite Cuscuta epithymum. Microb Ecol 87(1):119. doi: 10.1007/s00248-024-02421-z PMID: 39340548
生态学从菌根真菌中扩增 DNA,结果经琼脂糖凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Lahrach Z, Legeay J, Ahmed B et al. (2024) The composition of the arbuscular mycorrhizal fungal bacteriome is species dependent. Environ Microbiome 19(1):77. doi: 10.1186/s40793-024-00623-z PMID: 39415218
研究领域使用方法参考文献
心脏病学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Liu S, Wu J, Banerjee O et al. (2025) Big data analytics and scRNA-seq in human aortic aneurysms and dissections: role of endothelial MerTK. Theranostics 15(1):202–215. doi: 10.7150/thno.103851 PMID: 39744231
心脏病学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Karatsai O, Lehka L, Wojton D et al. (2023) Unconventional myosin VI in the heart: Involvement in cardiac dysfunction progressing with age. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 1869(6):166748. doi: 10.1016/j.bbadis.2023.166748 PMID: 37169038
神经科学对小鼠胚胎分离组织进行基因型检测。Abad C, Robayo MC, Muñiz-Moreno MDM et al. (2024) Gatad2b, associated with the neurodevelopmental syndrome GAND, plays a critical role in neurodevelopment and cortical patterning. Transl Psychiatry 14(1):33. doi: 10.1038/s41398-023-02678-x PMID: 38238293
神经科学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Kokotos AC, Antoniazzi AM, Unda SR et al. (2024) Phosphoglycerate kinase is a central leverage point in Parkinson's disease-driven neuronal metabolic deficits. Sci Adv 10(34):eadn6016. doi: 10.1126/sciadv.adn6016 PMID: 39167658
神经科学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Chen M, Wang Y, Dalal R et al. (2024) Alternative oxidase blunts pseudohypoxia and photoreceptor degeneration due to RPE mitochondrial dysfunction. Proc Natl Acad Sci U S A 121(25):e2402384121. doi: 10.1073/pnas.2402384121 PMID: 38865272
神经科学,干细胞用于神经祖细胞(NPC);扩增的 DNA 通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。Luo Z, Zhuang K, Kim SJ et al. (2024) Longitudinal magnetic resonance imaging tracking of transplanted neural progenitor cells in the spinal cord utilizing the bright-ferritin mechanism. Stem Cells Transl Med 13(6):546–558. doi: 10.1093/stcltm/szae016 PMID: 38457239
研究领域使用方法参考文献
法医学从口腔拭子中扩增 DNA 用于文库构建。Casanova-Adán L, Mosquera-Miguel A, González-Bao J et al. (2023) Adapting an established Ampliseq microhaplotype panel to nanopore sequencing through direct PCR. Forensic Sci Int Genet 67:102937. doi: 10.1016/j.fsigen.2023.102937
PMID: 37812882
免疫学对转基因小鼠进行基因分型。Dacheux MA, Norman DD, Shin Y et al. (2024) Deleting autotaxin in LysM+ myeloid cells impairs innate tumor immunity in models of metastatic melanoma. iScience 27(10):110971. doi: 10.1016/j.isci.2024.110971
PMID: 39398245
传染性疾病从血液中扩增 DNA,结果通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。Zealiyas K, Teshome S, Haile AF et al. (2023) Genotype characterization of Epstein-Barr virus among adults living with human immunodeficiency virus in Ethiopia. Front Microbiol 14:1270824. doi: 10.3389/fmicb.2023.1270824
PMID: 38029140
微生物学直接对海水样本进行 PCR 以研究海洋细菌群落,PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳分析并进行测序(NGS)。Stojan I, Trumbić Ž, Lepen Pleić I et al. (2023) Evaluation of DNA extraction methods and direct PCR in metabarcoding of mock and marine bacterial communities. Front Microbiol 14:1151907. doi: 10.3389/fmicb.2023.1151907
PMID: 37138601
研究领域使用方法参考文献
农业扩增植物/真菌样本,通过琼脂糖凝胶电泳和 NGS 进行检测。Basiru S, Ait Si Mhand K, Elfermi R et al. (2024) Enhancing chickpea growth through arbuscular mycorrhizal fungus inoculation: facilitating nutrient uptake and shifting potential pathogenic fungal communities. Mycorrhiza 35(1):1. doi: 10.1007/s00572-024-01174-4 PMID: 39656243
农业从单只果蝇的腿部扩增 DNA,结果经琼脂糖凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Sollazzo G, Nikolouli K, Gouvi G et al. (2024) Deep orange gene editing triggers temperature-sensitive lethal phenotypes in Ceratitis capitata. BMC Biotechnol 24(1):7. doi: 10.1186/s12896-024-00832-x PMID: 38302991
农业扩增病毒样本,通过琼脂糖凝胶电泳进行检测。Dhandapani G, Nguyen VG, Kim MC et al. (2023) Magnetic-bead-based DNA-capture-assisted real-time polymerase chain reaction and recombinase polymerase amplification for the detection of African swine fever virus. Arch Virol 168(1):21. doi: 10.1007/s00705-022-05681-7 PMID: 36593422
生态学对小块鱿鱼组织进行 PCR,PCR 产物经 8% 聚丙烯酰胺凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Azad KN, Alam MNE, Nagata M et al. (2024) Males conditionally inseminate at three female body locations according to female mating history and female maturity status in a squid. Sci Rep 14(1):11702. doi: 10.1038/s41598-024-62062-7 PMID: 38777827
生态学扩增真菌 DNA 用于测序。Sauliutė G, Makaras T, Pažusienė J et al. (2023) A comparative analysis of multi-biomarker responses to environmental stress: Evaluating differences in landfill leachate and pathogenic oomycete effects between wild and captive Salmo trutta. Sci Total Environ 897:165420. doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.165420 PMID: 37433333
生态学从难处理样本(地衣、蓝细菌菌株、钙化鞘、生物膜、砂砾结皮 - 生物结皮)中扩增 DNA,样本经琼脂糖凝胶电泳分析,PCR 产物通过 Sanger 测序。Jung P, Briegel-Williams L, Werner L et al. (2024) A direct PCR approach with low-biomass insert opens new horizons for molecular sciences on cryptogam communities. Appl Environ Microbiol 90(3):e0002424. doi: 10.1128/aem.00024-24 PMID: 38349146
生态学从植物中扩增 DNA,PCR 产物用于构建 NGS 文库。Radouane N, Errafii K, Mouhib S et al. (2024) Potential plant-to-plant transmission: shared endophytic bacterial community between Ziziphus lotus and its parasite Cuscuta epithymum. Microb Ecol 87(1):119. doi: 10.1007/s00248-024-02421-z PMID: 39340548
生态学从菌根真菌中扩增 DNA,结果经琼脂糖凝胶电泳分析后进行 Sanger 测序。Lahrach Z, Legeay J, Ahmed B et al. (2024) The composition of the arbuscular mycorrhizal fungal bacteriome is species dependent. Environ Microbiome 19(1):77. doi: 10.1186/s40793-024-00623-z PMID: 39415218
研究领域使用方法参考文献
心脏病学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Liu S, Wu J, Banerjee O et al. (2025) Big data analytics and scRNA-seq in human aortic aneurysms and dissections: role of endothelial MerTK. Theranostics 15(1):202–215. doi: 10.7150/thno.103851 PMID: 39744231
心脏病学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Karatsai O, Lehka L, Wojton D et al. (2023) Unconventional myosin VI in the heart: Involvement in cardiac dysfunction progressing with age. Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis 1869(6):166748. doi: 10.1016/j.bbadis.2023.166748 PMID: 37169038
神经科学对小鼠胚胎分离组织进行基因型检测。Abad C, Robayo MC, Muñiz-Moreno MDM et al. (2024) Gatad2b, associated with the neurodevelopmental syndrome GAND, plays a critical role in neurodevelopment and cortical patterning. Transl Psychiatry 14(1):33. doi: 10.1038/s41398-023-02678-x PMID: 38238293
神经科学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Kokotos AC, Antoniazzi AM, Unda SR et al. (2024) Phosphoglycerate kinase is a central leverage point in Parkinson's disease-driven neuronal metabolic deficits. Sci Adv 10(34):eadn6016. doi: 10.1126/sciadv.adn6016 PMID: 39167658
神经科学通过尾尖样本进行转基因小鼠基因型分析。Chen M, Wang Y, Dalal R et al. (2024) Alternative oxidase blunts pseudohypoxia and photoreceptor degeneration due to RPE mitochondrial dysfunction. Proc Natl Acad Sci U S A 121(25):e2402384121. doi: 10.1073/pnas.2402384121 PMID: 38865272
神经科学,干细胞用于神经祖细胞(NPC);扩增的 DNA 通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。Luo Z, Zhuang K, Kim SJ et al. (2024) Longitudinal magnetic resonance imaging tracking of transplanted neural progenitor cells in the spinal cord utilizing the bright-ferritin mechanism. Stem Cells Transl Med 13(6):546–558. doi: 10.1093/stcltm/szae016 PMID: 38457239
研究领域使用方法参考文献
法医学从口腔拭子中扩增 DNA 用于文库构建。Casanova-Adán L, Mosquera-Miguel A, González-Bao J et al. (2023) Adapting an established Ampliseq microhaplotype panel to nanopore sequencing through direct PCR. Forensic Sci Int Genet 67:102937. doi: 10.1016/j.fsigen.2023.102937
PMID: 37812882
免疫学对转基因小鼠进行基因分型。Dacheux MA, Norman DD, Shin Y et al. (2024) Deleting autotaxin in LysM+ myeloid cells impairs innate tumor immunity in models of metastatic melanoma. iScience 27(10):110971. doi: 10.1016/j.isci.2024.110971
PMID: 39398245
传染性疾病从血液中扩增 DNA,结果通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。Zealiyas K, Teshome S, Haile AF et al. (2023) Genotype characterization of Epstein-Barr virus among adults living with human immunodeficiency virus in Ethiopia. Front Microbiol 14:1270824. doi: 10.3389/fmicb.2023.1270824
PMID: 38029140
微生物学直接对海水样本进行 PCR 以研究海洋细菌群落,PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳分析并进行测序(NGS)。Stojan I, Trumbić Ž, Lepen Pleić I et al. (2023) Evaluation of DNA extraction methods and direct PCR in metabarcoding of mock and marine bacterial communities. Front Microbiol 14:1151907. doi: 10.3389/fmicb.2023.1151907
PMID: 37138601
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