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Ion AmpliSeq 微生物组健康科研试剂盒
具有成本效益的种属级微生物组分析
Ion AmpliSeq 微生物组健康科研试剂盒是基于下一代测序 (NGS) 检测的试剂盒，可以对人肠道微生物组中的微生物多样性进行全面分析，且具有成本效益。与传统的16S rRNA测序相比，这种新的检测方法提高了对与癌症相关的关键生物以及免疫和胃肠道(GI)疾病研究的物种水平检测的分辨率和特异性。
目前，大多数 16S 检测组合仅针对 16S rRNA 基因的 2-4 个高变 (HV) 区，Ion AmpliSeq 微生物组健康科研试剂盒中所含的检测组合则覆盖9个 HV 区中的8个，实现具有高灵敏性的微生物谱图全面分析。
完整的端到端解决方案结合改善种属级鉴定的一系列高分辨率标记物以及完全集成的数据分析工具，帮助您简化研究（图1）。
图1.使用 Ion AmpliSeq 微生物组健康研究试剂盒的工作流程
- 靶向测序——全面的检测内容，在物种水平的标准阈值上拥有 100% 种属级灵敏度和特异性
- Panel覆盖9个 HV 区域中8个——较全面的 16S rRNA 基因检测Panel
- 种属级分辨率——检测与免疫肿瘤学以及免疫学和胃肠道疾病研究相关的73种关键细菌种属
鸟枪法宏基因组的功能分辨率较高，但成本较高且耗时长。Ion AmpliSeq 微生物组健康研究Panel为免疫肿瘤学和主要肠道相关疾病以及自体免疫疾病研究提供了一种具有种属级特异性和成本效益的解决方案（图2）
点击图片以放大图2.堆叠的条形图和相对丰度表显示出在物种层面的高灵敏度。
16S 检测Panel以及精选种属特异性检测组合均具有 100% 特异性和灵敏度。使用粪便样品，我们证明了批间实验重复性高（图3）。
点击图片以放大图3.粪便样品中的样品内丰度鉴别显示 16S 和种属级有高相关性。
最近，SARS-CoV-2病毒凸显了共生肠道微生物群对感染及其感染严重程度的潜在影响。 许多研究均发现肠道失调对 SARS-CoV-2 感染的潜在影响以及主要种属的多样性和丰度如何在疫苗研究和疗效方面发挥作用。 利用Ion AmpliSeq微生物组健康科研试剂盒的靶向NGS是一种了解和表征微生物对SARS-CoV-2感染的中介作用以及免疫健康和治疗研究的简单而有针对性的工具。
Ion AmpliSeq 微生物组健康科研试剂盒通过推出 Ion Reporter 软件 5.14 提供完整的端到端解决方案。 此分析工具通过 16S rRNA 基因和靶向种属特异性扩增子来检测细菌种属，从而协同补充试剂盒作用。Ion Reporter 软件对与人类健康相关的关键微生物进行完整的分类学分析以及物种级别的解析。 使用包括 SILVA 在内的多种常见参考数据库并利用 QIIME2 功能可以进行单样品和多样品比较。
微生物组视频
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新 Ion AmpliSeq 微生物组健康科研试剂盒简介——高分辨率种属级微生物组谱图分析 ›
参考文献
1.Routy B, et al.肠道微生物群影响基于pd -1的上皮肿瘤免疫治疗的疗效。科学2018 Jan 5;359(6371):91-97.
2.Matson V, Fessler J, Bao R, Chongsuwat T, Zha Y, Alegre ML, Luke JJ, Gajewski TF.共生菌群与转移性黑色素瘤患者抗PD -1疗效相关。科学2018 Jan 5;359(6371):104-108.
3.Gopalakrishnan V, et al.肠道菌群调节黑色素瘤患者对抗pd -1免疫治疗的反应。科学2018 Jan 5;359(6371):97-103.
微生物组健康资源
仅供科研使用，不可用于诊断目的。